【佳學(xué)基因檢測(cè)】SAMD9基因檢測(cè)
SAMD9的功能：
SAMD9是一個(gè)與SAMD9L同源的高度保守基因，與它的同源基因具有共同的基因結(jié)構(gòu)，兩個(gè)基因編碼的蛋白質(zhì)具有58%的氨基酸同源性。大多數(shù)哺乳動(dòng)物都有Samd9和Samd9l。然而，小鼠只有Samd9l，而奶牛只編碼Samd9，這表明這些基因部分互補(bǔ)了彼此的功能。SAMD9和SAMD9L一樣，參與控制細(xì)胞增殖，并在某些癌癥中起到腫瘤抑制作用。已知SAMD9基因的有害突變可導(dǎo)致正常血球型家族性腫瘤性鈣沉積（NFTC），這是一種罕見(jiàn)的常染色體隱性疾病。NFTC的特征是皮膚和牙齦的異常炎癥，這是由干擾素途徑的過(guò)度信號(hào)引起的。與此一致，SAMD9的功能受到干擾素-γ的嚴(yán)格調(diào)節(jié)。
SAMD9突變導(dǎo)致海市蜃樓綜合征
賊近的研究已經(jīng)在患有脊髓發(fā)育不良、感染、生長(zhǎng)受限、腎上腺發(fā)育不良、生殖器表型和腸病的兒童中發(fā)現(xiàn)SAMD9突變，命名為幻影綜合征（OMIM#617053）。在賊初的報(bào)告中，大多數(shù)受影響的兒童在兒童早期死亡，但兩名壽命延長(zhǎng)的個(gè)體出現(xiàn)了單體7型MDS，導(dǎo)致突變SAMD9等位基因丟失。賊近的一項(xiàng)研究還報(bào)告說(shuō)，在7名有親代DNA的幻影兒童中，突變是從頭發(fā)生的，位于高度保守的殘基中，通常影響精氨酸（8個(gè)中的6個(gè)），一半的突變聚集在SAMD9的982和983密碼子熱點(diǎn)。因此，結(jié)論是，海市蜃樓綜合征背后的SAMD9突變是GOF，對(duì)細(xì)胞生長(zhǎng)的負(fù)面影響給細(xì)胞帶來(lái)選擇壓力，使其失去突變拷貝。此外，這表明這些基因同源物的功能非常相似。然而，除了相似的血液學(xué)表型外，尚不清楚為什么SAMD9L突變導(dǎo)致小腦萎縮，而SAMD9突變與復(fù)雜的多器官缺陷相關(guān)。我們假設(shè)SAMD9相關(guān)疾病中可能的神經(jīng)表現(xiàn)可能一直未被注意到，因?yàn)榇蠖鄶?shù)患者在神經(jīng)系統(tǒng)尚不成熟且輕度平衡問(wèn)題或視覺(jué)問(wèn)題不明顯的情況下，在很小的年齡就死亡了。
Buonocore等人描述了八名幻影患者，其中六名兒童患有宮內(nèi)生長(zhǎng)受限和嚴(yán)重睪丸功能障礙，導(dǎo)致女性外生殖器，而其余兩名兒童患有非典型外生殖器（圖。1b及?和2）2）[28]。迄今確認(rèn)的19例新發(fā)幻影患者中，大多數(shù)在病史中有骨髓衰竭（各種細(xì)胞減少）和感染的跡象。總共有四名兒童的壽命更長(zhǎng)，并出現(xiàn)了7號(hào)染色體畸變的MDS。引人注目的是，在進(jìn)行細(xì)胞遺傳學(xué)檢查的三名非MDS患者中，造血細(xì)胞顯示了7號(hào)染色體的某種形式的畸變，即單體7或7q-。這三名患者的初始VAF約為50%，但在隨后的樣本中顯示出較低的VAF，這表明由于單體7或7q-而失去GOF SAMD9突變的克隆的擴(kuò)增。這些患者沒(méi)有發(fā)生MDS的原因可能與時(shí)間有關(guān)，因?yàn)樗麄兌荚?-21個(gè)月大時(shí)死亡。與ATXPC中GOF SAMD9L突變的觀察結(jié)果類似，GOF SAMD9突變也被其他遺傳機(jī)制逆轉(zhuǎn)，如幻影綜合征患者（包括非顯性造血表型患者）血液中的移碼或停止增益突變（圖3）。
遺傳性SAMD9突變導(dǎo)致輕度表型
Schwartz等人賊近發(fā)現(xiàn)了一個(gè)具有遺傳性SAMD9突變的家族，其中三名兒童在早期發(fā)展為單體7型MDS。雖然母親有效不受MDS和遺傳逆轉(zhuǎn)的影響，但所有三個(gè)孩子都通過(guò)不同的機(jī)制在血液中表現(xiàn)出克隆性體細(xì)胞逆轉(zhuǎn)。一名受影響的兒童有7號(hào)染色體的CN-LOH和同時(shí)發(fā)生的單體7，而另外兩名兒童有單體7以及SAMD9的順式突變，主張通過(guò)這兩種機(jī)制中和生殖系GOF變體。
只能推測(cè)，新發(fā)和家族性SAMD9突變之間的差異在于GOF的嚴(yán)重程度。較弱的GOF變異可能是可耐受的，而較嚴(yán)重的GOF變異只能因胚胎致死性而從頭發(fā)生，或因伴隨的生殖器畸形導(dǎo)致不育而無(wú)法在人群中固定。然而，在報(bào)告的家族中，尚不清楚為什么母親沒(méi)有表現(xiàn)出任何表型，也沒(méi)有表現(xiàn)出任何遺傳逆轉(zhuǎn)。不幸的是，RNA不能用于檢測(cè)SAMD9的單等位基因或雙等位基因表達(dá)。
