【佳學基因檢測】高蛋氨酸血癥基因檢測
阻止遺傳病遺傳基因檢測導讀
來自青島的患兒做了高蛋氨酸血癥基因檢測?;颊?,女,漢族,入院治療時為出生后12 天,系第1胎第1產(chǎn)。因新生兒疾病篩查異常提示高蛋氨酸血癥入院?;純河谔g40+3周剖宮產(chǎn)出生,出生時體重4 580 g,身長52 cm,1分鐘和5分鐘Apgar評分均為9分,出生情況無異常。串者母26歲,孕期各項檢查均未發(fā)現(xiàn)異常?;純撼錾? 天后家屬自愿接受新生兒疾病篩查以排除29種遺傳代謝疾病,初步篩查結果異常。遂將患兒召回行進一步檢查并進行基因檢測。
入院體格檢查:患兒吃奶好,無青紫、氣促,無驚厥,無嘔吐、腹脹,大小便正常;神志清,精神反應好;口唇紅,面色紅黃,皮膚微黃染,無皮疹、出血點;全身淋巴結無腫大;前囟平軟,大小為1.5 cm;兩側瞳孔等大等圓,對光反射靈敏;頸軟,胸廓兩側對稱;呼吸45次/min,兩肺呼吸音清;臍帶干燥、未脫;腹軟,肝脾無腫大,腸鳴音正常;四肢肌張力正常,生理反射正常。
按新生兒疾病篩查常規(guī),患兒出生后72 h、充分哺乳6次后,足跟采集血斑進行新生兒遺傳代謝病篩查。結果顯示,促甲狀腺激素(TSH)為4.46 U/mL,苯丙氨酸(Phe)為0.807 mg/dL,17α-羥孕酮(17-OHP)為3.38 nmol/L,均未見異常。串聯(lián)質譜初次篩查發(fā)現(xiàn)蛋氨酸(Met)為101 µmol/L(參考值:8.0~55.0 µmol/L),Met/Phe比值為2.29(參考值:0.16~1)。于出生后12 d召回重新采集血樣進行復查,結果顯示Met 152 µmol/L,Met/Phe比值4.48,疑似“高蛋氨酸癥”。血常規(guī)、肝功能未見明顯異常。
基因檢測分析:在監(jiān)護人知情同意下采集患兒及患兒父母外周血2 mL,根據(jù)致病基因鑒定基因解碼分析流程文獻方法,對目的基因(常見的高蛋氨酸癥致病基因MAT1A、GNMT、ADK、AHCY)進行擴增、文庫擴建、NGS測序、數(shù)據(jù)分析。賊后對這些變異位點進行功能注釋并通過Sanger一代測序驗證。經(jīng)基因檢測,發(fā)現(xiàn)該患兒MAT1A基因存在1個錯義突變:c.791G > A(p.R264H)(圖 1A),為雜合突變,經(jīng)人類基因突變數(shù)據(jù)庫(HGMD)查詢,其ID為CM970910,呈顯性遺傳,可導致高甲硫氨酸血癥。其他常見高高蛋氨酸血癥致病基因GNMT、ADK、AHCY經(jīng)測序檢測未發(fā)現(xiàn)可疑致病性突變。對患兒及其父母進行Sanger測序驗證發(fā)現(xiàn),其父親攜帶了與患兒相同的錯義突變(圖 1B),表明患兒突變來源于其父親。對其父親做了串聯(lián)質譜的檢查,其父串聯(lián)檢測正常,血漿Met濃度正常(47 µmol/L)。
A:患兒MAT1A基因存在c.791G > A錯義突變;B:患兒父親攜帶了該錯義突變。箭頭所示為突變位點。
治療隨訪:按文獻報道方案,根據(jù)患兒血漿Met濃度確定治療方案(若血漿Met濃度超過300~350 µmol/L才給予特殊飲食及藥物治療),并常規(guī)隨訪,檢測血漿Met濃度。本例患兒血漿Met濃度為152 µmol/L,因此未給予特殊飲食治療?;純?周歲體檢時體格發(fā)育及智力發(fā)育正常,血漿Met濃度為77 µmol/L,較前幾次檢測稍有下降。
高蛋氨酸血癥基因檢測討論
串聯(lián)質譜技術可實現(xiàn)同時進行數(shù)十種代謝物分析,檢測出包括氨基酸、有機酸、脂肪酸氧化代謝紊亂在內的多種遺傳代謝性疾病。本例患兒通過串聯(lián)質譜技術初篩賊終確診為高氨酸血癥。原發(fā)性高蛋氨酸血癥可由導致蛋氨酸腺苷轉移酶Ⅰ/Ⅲ缺乏的相關基因(MAT1A、GNMT、AHCY等)突變引起,這些突變基因有的表現(xiàn)為隱性遺傳,有的表現(xiàn)為顯性遺傳。本例患兒僅檢測出1個致病位點(MAT1A基因R264H突變),該突變位點為顯性突變位點。高蛋氨酸血癥的發(fā)現(xiàn)一般都是通過新生兒串聯(lián)質譜篩查提示血片中Met含量異常增高,經(jīng)召回后通過致病基因鑒定基因解碼確認診斷。
高蛋氨酸血癥的報道甚少,關于其發(fā)病率也有較大差異。Chien等報道在1701591位中國臺灣人群中確診16例單純型高蛋氨酸血癥,發(fā)病率為1/106349,其中8例為MAT1A基因突變。Couce等報道西班牙人群中高蛋氨酸血癥發(fā)病率約為1/23469,所報道的6例患者中5例為MAT1A基因缺陷。Nagao等報道日本人群發(fā)病率為1/107850。
高蛋氨酸血癥與基因突變導致的遺傳關系備受關注,目前已知有6種基因序列突變因素可導致蛋氨酸異常,包括甲硫氨酸腺苷轉移酶(MATⅠ/Ⅲ)、胱硫醚合成酶(CBS)、甘氨酸N-甲基轉移酶缺陷(GNMT)、S-腺苷高半胱氨酸水解酶、Citrin缺乏癥和延胡索酰乙酰乙酸水解酶(FAH)。其中以MATⅠ與Ⅲ兩種異構體缺陷賊為多見,其編碼基因為MAT1A,定位于人類10q23.1。高蛋氨酸血癥基因檢測報道的這例高蛋氨酸血癥確診患兒即MAT1A基因存在錯義突變。迄今為止,國內外已報道該基因15種突變,大多為錯義突變,普遍認為突變的方式不僅有地區(qū)、種族的差異,而且與疾病的臨床表現(xiàn)、疾病程度、治療方案都有一定關系。因此,明確病例基因突變類別極為必要。本例患兒的突變?yōu)镽264H,體外研究發(fā)現(xiàn)第264位氨基酸殘基參與亞單位聚合之間鹽橋的形成,R264H突發(fā)的顯性效應是通過影響R264/R264H二聚體形成從而降低酶的活性。Chien等新穎報道的中國臺灣人群中MAT1A基因以P357L突變賊為多見,3例為R264H突變。隨后更新串聯(lián)質譜技術篩查新確診的11例患兒中5例為R264H突變。Couce等報道的5例西班牙人群高蛋氨酸血癥均為R264H突變。因此,R264H突變可能是較為常見的突變類型,但中國大陸尚未有高蛋氨酸血癥R264H突變的報道。
單純性高蛋氨酸血癥是否應當常規(guī)進行飲食控制治療存在爭議。然而國內外專家普遍認為,對于MAT1A基因缺陷引起的高蛋氨酸血癥一般臨床預后良好,特別是R264H突變。本例確診患兒未進行特殊治療,定期復查血漿Met水平,目前患兒生長發(fā)育良好。