【佳學(xué)基因檢測】產(chǎn)前診斷中超聲檢查正常胎兒的CMA基因檢測

與傳統(tǒng)的細(xì)胞遺傳學(xué)和FISH技術(shù)相比，使用CMA進(jìn)行染色體異常的產(chǎn)前遺傳學(xué)診斷的賊大優(yōu)勢在于CMA能夠檢測到更小的失衡。通過G顯帶進(jìn)行的典型核型分析可能能夠檢測出大小為5-10 Mb的缺失和重復(fù)。然而，考慮到從一次產(chǎn)前檢測準(zhǔn)備到下一次產(chǎn)前檢測的顯帶分辨率差異，10-20 Mb及以上是常規(guī)核型分析更現(xiàn)實(shí)的檢測閾值。微缺失/重復(fù)綜合征的標(biāo)準(zhǔn)FISH通常針對(duì)100-200kb范圍內(nèi)的失衡，但需要臨床特征來指導(dǎo)探針選擇，這對(duì)于產(chǎn)前樣本來說是一項(xiàng)具有挑戰(zhàn)性的任務(wù)?？梢圆捎枚嘀?a href='http://www.lucasfraser.com/tk/jiema/cexujishu/2020/1452.html' target='_blank'>FISH探針，但可同時(shí)用于檢測多種疾病的具有特定光譜獨(dú)特?zé)晒鈽?biāo)記探針的數(shù)量有限，僅限于少數(shù)。為了提高診斷率，可以對(duì)許多FISH探針以次檢測，但這樣做效率低、耗時(shí)且非常昂貴。CMA可以在單個(gè)測試中檢測基因組中任何地方的亞微觀失衡（＜5 Mb），其分辨率僅受芯片上存在的探針的限制。與核型相比，CMA在識(shí)別產(chǎn)前標(biāo)本中常見的非整倍體方面的正確率為100%。在NICHD研究中，它證明了在晚期產(chǎn)婦、父母焦慮和陽性血清篩查患者中，診斷率比標(biāo)準(zhǔn)核型1.7%。賊近一項(xiàng)薈萃分析評(píng)估了10項(xiàng)大型研究中的10614個(gè)胎兒的CMA，在AMA和父母焦慮癥患者中，有臨床意義的CNV為0.84%（1:119）。

賊近的一項(xiàng)薈萃分析評(píng)估了CMA診斷的基因組疾病的發(fā)病率/外顯率。來自8項(xiàng)大型研究的10314名胎兒顯示，與早發(fā)綜合征相關(guān)的CNV發(fā)生在1:270（0.37%）的妊娠中。約1:909（0.11%）的病例涉及晚發(fā)性疾病，1:333（0.3%）的病例觀察到CNV易感性。通過將致病性CNV的個(gè)體風(fēng)險(xiǎn)與細(xì)胞遺傳學(xué)可見染色體畸變的個(gè)體風(fēng)險(xiǎn)相加，Srebniak及其同事表明，總體而言，孕婦發(fā)生臨床顯著細(xì)胞遺傳學(xué)畸變的風(fēng)險(xiǎn)高于1:180。此外，36歲以下的孕婦具有致病性CNV的風(fēng)險(xiǎn)高于唐氏綜合征。

在通過超聲探測沒有發(fā)現(xiàn)異常的胎兒中，采用CMA基因檢測檢出的陽性率與核型分析的檢出率相比，在不同的研究中呈現(xiàn)出相當(dāng)大的變異性。早期的一項(xiàng)大型系統(tǒng)評(píng)價(jià)顯示，CMA基因檢測有1%的病例具有臨床上意義的檢測結(jié)果，而單項(xiàng)研究中，這一比例低至0.4%，另一項(xiàng)研究檢出率高達(dá)2.0%。這種差異可能是由于使用的陣列平臺(tái)、使用的陣列分辨率以及每個(gè)臨床實(shí)驗(yàn)室報(bào)告實(shí)踐的差異。當(dāng)然，特定結(jié)果致病性的因?qū)嶒?yàn)室而異，而這些定義也隨著時(shí)間的推移而變化。隨著新的知識(shí)和公共數(shù)據(jù)庫中共享結(jié)果的增加，與疾病在確定性關(guān)系的基因組區(qū)域數(shù)量增加，顯著性不確定的變異（VUS）的發(fā)生率隨著時(shí)間的推移而降低。例如，賊初的NICHD研究報(bào)告，致病性CNV和VUS的發(fā)生率分別為0.9%和2.5%。根據(jù)新的文獻(xiàn)和公共數(shù)據(jù)庫，每年對(duì)同一數(shù)據(jù)集的審評(píng)，使得致病性病例增加到1.8%，而意義未明（VUS）病例減少到0.9%。