【基因檢測案例】卵巢早衰7型致病基因鑒定基因解碼及其個性化的調理
遺傳病、罕見病基因檢測導讀:
女性的生育能力受多種因素的影響,卵巢早衰是其中的一大類疾病。一種生殖系統發(fā)育障礙的女性患者經過基因解碼發(fā)現是卵巢早衰7型,經過佳學基因解碼,不僅找到了疾病根源,同時也幫助了家里的其他人,為個性化治療提供了充分的使用方依據。
病情介紹
2019年8月15日,患者魯健芳(化名)經三甲醫(yī)院推薦來到佳學基因做致病基因鑒定基因解碼。根據病情描述,患者就診時46歲,出生時生殖器模糊不清,從小就被當做女性撫養(yǎng),但長期不育。她以前沒有做過手術。她在3歲經兒科醫(yī)生診斷發(fā)現有明顯的陰蒂肥大(2.5厘米長,1.1厘米寬),沒有可觸及的性腺。她的肛門生殖比為0.5,大陰唇呈皺紋狀。醫(yī)生懷疑是先天性腎上腺增生癥(CAH)。但是腎上腺激素和前體的基礎水平正常,刺激后水平正常。超聲和核磁共振成像發(fā)現子宮,長2.0×0.7×0.39厘米。可能有腹部性腺,卵圓形的性腺結構位于骨盆和腹股溝區(qū)的交界處,左側為0.81×0.69×0.6厘米,右側為1.1×0.7×0.6厘米。左側的結構至少包含兩個囊狀結構,可能是卵泡。生殖科大夫進一步檢查患者是否存在睪丸組織,測定AMH的濃度并進行hCG刺激試驗。AMH為6.48 ng/ml,基線血清總睪酮為2ng/dL(轉換系數為nmol/L:0.0347)。每天肌注hCG 1500單位刺激3天后,睪酮上升到38.9 ng/dL。說明體內存在睪丸激素生成組織,腹腔鏡檢查,發(fā)現雙側性腺結構似乎是卵睪結構。從兩個性腺切除睪丸樣物質,病理學顯示睪丸組織發(fā)育不良,沒有精子細胞。染色體分析未能發(fā)現病因,呈現出46,XX核型。
a:中倍放大,顯示睪丸樣組織存在生精小管;b:高倍方大后,顯示生精小管內沒有精子細胞
佳學基因致病基因鑒定基因解碼
患者在當地采用紫色EDTA抗凝采血管,由護士上門采集3ml血液。佳學基因未做疾病假設,進行全外顯子致病基因鑒定基因解碼,發(fā)現患者體內共存在89762個基因突變位點,其中在NR5A1中發(fā)現了一種極為罕見的錯義變異,NR5A1是一種與人體的性別發(fā)育有關的基因。患者體內存在c.275G>C,p.Arg92Pro。經過進一步分析,證明該基因是從先證者的父親遺傳而來的?;颊叩母赣H生育有兩個孩子。該突變在此之前,不存在于任何數據庫,此前在多個機構進行檢測,未找到明確的致病基因。經基因解碼表明,該突變影響了蛋白質的結構與功能是導致患者出現疾病征狀的致病基因突變。
致病基因來源分析
部分是患者的一代測序結果.C*是突變位點。患者出現了G>C突變。所示結果為非意義鏈的測序序列。
NR5A1長什么樣的?
NR5A1是一個蛋白質編碼基因,編碼核受體亞家族5組A成員1?;蛲蛔兛梢栽斐?6,Xy性反轉3型和46,Xx性反轉4型。通過參與多能干細胞的轉錄調節(jié)和醛固酮的合成和分泌發(fā)揮生理功能。為固醇類激素生成組織的形成和分化所必須(參考文獻:27378692),通過結合在類固醇激素合成基因P450基因(如CYP11A、CYP11B和CYP21B)啟動子區(qū)域的Ad4位點,從而調節(jié)其活性。調節(jié)AMH/Muellerian抑制物質基因以及AHCH和STAR基因。5'-YCAAGGYC-3'和5'-RRAGTCA-3'是NR5A1識別的一致序列(參考文獻:27378692). SFPQ-NONO-NR5A1復合物與CYP17啟動子結合,調節(jié)基礎轉錄活性和環(huán)磷酸腺苷依賴性轉錄活性。結合磷脂酰膽堿(相似)。與磷脂與磷脂酰肌醇(PI)頭群結合,特別是PI(3,4)P2和PI(3,4,5)P3。HIPK3激活NR5A1磷酸化,在cAMP信號通路刺激下,激素基因表達增加。佳學基因通過分析NR5A1基因突變后對分子結構與功能的影響,從而建立了基因解碼分析法,可以突破數據庫極限,實現更高的檢出率、更正確的檢測分析效果,下面是NR5A1的晶體結構圖,供參考。
NR5A1突變引起的疾病該怎么治療?
1、針對疾病發(fā)生的病理過程設計尋找治療藥物;
2、采用基因矯正后的干細胞治療可以產生良好的效果。
(責任編輯:佳學基因)