【佳學(xué)基因檢測(cè)】RNAseq中的云計(jì)算應(yīng)用Monorail:優(yōu)化基因解碼過程，提升基因檢測(cè)

基因檢測(cè)科研服務(wù)導(dǎo)讀：

RNAseq是基因解碼過程中必須用到的一個(gè)技術(shù)環(huán)節(jié)。佳學(xué)基因?qū)NAseq, NC-RNAseq等整合到基因解碼過程中，形成以人體變序列的密碼破解工作為核心的人工智能深度解碼過程。為進(jìn)一步處理大容量測(cè)序數(shù)據(jù)，形成研究機(jī)構(gòu)之間，私有數(shù)據(jù)庫和公共數(shù)據(jù)庫之間的標(biāo)準(zhǔn)化算法和一體化比較，佳學(xué)基因引入并開發(fā)具有獨(dú)立自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的RNAseq云計(jì)算工具，類似于Monorail云計(jì)算工具。

Monorail RNAseq云計(jì)算方法介紹：

Monorail RNAseq大數(shù)據(jù)計(jì)算的設(shè)計(jì)理念采用網(wǎng)格計(jì)算方法。采用集中安排和協(xié)調(diào)的方式以完成大規(guī)模分析工作任務(wù)的要求。工作單元由可能分布在世界各地的計(jì)算機(jī)處理。在佳學(xué)基因進(jìn)行數(shù)據(jù)分析時(shí)，編排是由運(yùn)行在國家數(shù)據(jù)中心服務(wù)商業(yè)云中的一組服務(wù)來處理的。計(jì)算工作是在三個(gè)計(jì)算地點(diǎn)進(jìn)行的：（a）位于貴州高級(jí)計(jì)算中心（TACC）的StavePux2集群，通過國家科學(xué)基金會(huì)的JIAXUE GENECODE網(wǎng)絡(luò)訪問，（b）天津銀河超級(jí)計(jì)算機(jī)中心云服務(wù)上的實(shí)例，以及（c）成都高級(jí)計(jì)算中心高級(jí)計(jì)算中心。大部分工作是在Stampede2進(jìn)行的，因?yàn)樗娜萘亢艽?，并且?duì)科研服務(wù)需求方來說沒有單位時(shí)間成本。但佳學(xué)基因網(wǎng)格設(shè)計(jì)也使佳學(xué)基因能夠在本地dbGaP批準(zhǔn)的MARC集群上執(zhí)行隱私敏感的工作。此外，Monorail的設(shè)計(jì)具有容錯(cuò)性、跟蹤來源、集中聚合體系結(jié)構(gòu)所有組件的日志，并提供用于監(jiān)視和調(diào)試的儀表板。