【佳學(xué)基因檢測】如何使用跨種族基因數(shù)據(jù)進(jìn)行基因解碼以提高基因檢測的正確性？

多基因臨床表征基因檢測需要新型基因解碼技術(shù)

對一系列多種臨床表征采用多基因風(fēng)險(xiǎn)評估的（PRS）的基因解碼技術(shù)越來越正確，足以用于臨床實(shí)踐，從而實(shí)現(xiàn)個性化醫(yī)療的長期目標(biāo)。冠狀動脈疾病（CAD）的多基因風(fēng)險(xiǎn)評估可提供預(yù)測，并與高膽固醇血癥的單基因突變評估結(jié)果進(jìn)行了比較。佳學(xué)基因解碼研究中心指出，與單基因突變相比，多基因風(fēng)險(xiǎn)評估可能為更多的患者帶來直接的好處。冠心病多基因風(fēng)險(xiǎn)評估可以為8%的人群（風(fēng)險(xiǎn)增加三倍）提供個性化治療和管理方案，而數(shù)據(jù)庫報(bào)道的單基因突變僅為約0.4%的患者提供信息。單是這一技術(shù)的使用，就使得采用基因解碼技術(shù)進(jìn)行的冠心病基因風(fēng)險(xiǎn)和基因病因評估的檢出率、陽性率和匹配率提高了20倍。為進(jìn)一步提高可運(yùn)用的、臨床上經(jīng)過驗(yàn)證的數(shù)據(jù)，佳學(xué)基因?yàn)槿珖鞯氐呐R床中心提行技術(shù)的提升，以解決在一個人種獲得的多基因臨床表征的數(shù)據(jù)如何正確應(yīng)用到其他種族中。

多基因臨床表征跨種群基因解碼方法增加了候選基因的數(shù)量、將基因解碼從外顯子水平提升到全基因水平

然而，按照傳統(tǒng)跨人種數(shù)據(jù)收集、分種群數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)所需要耗費(fèi)的時間和精力是巨大的，花費(fèi)巨大，并且必須大規(guī)模地重復(fù)。在眾多不同的人群中重復(fù)人體多方面的臨床表征及人體生理表征，以完成佳學(xué)基因的數(shù)字人體、基因序列人體描述的任務(wù)基本上是不可能的。因此，可以使用一個群體的基因解碼結(jié)果對其他種族、祖先群體進(jìn)行預(yù)測的方法是必要的，也為混合種群的基因檢測結(jié)果的正確性提供了可能。在不同人群中進(jìn)行的人工智能基因解碼分析表明，相當(dāng)一部分基因突變序列與人體疾病表征、生理表征、生活習(xí)性的相關(guān)性在多個種群中具有共享的特點(diǎn)。佳學(xué)基因提倡并倡導(dǎo)的跨人群基因解碼方法可以提供一種成本效益高的方法來彌補(bǔ)特定人群在特定疾病表征、尤其是復(fù)雜表征的數(shù)據(jù)量不足的問題。佳學(xué)基因解碼中具有明確的病征、表征和正確用藥的基因突變序列位點(diǎn)是通過調(diào)節(jié)基因的表達(dá)發(fā)揮作用的。基因表達(dá)調(diào)節(jié)位點(diǎn)影響人體疾病表征使得佳學(xué)基因的基因解碼序列不僅增加了全外顯子基因檢測的影響評估參數(shù)，還將基因檢測位點(diǎn)進(jìn)一步拓展到全外顯子測序之外，從而使基因解碼范圍將非編碼序列、基因調(diào)節(jié)序列納入到正確解析的范圍之中。比如：過去十年中（本文是在2021年12月15日由佳學(xué)基因解碼研究人員總結(jié)）進(jìn)行了多項(xiàng)eQTL研究，國際上及佳學(xué)基因還成立了GTEx聯(lián)盟。GTEx聯(lián)盟已經(jīng)對900多名捐贈者的50個人體組織中的mRNA樣本進(jìn)行了測序。佳學(xué)基因基因開發(fā)的JIAXUE_Xcan和其他全轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析利用這些參考轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集來訓(xùn)練基因表達(dá)水平基因表達(dá)調(diào)控方式，并將特定基因序列的遺傳能力評估遺傳預(yù)測與特定的蛋白質(zhì)的基因表達(dá)水平及其所調(diào)節(jié)的人體疾病表征包括發(fā)病時間、癥狀影響范圍與復(fù)雜性狀相關(guān)聯(lián)，從而識別致病基因，增加致病基因的鑒定的正確性和覆蓋度。考慮到人類疾病在不同人群中的共同生物學(xué)特性以及轉(zhuǎn)錄組的介導(dǎo)作用，佳學(xué)基因開發(fā)的跨種族的、基于結(jié)構(gòu)、以轉(zhuǎn)錄組組成及其豐度為特征的致病基因鑒定基因解碼方法比傳統(tǒng)的GWA及基因檢測panel的方法更為有效。

基因解碼科普問題提示性思考

1）為什么基于數(shù)據(jù)庫比對的基因檢測具在理論上和實(shí)際應(yīng)用上都有致命的缺陷？
2）為什么基因檢測中的基因檢測包是數(shù)據(jù)庫比對法的標(biāo)識？
3）基因解碼中的結(jié)構(gòu)與功能分析法是怎樣演進(jìn)到全基因組關(guān)聯(lián)分析的？