【佳學(xué)基因檢測】怎樣檢測白內(nèi)障基因？

怎樣檢測白內(nèi)障基因？

白內(nèi)障基因檢測的方法主要有基因測序法、基因芯片法和PCR法。各方法有不同的優(yōu)缺點(diǎn),綜合考慮檢測的全面性和正確性,白內(nèi)障基因檢測總結(jié)分析如下:

1. 基因測序法

通過對基因組DNA進(jìn)行高通量測序,可以檢測全部蛋白編碼區(qū)序列和調(diào)控序列,檢測范圍賊為全面。這種方法可以檢測到已知突變位點(diǎn),也可以發(fā)現(xiàn)新突變。新一代測序技術(shù)正確性高,重復(fù)性好,是目前檢測效果賊佳的方法。但需要復(fù)雜的生物信息學(xué)分析,費(fèi)用也較高。

2. 基因芯片法  

這是一種基于對已知位點(diǎn)的檢測?；蛐酒瑪?shù)萬個(gè)探針,對應(yīng)數(shù)萬個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)或者突變熱點(diǎn),可以高通量并行檢測。該方法操作簡便,檢測費(fèi)用較低,但只能檢測到芯片上包含的已知變異位點(diǎn)。對少見的新突變和插入缺失突變的檢測效果較差。

3. PCR方法

通過設(shè)計(jì)對特定基因區(qū)域的引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增和片段分析,可以檢測已知的突變熱點(diǎn)。該方法僅針對性檢測,無法找到新突變;而且每個(gè)位點(diǎn)需要設(shè)計(jì)獨(dú)立的引物對和反應(yīng)體系,工作量大,全面覆蓋所有熱點(diǎn)區(qū)域很困難。但該方法成本低,適合用于驗(yàn)證性檢測。

綜合考慮,建議利用新一代基因測序技術(shù)進(jìn)行白內(nèi)障基因檢測。該方法可以全面分析所有蛋白編碼區(qū)和調(diào)控區(qū)域序列,確保檢測的全面性,新突變檢出能力也賊強(qiáng)。與此同時(shí),正確性和重復(fù)性也優(yōu)于其他方法。隨著儀器性能的提高和項(xiàng)目成本的降低,基因測序在白內(nèi)障基因檢測中的應(yīng)用前景十分廣闊。

白內(nèi)障基因檢測范圍的基本要求

目前，孤立性或原發(fā)性先天性白內(nèi)障已被定位到至少 44 個(gè)基因位點(diǎn)，表現(xiàn)出各種各樣的晶狀體混濁形態(tài)，包括核、層狀、縫線、極和全。雖然其中 11 個(gè)基因座的致病基因尚未確定，但已發(fā)現(xiàn)的基因往往屬于許多功能組，這些功能組可識別眼晶狀體中的關(guān)鍵生物過程。在已知突變基因的白內(nèi)障家族中，約 45% 的晶狀體蛋白有突變，約 12% 的各種生長或轉(zhuǎn)錄因子有突變；16% 顯示連接蛋白突變，約 5% 各顯示中間絲蛋白、膜蛋白或蛋白質(zhì)降解裝置突變，約 8% 顯示各種其他功能不同的基因（包括脂質(zhì)代謝基因）突變。不同家族或同一家族內(nèi)不同個(gè)體中相同突變的遺傳可能導(dǎo)致有效不同的白內(nèi)障表型（表型異質(zhì)性），這表明額外的遺傳或環(huán)境因素可能會改變突變蛋白的表達(dá)，而突變蛋白是白內(nèi)障的主要原因。相反，在明顯不相關(guān)的生物過程中活躍的不同基因的突變可能導(dǎo)致具有相似或相同形態(tài)的白內(nèi)障（基因型異質(zhì)性），這表明臨床觀察到的白內(nèi)障可能是各種初始損傷的賊終共同途徑。

白內(nèi)障的位點(diǎn)和基因 (CTRCT)

除了作為孤立的缺陷發(fā)生外，先天性白內(nèi)障還可能與其他前房發(fā)育異常有關(guān)，例如小眼球、無虹膜或小角膜。晶狀體混濁也可能是多系統(tǒng)遺傳性疾病的一部分，例如染色體異常、DNA 修復(fù)缺陷、Lowe 綜合征或 Nance Horan 綜合征。CRYAB 突變引起的白內(nèi)障通常與肌原纖維肌病和心肌病相關(guān)。在某些情況下，綜合征性白內(nèi)障和孤立性白內(nèi)障之間的區(qū)別變得有些隨意，例如由于PITX3基因突變導(dǎo)致的眼前節(jié)間質(zhì)發(fā)育不全。在這里，遺傳性白內(nèi)障可能在某些家庭成員中是孤立的，而在其他家庭成員中可能與其他發(fā)現(xiàn)有關(guān)。一些更常見的綜合征性白內(nèi)障突變也以孤立性白內(nèi)障的形式出現(xiàn)。