【佳學(xué)基因檢測(cè)】什么是ATACseq基因檢測(cè)?

什么是ATACseq基因檢測(cè)？

ATACseq基因檢測(cè)的英文全稱是assay for transposase-accessible chromatin using sequencing，簡(jiǎn)稱為ATACseq.這主要是一種在基因解碼過程中用來了解部分基因序列的檢測(cè)方法。

ATACseq應(yīng)用案例：

這是一種快速和敏感的替代DHS定位的方法，DHS定位法需要5000到50000個(gè)細(xì)胞，使軟骨和其他主要關(guān)節(jié)組織的分析成為可能。在一個(gè)具體的基因解碼過程中，確定的109215個(gè)可接近的染色質(zhì)區(qū)域中，71.1%定位于的增強(qiáng)子區(qū)域，4%在受損和未受損OA軟骨細(xì)胞之間的可接近性發(fā)生了改變。幾個(gè)已建立的OA基因座內(nèi)的DNA變異序列存在于這些ATACseq峰，56個(gè)新OA基因座中有28個(gè)的基因序列突變也存在于這些峰中，包括LTBP1、LTBP3和SBNO1。在基因解碼過程中，采用ATACseq獲得的染色質(zhì)數(shù)據(jù)是鑒定軟骨中非編碼調(diào)控區(qū)的功能的寶貴資源，并將有助于確定OA風(fēng)險(xiǎn)突變序列和表觀遺傳變化的優(yōu)先順序，拓展了基因突變序列的功能分析。

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