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【佳學(xué)基因檢測(cè)】腎臟細(xì)胞癌發(fā)生的原因:基因突變進(jìn)區(qū)域進(jìn)化

【佳學(xué)基因檢測(cè)】腎臟細(xì)胞癌發(fā)生的原因:基因突變進(jìn)區(qū)域進(jìn)化。 在透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌ccRCC中,VHL抑癌基因是最常突變的基因,其通過遺傳(點(diǎn)突變、indels和3p25缺失)和/或表觀遺傳(啟動(dòng)子甲基化)機(jī)制的有效缺失構(gòu)成了最早的體細(xì)胞致病基因突變的發(fā)生。VHL是E3連接酶復(fù)合物的底物識(shí)別成分,泛素化HIF-1α和HIF-2α以進(jìn)行蛋白酶體介導(dǎo)的降解。因此,VHL的缺失導(dǎo)致HIF蛋白的異常積

佳學(xué)基因檢測(cè)】腎臟細(xì)胞癌發(fā)生的原因:基因突變進(jìn)區(qū)域進(jìn)化


在透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌ccRCC中,VHL抑癌基因是最常突變的基因,其通過遺傳(點(diǎn)突變、indels和3p25缺失)和/或表觀遺傳(啟動(dòng)子甲基化)機(jī)制的有效缺失構(gòu)成了最早的體細(xì)胞致病基因突變的發(fā)生。VHL是E3連接酶復(fù)合物的底物識(shí)別成分,泛素化HIF-1α和HIF-2α以進(jìn)行蛋白酶體介導(dǎo)的降解。因此,VHL的缺失導(dǎo)致HIF蛋白的異常積累,盡管存在充分氧化的組織微環(huán)境,這反過來導(dǎo)致調(diào)節(jié)血管生成的HIF靶基因的不受控制的激活,糖酵解和凋亡。因此,人類透明細(xì)胞腎細(xì)胞ccRCC腫瘤富含脂質(zhì)和糖原,并高度血管化,這就是為什么主要抑制VEGF及其受體VEGFR的藥物是轉(zhuǎn)移性ccRCC的有效治療方法的基礎(chǔ)。然而,單獨(dú)VHL缺失不足以誘導(dǎo)透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌ccRCC,這一點(diǎn)可以從攜帶VHL種系突變的個(gè)體發(fā)展成透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌的潛伏期>30年,這也可以從小鼠VHL缺失無法誘導(dǎo)ccRCC中得到證明。這些結(jié)果表明,透明腎細(xì)胞腎癌ccRCC的發(fā)展可能需要額外的遺傳和/或表觀遺傳事件。

ccRCC中VHL失活及其在靶向治療中的意義

VHL缺失是透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌(ccRCC)最常見的遺傳特征。其缺失減輕了細(xì)胞對(duì)缺氧誘導(dǎo)因子(HIF)的負(fù)調(diào)節(jié),這導(dǎo)致HIF靶基因表達(dá)增加,并隨之改變細(xì)胞代謝和信號(hào),從而提高細(xì)胞存活率。例如,血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子(VEGF)表達(dá)的增加與腫瘤微環(huán)境中內(nèi)皮細(xì)胞中生長(zhǎng)因子受體信號(hào)的增加(包括成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子(FGF)和肝細(xì)胞生長(zhǎng)因子)一致,增加了血管生成??傊@些變化為治療藥物提供了靶點(diǎn),以阻止腫瘤生長(zhǎng),如圖所示。FGFR,F(xiàn)GF受體VEGFR,VEGF;TSC,結(jié)節(jié)性硬化癥綜合征;PI3K,磷脂酰肌醇4,5-二磷酸3-激酶;AKT,α絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶;Rheb,GTP結(jié)合蛋白R(shí)heb;mTORC1、mTOR復(fù)合物1;mTORC2、mTOR復(fù)合物2;S6K1,核糖體蛋白S6激酶;4EBP1,真核翻譯起始因子4E結(jié)合蛋白1;HRE,HIF響應(yīng)元件;MET,肝細(xì)胞生長(zhǎng)因子受體。

為了識(shí)別這些事件,已經(jīng)開展了大規(guī)模的癌癥基因組項(xiàng)目,并發(fā)現(xiàn)了透明細(xì)胞腎細(xì)胞ccRCC的幾種新的普遍突變,包括PBRM1(占腫瘤樣本的29-41%)、SETD2(8-12%)、BAP1(6-10%)、KDM5C(4-7%)和MTOR(5-6%)。有趣的是,PBRM1、SETD2和BAP1編碼染色質(zhì)和組蛋白調(diào)節(jié)蛋白,位于3p21位點(diǎn),作為腫瘤抑癌基因而發(fā)揮作用。由于VHL位于3p25,3號(hào)染色體短臂(3p)的單拷貝缺失將導(dǎo)致這四個(gè)腫瘤抑制基因的單倍體不足,這證實(shí)了3p缺失(即雜合性缺失)幾乎是透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌ccRCC中的一個(gè)普遍事件,并構(gòu)成早期致癌性基因突變事件。相反,透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌ccRCC中的MTOR突變通常是錯(cuò)義和功能性激活,這可以解釋MTOR途徑抑制劑(包括依維莫司和替西羅莫司)有效的原因。
不同的單個(gè)突變及其相互作用如何影響透明細(xì)胞癌ccRCC的發(fā)病機(jī)制及其作為預(yù)后或預(yù)測(cè)性生物標(biāo)志物的價(jià)值尚不清楚。然而,一些研究已經(jīng)證明了有趣的臨床相關(guān)性,值得進(jìn)一步驗(yàn)證。由于VHL失活是透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌ccRCC的基礎(chǔ)事件,其突變狀態(tài)對(duì)臨床結(jié)果沒有影響,而與疾病進(jìn)展相關(guān)的突變,如PBRM1、SETD2和BAP1以及KDM5C(也參與染色質(zhì)修飾)被證明與侵襲性臨床特征相關(guān)。攜帶PBRM1突變的小腎腫塊與III期病理特征相關(guān)(即腎外生長(zhǎng),但不延伸至Gerota筋膜),而BAP1突變與較大的腫瘤體積、較高的Fuhrman核分級(jí)(大核,核仁突出)和較差的癌癥特異性生存率相關(guān)。有趣的是,BAP1和PBRM170或KDM5C20的突變似乎在透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌ccRCC中相互排斥地發(fā)生,提供了ccRCC的分子亞類分類標(biāo)準(zhǔn)。此外,位于Xp的KDM5C突變。主要在男性患者中檢測(cè)到,并與舒尼替尼的長(zhǎng)期療效相關(guān);SETD2突變與無反復(fù)生存率降低相關(guān)。

腫瘤異質(zhì)性與腫瘤演變

正如Nowell 40年前新穎描述的81,腫瘤內(nèi)的遺傳多樣性被認(rèn)為提供了選擇可以發(fā)揮作用的基質(zhì),使腫瘤能夠在癌癥自然史期間適應(yīng)新的微環(huán)境壓力和代謝需求(圖4A)。這種遺傳多樣性在ccRCC中已被廣泛研究。例如,在對(duì)四名患有多發(fā)腫瘤的ccRCC患者進(jìn)行的一項(xiàng)研究中,進(jìn)行了多區(qū)域遺傳分析,發(fā)現(xiàn)VHL突變和3p雜合性缺失是所有區(qū)域樣本17中普遍存在的事件。相比之下,常見的驅(qū)動(dòng)因素事件,如SETD2、PBRM1、MTOR、PIK3CA、,PTEN和KDM5C突變?cè)谠l(fā)性腫瘤和轉(zhuǎn)移部位中存在異質(zhì)性-在某些區(qū)域,但在其他區(qū)域不存在。這樣的遺傳特征可以構(gòu)建腫瘤系統(tǒng)發(fā)育,進(jìn)化樹的“主干”描述了在每個(gè)腫瘤細(xì)胞中存在的最近共同祖先(MRCA)中發(fā)現(xiàn)的突變分支突變?cè)谝恍﹣喛寺≈邪l(fā)現(xiàn),但在其他亞克隆中未發(fā)現(xiàn);這些突變可能在整個(gè)腫瘤區(qū)域分布,在原發(fā)腫瘤內(nèi)占據(jù)不同的區(qū)域生態(tài)位,或在疾病的原發(fā)和轉(zhuǎn)移部位之間占據(jù)不同的生態(tài)位。



 

(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)
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