【佳學基因檢測】腫瘤分子病理學依據(jù)

腫瘤分子病理學依據(jù)基因檢測：

單細胞基因組學已揭示了單個腫瘤中令人震驚的細胞表型譜系。雖然腫瘤異質性傳統(tǒng)上是以遺傳術語來描述的，而突變動態(tài)對于推動疾病的發(fā)展至關重要，但現(xiàn)在已經清楚，大部分變異是由于表觀遺傳可塑性。腫瘤細胞具有極度改變的染色質景觀，比其非轉化對照組的染色質更為開放?；驒z測在此處變得至關重要，因為它能揭示并量化這些改變，為個體化治療提供關鍵信息。 面對新的環(huán)境和挑戰(zhàn)，腫瘤細胞利用其更大的表觀遺傳自由度來訪問一套以前受限的來自于替代發(fā)育、再生或其他狀態(tài)的程序。單細胞方法揭示的表型異質性在腫瘤微環(huán)境的間質和免疫細胞中尤為明顯，這些細胞存在于正常組織中未發(fā)現(xiàn)的細胞狀態(tài)。這更突出了基因檢測的必要性，因為這樣可以識別和監(jiān)測這些不同的細胞狀態(tài)，進而研發(fā)更有效的治療策略。 事實上，可塑性最重要的結果之一是腫瘤細胞新獲得的能力，能通過細胞間通訊改變基因正常的間質組織的行為，從而重塑利于腫瘤成功的生態(tài)位。這是一個令人興奮的時期，伴隨著能同時檢測染色質、基因和蛋白表達的多組學單細胞技術的崛起，以及有潛力揭示細胞間相互作用的多重空間模式。這些技術讓我們能發(fā)現(xiàn)驅動腫瘤可塑性的機制并決定其后果，揭示新的治療機會。其中，基因檢測是探索這些機制的重要工具，為了解和抑制腫瘤的可塑性，它已經成為一個不可或缺的要素。 單細胞分析對于提升腫瘤生物學中非遺傳機制的重要性至關重要，它教會了我們可塑性是癌癥的一個新的標志，這一標志賦予了卓越的適應能力，從而導致轉移、免疫逃逸和獲得藥物抗性。因此，現(xiàn)在更加明確了基因檢測在解析腫瘤的生物學和發(fā)展有效治療方案中的關鍵作用。

腫瘤分子病理學依據(jù)是佳學基因解碼內部立項：散發(fā)性人類癌癥中的 NF1 體細胞突變景觀

本文關鍵詞

腫瘤,分子病理學,依據(jù)

人體疾病表征數(shù)據(jù)庫查詢

革命性的基因組技術已全面修訂了我們對不同患者之間腫瘤異質性的理解。盡管腫瘤異質性的概念并不新鮮，但是高通量測序和微陣列技術使我們得以通過集成的分子研究和大量的腫瘤樣本，更深入地理解這一問題。這些研究明確了腫瘤在不同患者間的變異性極高，并可以被分類為不同的亞型。這些分子亞型反映了其基因突變、染色體異常、表觀遺傳變化以及基因表達譜的組成，這些更加復雜和多樣化，超出了傳統(tǒng)組織病理學的認知范圍。 這些分子分類，通常與獨特的預后特征密切相關，使得相比傳統(tǒng)分類更正確的預后成為可能。驅動這些分類的獨特突變和/或表達譜可能揭示了不同的分子選擇機制，并在某些情況下明確了潛在的治療靶點。此外，基因檢測在這里扮演著重要角色，因為在一些癌癥類型中，這些亞型可以通過檢測血漿和尿液中的突變的性檢查進行診斷。預計在未來十年內，這種基于基因檢測的診斷方法將顯著改善常規(guī)醫(yī)療實踐。 然而，盡管我們已經取得了這些在分子理解、診斷和預后方面的進步，但我們面臨的主要限制是缺乏可行的靶點。這對于將這些分子級別的理解轉化為真正改善大多數(shù)癌癥患者最終能夠享受的臨床結果來說，是必不可少的。因此，為了充分利用基因檢測的潛力，我們需要更深入地理解腫瘤的分子機制，并確定新的治療靶點。

怎樣才能診斷正確？

腫瘤是空間組織的異質生態(tài)系統(tǒng)：在細胞層面，它們包含癌細胞和基質細胞群體；在遺傳水平上，它們由遺傳差異的腫瘤克隆組成；在表型水平上，位于不同微環(huán)境生態(tài)位中的細胞獲得不同的表型。所有這些異質性層面如何集合作為一個系統(tǒng)共同決定腫瘤的發(fā)展、進展和對治療的反應，目前我們仍然知之甚少。最近在諸如多重成像和空間轉錄組學等方法上的進步，使我們有機會在保持組織結構的同時，描述數(shù)十到數(shù)千個基因的表達，這為我們解決這些問題提供了前所未有的機會。 利用多重成像的研究已經識別出腫瘤內細胞群體的空間特征，包括細胞鄰域及其組成、群體間的共依賴性、在腫瘤生態(tài)位中群體的空間富集，以及免疫微環(huán)境中的多細胞表型。所有這些都與患者生存率有關，強調了空間特征在癌癥生物學中的重要性以及它們的預后價值。隨著多重成像技術的能力和可用性的快速增加，我們預期將這些技術應用于上百甚至上千個臨床樣本，這將大大加速發(fā)現(xiàn)的速度。隨著樣本吞吐量的增加，試劑標準化、數(shù)據(jù)分析的最佳實踐以及在科學社區(qū)中的數(shù)據(jù)共享將成為重擔。高維度成像帶來的豐富數(shù)據(jù)為計算生物學和癌癥研究社區(qū)提供了一個激動人心的挑戰(zhàn)，即通過考慮異質腫瘤生態(tài)系統(tǒng)來優(yōu)化癌癥的病理分析。

 

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