【佳學基因檢測】血液microRNA在肺癌基因檢測、早期篩查中的應用
《基因檢測需要包括的基因信息來源》指出microRNA(miRNA)是基因表達的重要調節(jié)因子,通過在翻譯過程中抑制或降解信使RNA(mRNA)靶點發(fā)揮作用。miRNA表達的改變與大多數癌癥的發(fā)病機制有關。例如,let7 miRNA在肺癌組織中表達下調,但過度表達會抑制肺癌細胞系的生長。相反,miRNA-21在肺癌細胞系和組織中過度表達。
健康對照組和肺癌患者的血液中都存在循環(huán)miRNA。它們似乎構成了血液中大部分RNA組分,并且對RNA酶降解具有顯著的抵抗力。這種穩(wěn)定性意味著miRNA有可能被用作診斷生物標志物。MiRNA也可以通過血小板或吞噬性單核細胞分泌的微泡(外小體)進入血液。證據還指出,來源于癌細胞的外泌體增加了遠距離信號傳遞的可能性,并為轉移性擴散準備了小生境,因此,腫瘤發(fā)生、惡化及轉移的基因解碼認為這是一個新興的研究和應用領域。
《肺癌基因檢測正確性改進小組》已經關注了血漿miRNA表達與肺癌的關系。肺癌癥癥病基因解碼研究人員將I–IIIA期肺癌患者的循環(huán)血漿miRNA與對照組進行比較,明確了癌癥患者與健康人有差異的24個miRNA組。另一個肺癌分子病理研究觀察了85名健康對照組和90名患者的兩種特異性miRNA,即miR944和miR3662,發(fā)現這兩種miRNA在非小細胞肺癌NSCLC患者中的過度表達是健康對照組的四倍以上。鱗狀細胞癌和腺癌中這兩種miRNA的表達沒有顯著差異。
佳學基因合作研究人員在血漿中鑒定出四種miRNA(mir-21、mir-126、mir-210和mir-486–5p),對這些基因序列進行檢測可以以區(qū)分非小細胞肺癌NSCLC患者和對照組,具有86%的敏感性和97%的特異性。有趣的是,這個基因檢測包對腺癌的敏感性(91%)高于鱗狀細胞癌(82%)。肺癌基因檢測檢測包優(yōu)化選擇研究人員還比較了良性和惡性孤立性肺結節(jié)(SPN)的血漿中miRNA表達。與良性孤立性肺結節(jié)相比,惡性孤立性肺結節(jié)中Mir-21和210表達上調,Mir-486–5p表達下調。根據各種基因解碼結果,基因解碼研究人員開發(fā)了一個模型,該模型對從CT檢測的孤立性肺結節(jié)中檢測惡性腫瘤具有75%的敏感性和85%的特異性。
基因解碼于是探索將miRNA基因檢測用于分析提高肺癌篩查的正確性。通過分析低劑量CT(LDCT)肺部篩查研究患者血漿中的miRNA表達,以確定在肺癌產生前和肺癌得以診斷時差異表達的miRNA。肺癌的致病基因鑒定基因解碼確定一個由15個miRNA組成的基因檢測包在肺癌得到確診斷用于檢測。設計的另一個基因檢測包由13個miRNA組成(與前15個部分重疊),則是用于診斷。基因檢測包在一個使用血漿樣本進行檢測的臨床實驗中得到了驗證。診斷前檢測的敏感性為80%,特異性為90%,而診斷時的敏感性為75%,特異性為100%。此外,在驗證隊列中,另一組由9個miRNA組成的基因檢測包能夠以80%的敏感性和100%的特異性預測不良預后。這些miRNA被合并成一個由24個基因組成的檢測包,隨后被肺癌的基因檢測和分子診斷開發(fā)成肺癌的miRNA特征分類標準(MSC),根據這一基因檢測包將患者分為低、中或高風險。該工具以盲法回顧性地應用于肺癌基因檢測高效性研究中的一個較大的患者隊列,其敏感性為87%,特異性為81%。與低劑量CT(LDCT)聯合使用時,假陽性率降低了五倍。此外,就5年生存率而言,從低風險到高風險的生存率有統計學意義的趨勢。在預測預后方面,它的表現不如臨床病理分期,基因解碼人員正在驗證新的檢測策略。循環(huán)miRNA的使用似乎顯示了通過基因檢測早期發(fā)現非小細胞肺癌NSCLC的希望。因為獨立研究、設計良好和高效的驗證的臨床結果可以做為可信賴的證據。