【佳學(xué)基因檢測】前列腺癌化療敏感與化療抗性基因檢測
為什么要進(jìn)行化療藥物敏感性與耐藥性的基因檢測分析
前列腺癌仍然是中國各地區(qū)人民面臨的一個(gè)重大公共衛(wèi)生問題，特別是其死亡率很高。 盡管進(jìn)行了多年的廣泛研究和大量的財(cái)政支出，但仍未找到針對前列腺癌的明確解決方案。 不僅個(gè)體對治療的反應(yīng)不同，甚至同一腫瘤內(nèi)的不同結(jié)節(jié)也表現(xiàn)出獨(dú)特的轉(zhuǎn)錄組模式。 這些區(qū)別不僅僅是基因表達(dá)水平的差異，還包括單個(gè)基因的控制和網(wǎng)絡(luò)。 前列腺癌患者化療耐藥性的不斷升級促使佳學(xué)基因用藥指導(dǎo)基因解碼對其潛在機(jī)制進(jìn)行了更多的研究。 男性轉(zhuǎn)錄組組織的異質(zhì)性使得追求通用生物標(biāo)志物和一刀切的治療方法變得不切實(shí)際。 這項(xiàng)基因解碼深入研究了癌細(xì)胞中耐藥相關(guān)基因 ABCB1 和 CYP1B1 的表達(dá)。 利用生物信息學(xué)，佳學(xué)基因探索了這些基因上調(diào)后與耐藥性相關(guān)的分子途徑和級聯(lián)反應(yīng)。 樣本是通過兩類治療前活檢從存檔的前列腺癌患者標(biāo)本中獲得的：反應(yīng)良好者與反應(yīng)差者，并從分離的 RNA 合成 cDNA 進(jìn)行 qPCR基因檢測分析。 結(jié)果顯示，反應(yīng)不佳者的腫瘤樣本中 ABCB1 和 CYP1B1 表達(dá)增加。 基因富集和網(wǎng)絡(luò)分析將 ABCB1 與 ABC 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白和 LncRNA 介導(dǎo)的治療耐藥性 (WP3672) 相關(guān)，而 CYP1B1 與卵巢類固醇生成、色氨酸代謝、類固醇激素生物合成、苯并 (a) 芘代謝、舒林酸代謝途徑和雌激素相關(guān) 受體途徑，與耐藥性相關(guān)。 ABCB1 和 CYP1B1 均與癌癥和核受體元通路中的 microRNA 相關(guān)。 STRING 分析預(yù)測了 ABCB1 和 CYP1B1 與谷胱甘肽 S-轉(zhuǎn)移酶 Pi、兒茶酚 O-甲基轉(zhuǎn)移酶、UDP-葡萄糖醛酸基轉(zhuǎn)移酶 1-6、富含亮氨酸跨膜和 O-甲基轉(zhuǎn)移酶 (LRTOMT) 以及環(huán)氧化物水解酶 1 的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用，得分為 分別為 0.973、0.971、0.966、0.966 和 0.966。 此外，化療藥物多西他賽與 CYP1B1 和 ABCB1 的分子對接分析揭示了強(qiáng)大的分子相互作用，結(jié)合能分別為 -20.37 和 -15.25 Kcal/mol。 這些發(fā)現(xiàn)強(qiáng)調(diào)了癌癥患者對耐藥性的易感性，因?yàn)閬碜苑磻?yīng)不佳者類別的患者的腫瘤樣本中 ABCB1 和 CYP1B1 表達(dá)增加，影響了相關(guān)的分子途徑。 ABCB1 和 CYP1B1 與多西紫杉醇的有效分子相互作用進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)了化療耐藥的潛在基礎(chǔ)。
前列腺癌化療敏感與化療抗性基因檢測關(guān)鍵詞
生物標(biāo)志物； 化療耐藥； 藥物遺傳學(xué)； 前列腺癌; 蛋白質(zhì)組學(xué)。
佳學(xué)基因前列腺癌化療藥物敏感性基因檢測的優(yōu)越性
在經(jīng)濟(jì)和醫(yī)療保健面臨挑戰(zhàn)的情況下，中國各省市前列腺癌發(fā)病率不斷上升，令佳學(xué)基因解碼、基因檢測團(tuán)隊(duì)嚴(yán)重關(guān)切。 隨著耐藥性的增加，這個(gè)難題變得更加嚴(yán)重，加劇了該疾病對發(fā)病率和死亡率的影響。 盡管進(jìn)行了多年的廣泛研究和大量的財(cái)政投資，但在解決前列腺癌方面尚未取得成功的突破。 腫瘤的致病基因鑒定與用藥指導(dǎo)基因解碼的研究表明，每個(gè)個(gè)體，甚至同一腫瘤內(nèi)的每個(gè)癌變區(qū)域，都擁有獨(dú)特的轉(zhuǎn)錄組結(jié)構(gòu)。 這些差異超出了單純的基因表達(dá)水平，涵蓋了特定基因的調(diào)節(jié)和相互作用。 個(gè)體間轉(zhuǎn)錄組組織的多樣性和不可重復(fù)性使得尋找通用生物標(biāo)志物和一刀切的治療方法變得不切實(shí)際。 佳學(xué)基因前列腺癌基因解碼深入研究了前列腺癌腫瘤和正常組織中耐藥相關(guān)蛋白（即 ABCB1 和 CYP1B1）的表達(dá)。 根據(jù)患者對多西他賽治療的反應(yīng)進(jìn)行分類——反應(yīng)良好者（化療敏感）和反應(yīng)差者（化療耐藥）——增加了細(xì)致入微的視角。
ABCB1 是 ABC 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白超家族的成員，在藥物轉(zhuǎn)運(yùn)和化療耐藥中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用，通常表現(xiàn)出與多重耐藥癌癥相關(guān)的過度表達(dá)。 在前列腺癌用藥指導(dǎo)的基因檢測研究中，前列腺腫瘤中 ABCB1 的低表達(dá)暗示通過 ABCB1 途徑降低了化療耐藥性。 ABCB1 的基因富集強(qiáng)調(diào)了這一點(diǎn)，強(qiáng)調(diào)了受抑制的耐藥途徑。 ABC 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的復(fù)雜作用在藥物轉(zhuǎn)運(yùn)中至關(guān)重要，與在正常組織和腫瘤組織中觀察到的 ABC 轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白途徑的低激活相一致。 引人注目的是，反應(yīng)不佳者表現(xiàn)出 ABCB1 表達(dá)升高，與富集和網(wǎng)絡(luò)分析中確定的激活途徑一致。
根據(jù)人體組成成分的結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系的基因解碼，CYP1B1 屬于細(xì)胞色素 P450 酶家族，在藥物代謝中具有重要意義，并與多種惡性腫瘤的化療耐藥有關(guān)。 前列腺腫瘤中的 CYP1B1 表達(dá)升高，尤其是反應(yīng)不佳的患者，強(qiáng)調(diào)了耐藥性的高潛力。 CYP1B1 富集和網(wǎng)絡(luò)分析中確定的途徑與其在激活前列腺癌耐藥相關(guān)途徑中的作用一致。 由 CYP1B1 驅(qū)動(dòng)的非常規(guī)類固醇代謝途徑與前列腺癌惡性腫瘤有關(guān)。 異常的色氨酸代謝通過芳烴受體 (AhR) 與化療耐藥相關(guān)，進(jìn)一步增加了復(fù)雜性。
佳學(xué)基因認(rèn)為了解耐藥機(jī)制有可能促進(jìn) CRPC 新療法的開發(fā)。 先進(jìn)計(jì)算算法的進(jìn)展尤其令人著迷，因?yàn)樗峁┝私沂靖鞣N細(xì)胞過程背后的分子復(fù)雜性的機(jī)會(huì)，例如蛋白質(zhì)相互作用、分子識別、突變分析、藥物發(fā)現(xiàn)和生物工程。 例如，STRING 分析預(yù)測的功能蛋白，包括 GSTP1、COMT、UGT1A6、LRTOMT 和 EPHX1，與耐藥性相關(guān)。 GST，包括 GSTP1，通過解毒藥物導(dǎo)致化療耐藥性。 UGT1A6 在藥物治療代謝失活中的作用已得到充分證實(shí)。 EPHX1 在去勢抵抗性前列腺癌中過度表達(dá)。
預(yù)測的自由能 -15.25 和 -20.37 Kcal/mol表明該藥物分別與 ABCB1 和 CYP1B1 存在有效的分子相互作用。 這種相互作用可歸因于已確定的鍵，這些鍵將藥物與基因的活性位點(diǎn)結(jié)合。先前的研究表明，接受多西紫杉醇治療的前列腺癌患者的生存率有所提高。 然而，據(jù)報(bào)道，耐藥前列腺癌細(xì)胞的治療效果受到損害。 此外，CYP1B1 的高表達(dá)與前列腺癌細(xì)胞對多西紫杉醇的耐藥有關(guān)。 多西他賽治療高表達(dá) ABCB1 的前列腺癌細(xì)胞也有多重耐藥性的報(bào)道。 因此，多西紫杉醇與 ABCB1 和 CYP1B1 的有效分子相互作用可能通過增加 ABCB1 和 CYP1B1 的表達(dá)來暗示癌細(xì)胞對多西紫杉醇的潛在耐藥性。 這與之前關(guān)于多西紫杉醇治療后 ABCB1 和 CYP1B1 表達(dá)增加以及細(xì)胞增殖的報(bào)道相關(guān)。
