【佳學(xué)基因檢測】納米孔測序單細(xì)胞分析時代的表觀遺傳腫瘤異質(zhì)性

國內(nèi)正規(guī)腫瘤基因檢測機(jī)構(gòu)關(guān)鍵點(diǎn)

從不同的基因測序技術(shù)中如何選擇測序平臺，從而實(shí)現(xiàn)以幫助病人為目的的腫瘤基因檢測。這個問題的答案可以從《Sci Rep》在 2015; 5: 13201發(fā)表了一篇題目為《納米孔測序單細(xì)胞分析時代的表觀遺傳腫瘤異質(zhì)性》腫瘤組織基因突變異質(zhì)性的臨床研究文章。該研究由Lasse Vinner, Tobias Mourier, Jens Friis-Nielsen, Robert Gniadecki, Karen Dybkaer, Jacob Rosenberg, Jill Levin Langhoff, David Flores Santa Cruz, Jannik Fonager, Jose M. G. Izarzugaza, Ramneek Gupta, Thomas Sicheritz-Ponten, Søren Brunak, Eske Willerslev, Lars Peter Nielsen, and Anders Johannes Hansen等完成。揭示了在單細(xì)胞水平上腫瘤基因組織異質(zhì)性、多樣性的情況，進(jìn)一步充實(shí)了基于基于信息的靶向藥物選擇。

腫瘤靶向藥物及正確治療臨床研究內(nèi)容關(guān)鍵詞：

表觀遺傳學(xué),納米孔測序,CpG 島,腫瘤異質(zhì)性,甲基化胞嘧啶,牛津納米孔,MinION

腫瘤靶向治療基因檢測臨床應(yīng)用結(jié)果

納米孔測序?qū)⒃摷夹g(shù)帶到了測序科學(xué)的下一代。這是通過以下方面的研究來實(shí)現(xiàn)的：孔效率、創(chuàng)建控制 DNA 易位的機(jī)制、提高信噪比以及擴(kuò)展到長讀取范圍。關(guān)于表觀遺傳學(xué)的異質(zhì)性將是廣泛的，因?yàn)楸碛^基因組中的突變對在癌癥研究中引起新挑戰(zhàn)很敏感。催化 DNA 甲基化和組蛋白修飾的表觀遺傳酶在癌細(xì)胞中失調(diào)并導(dǎo)致許多異質(zhì)克隆進(jìn)化。在這些克隆中檢測這種異質(zhì)性在治療各種癌癥類型中起著不可或缺的作用。通過單細(xì)胞分析，納米孔測序技術(shù)可以提供簡單的長讀序列，預(yù)計(jì)很快將在床邊或醫(yī)生辦公室使用。在這里，我們回顧了納米孔測序的進(jìn)展及其在癌癥表觀遺傳異質(zhì)性檢測中的應(yīng)用。關(guān)鍵詞：表觀遺傳學(xué)，納米孔測序，CpG 島，腫瘤異質(zhì)性，甲基化胞嘧啶，牛津納米孔，MinION

腫瘤發(fā)生與反復(fù)轉(zhuǎn)移國際數(shù)據(jù)庫描述：

Epigenetics, Nanopore sequencing, CpG island, Tumor heterogeneity, Methylated cytosine, Oxford nanopore, MinION