【佳學(xué)基因檢測】NAb-seq:一種在雜交瘤細(xì)胞系和單個 B 細(xì)胞中進行抗體長讀長測序的正確、快速且經(jīng)濟高效的方法
基因檢測有必要做嗎—解答
研討基因檢測人員學(xué)科學(xué)習(xí)手冊《腫瘤靶向藥物的敏感性及有效性》《PLoS Genet》在?2021 Apr; 17(4): e1009329發(fā)表了一篇題目為《NAb-seq:一種在雜交瘤細(xì)胞系和單個 B 細(xì)胞中進行抗體長讀長測序的正確、快速且經(jīng)濟高效的方法》腫瘤靶向藥物治療基因檢測臨床研究文章。該研究由Yinbo Zhang, Conceptualization, Data curation, Formal analysis, Investigation, Methodology, Software, Writing – original draft, Writing – review & editing, Luther Davis, Conceptualization, Data curation, Formal analysis, Investigation, Methodology, Validation, Writing – original draft, Writing – review & editing, and Nancy Maizels, Conceptualization, Funding acquisition, Investigation, Project administration, Resources, Supervision, Visualization, Writing – original draft, Writing – review & editing,等完成。促進了腫瘤的正確治療與個性化用藥的發(fā)展,進一步強調(diào)了基因信息檢測與分析的重要性。
腫瘤靶向藥物及正確治療臨床研究內(nèi)容關(guān)鍵詞:
抗體測序,B 細(xì)胞,雜交瘤,長讀長,納米孔測序,大鼠 B 細(xì)胞克隆,單細(xì)胞,工作流程
腫瘤靶向治療基因檢測臨床應(yīng)用結(jié)果
盡管它們在研究中普遍使用,但目前尚未對單克隆抗體進行系統(tǒng)測序。這可能會導(dǎo)致重現(xiàn)性問題以及偶爾會丟失抗體并丟失細(xì)胞系。雜交瘤細(xì)胞系是從免疫動物(包括小鼠、大鼠、兔和羊駝)中產(chǎn)生單克隆抗體的主要手段。除治療性抗體外,很少有雜交瘤衍生的抗體序列是已知的。 Sanger 測序一直是抗體基因測序的“金標(biāo)準(zhǔn)”,但這種方法依賴于物種特異性簡并引物組的可用性,用于擴增輕抗體和重抗體基因,并且需要冗長且昂貴的 cDNA 制備。在這里,我們利用長讀長牛津納米孔技術(shù) (ONT) 測序的賊新改進來開發(fā)納米孔抗體測序 (NAb-seq):一種為期三天、不依賴物種且具有成本效益的工作流程,用于表征配對的全長免疫球蛋白光- 和來自雜交瘤細(xì)胞系的重鏈基因。與兩種雜交瘤細(xì)胞系的 Sanger 測序相比,長讀長 ONT 測序具有高度正確、高效和高通量的特點。我們進一步表明該方法適用于單細(xì)胞,允許在記憶 B 細(xì)胞等稀有群體中有效地發(fā)現(xiàn)抗體??傊?,NAb-seq 有望加速雜交瘤抗體以及用于研究、診斷和治療的單個 B 細(xì)胞抗體的鑒定和驗證。關(guān)鍵詞:抗體測序、B 細(xì)胞、雜交瘤、長讀長、納米孔測序、大鼠B 細(xì)胞克隆、單細(xì)胞、工作流程
腫瘤發(fā)生與反復(fù)轉(zhuǎn)移國際數(shù)據(jù)庫描述:
Antibody sequencing, B cell, hybridoma, long-read, nanopore sequencing, rat B cell cloning, single cell, workflow
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)