【佳學(xué)基因檢測】在乳腺癌細(xì)胞中獲得多西紫杉醇耐藥性期間外顯子組的逐步進(jìn)化

腫瘤基因檢測哪家機構(gòu)賊好導(dǎo)讀

根據(jù)腫瘤基因檢測全面性的標(biāo)準(zhǔn)與實施方案知悉《Ann Oncol》在?2015 Aug; 26(8): 1589–1604發(fā)表了一篇題目為《在乳腺癌細(xì)胞中獲得多西紫杉醇耐藥性期間外顯子組的逐步進(jìn)化》腫瘤靶向藥物治療基因檢測臨床研究文章。該研究由Management of patients with advanced prostate cancer: recommendations of the St Gallen Advanced Prostate Cancer Consensus Conference (APCCC)?等完成。促進(jìn)了腫瘤的正確治療與個性化用藥的發(fā)展，進(jìn)一步強調(diào)了基因信息檢測與分析的重要性。

腫瘤靶向藥物及正確治療臨床研究內(nèi)容關(guān)鍵詞：

乳腺癌,多西他賽耐藥,紫杉烷,外顯子組測序

腫瘤靶向治療基因檢測臨床應(yīng)用結(jié)果

背景：乳腺癌患者對紫杉烷類治療的耐藥性是一個主要的臨床問題，可以通過深入了解導(dǎo)致乳腺癌細(xì)胞對紫杉烷類藥物耐藥的基因組改變來解決。在目前的研究中，我們使用全外顯子組測序來發(fā)現(xiàn)體細(xì)胞基因組改變，在乳腺癌細(xì)胞系中獲得多西紫杉醇耐藥性的過程中跨越進(jìn)化階段。結(jié)果：兩種人乳腺癌體外模型（MCF-7 和 MDA-MB-231 ) 通過將細(xì)胞暴露于 18 種逐漸增加的多西紫杉醇濃度來開發(fā)逐步獲得多西紫杉醇抗性的方法。在此過程中在五個連續(xù)階段進(jìn)行的全外顯子組測序用于識別與獲得多西紫杉醇抗性相關(guān)的單點突變事件、插入/缺失和拷貝數(shù)改變。使用基于網(wǎng)絡(luò)的方法進(jìn)一步優(yōu)先考慮經(jīng)歷正選擇和具有可能具有功能的特征的獲得性編碼變異。發(fā)現(xiàn)許多基因組變化正在進(jìn)行進(jìn)化選擇，其中一些可能是功能性的。在抗性進(jìn)展的五個階段中，大多數(shù)抗性相關(guān)基因組變異似乎出現(xiàn)在有效抗性細(xì)胞的中間，對應(yīng)于 MDA-MB-231 的第 31 代（5 nM 多西紫杉醇）和 MCF-7 的第 16 代（1.2 nM 多西紫杉醇），并且細(xì)胞也分別表現(xiàn)出生長速率降低或停滯的時期。 MCF-7 細(xì)胞在 7 號染色體上獲得了多個拷貝數(shù)增益，包括 ABC 轉(zhuǎn)運蛋白基因，包括 ABCB1 和 ABCB4，以及 DMTF1、CLDN12、CROT 和 SRI。對于 MDA-MB-231，在涉及 30 多個基因的 X 染色體上觀察到大量拷貝數(shù)丟失。在這些基因中，CASK、POLA1、PRDX4、MED14 和 PIGA 被應(yīng)用的基于網(wǎng)絡(luò)的基因排序方法高度優(yōu)先考慮。在較高的多西紫杉醇濃度下，MCF-7 亞克隆在 E2F4 中表現(xiàn)出拷貝數(shù)丟失，并且編碼這一重要轉(zhuǎn)錄因子的基因在 MCF-7 抗性細(xì)胞中被下調(diào)。結(jié)論我們對獲得性多西紫杉醇抗性進(jìn)化的研究確定了幾種可能的基因組變化解釋多西紫杉醇耐藥性的發(fā)展。有趣的是，賊相關(guān)的抗性相關(guān)變化似乎起源于向有效抗性細(xì)胞系進(jìn)化的中途。我們的數(shù)據(jù)表明，沒有單一的基因組事件足以預(yù)測對多西他賽的耐藥性，但需要影響多個途徑的基因組改變共同建立賊終的耐藥階段。電子補充材料本文的在線版本（doi:10.1186/s12864-016-2749-4 ) 包含補充材料，可供授權(quán)用戶使用。關(guān)鍵詞：乳腺癌、多西紫杉醇耐藥性、紫杉烷、外顯子組測序

腫瘤發(fā)生與反復(fù)轉(zhuǎn)移國際數(shù)據(jù)庫描述：

?Breast cancer, Docetaxel resistance, Taxane, Exome sequencing