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【佳學基因檢測】精神分裂癥基因檢測中的miRNA檢測及miRNA藥物

盡管普遍認為遺傳和發(fā)育因素在精神分裂癥的發(fā)病機制中起關鍵作用,但精神分裂癥的確切病因機制對于很多人來說仍然未知。在過去的幾十年中,mi RNA已成為基因表達調控中必不可少的轉錄后

佳學基因檢測】精神分裂癥基因檢測中的miRNA檢測及miRNA藥物


精神分裂癥基因檢測導讀

盡管普遍認為遺傳和發(fā)育因素在精神分裂癥的發(fā)病機制中起關鍵作用,但精神分裂癥的確切病因機制對于很多人來說仍然未知。在過去的幾十年中,mi RNA已成為基因表達調控中必不可少的轉錄后調節(jié)因子。mi RNA在大腦發(fā)育和神經可塑性中的重要性已得到公認。已知 mi RNA的異常表達和功能障礙涉及包括精神分裂癥在內的許多神經精神疾病的病理生理學。在精神分裂癥基因檢測中的miRNA檢測及miRNA藥物中,佳學精神系統(tǒng)疾病基因解碼總結了精神分裂癥相關的 mi RNA失調的最新發(fā)現(xiàn)。和在精神分裂癥的發(fā)展和發(fā)病機制中的功能作用。佳學精神系統(tǒng)疾病基因解碼還討論了 mi RNA調節(jié)在疾病中的潛在治療意義。

關鍵詞: mi RNA神經可塑性 精神分裂癥 單核苷酸多態(tài)性
 

1、簡介

精神分裂癥是一種致殘性疾病,其特征是社會行為異常、精神障礙、思維中斷和認知受損等復雜癥狀。它影響了全球近 1% 的人口。一般認為,發(fā)育和環(huán)境因素之間的相互作用促成了這種疾病的發(fā)病機制;然而,確切的病因仍然未知。從病理生理學的角度來看,異常的神經傳遞,特別是多巴胺-谷氨酸傳遞障礙和前額葉功能障礙改變可能在精神分裂癥的大多數(shù)癥狀中起重要作用。最近出現(xiàn)的證據表明,稱為 microRNA (miRNA) 的小非編碼 RNA 參與了該疾病的發(fā)病機制和病理過程。miRNA 是一類約 22 個核苷酸的非編碼 RNA,它可以通過與靶 mRNA 互補堿基配對以轉錄后方式在功能上沉默基因。每個 miRNA 都可以通過細胞內基因沉默機制潛在地調節(jié)許多下游靶基因。miRNA調控網絡在神經元發(fā)育和腦功能中的重要性已被廣泛研究。它的潛在作用已成為了解包括精神分裂癥在內的許多神經精神疾病的發(fā)病機制和發(fā)展的焦點。在精神分裂癥基因檢測中的miRNA檢測及miRNA藥物中,佳學精神系統(tǒng)疾病基因解碼總結了 miRNA 調控的最新發(fā)展和精神分裂癥的潛在功能影響,強調了最近發(fā)現(xiàn)的 miRNA 作為該疾病的新生物標志物和潛在治療方法。

 

2. 中樞神經系統(tǒng)中的 miRNA 生物發(fā)生和功能

第一個 miRNA 于 1993 年在秀麗隱桿線蟲中發(fā)現(xiàn)。第二個 miRNA let-7 花了 7 年時間才被報道。自 2000 年以來,已在動物、植物、病毒以及哺乳動物中樞神經系統(tǒng)中鑒定出數(shù)千種 miRNA。miRNA在細胞增殖、分化和凋亡中的功能作用已被廣泛研究。miRNA 由它們自己的基因或由編碼或非編碼基因的內含子產生。與蛋白質編碼基因一樣,miRNA 被 RNA 聚合酶 II 或 RNA 聚合酶 III 從基因組 DNA 轉錄成初級轉錄物 (pri-miRNA)。pri-miRNAs通常具有一個5' CAP和一個3' poly A尾,可以在細胞核中折疊成具有莖環(huán)結構的雙鏈RNA發(fā)夾。脊椎動物中含有 RNaseIII 核酸內切酶 Drosha 和核蛋白 DGCR8(DiGeorge 綜合征關鍵區(qū)域 8)的微處理器復合物可以識別莖環(huán)結構。在 Drosha 切割 5' CAP 和 3' poly A 尾后,釋放出 70~100 nt 發(fā)夾狀的前體 miRNA(pre-miRNA)并輸出到細胞質中,其中 pre-miRNA 被類型切割III 核糖核酸酶 Dicer 并產生約 22nt 雙鏈 RNA 雙鏈體:miRNA/miRNA* (如圖 1)。在展開過程中,雙鏈體的一條鏈,即成熟的 miRNA,可以加載到 RNA 誘導的沉默復合體 (RISC) 中,而另一條鏈通常被降解。除了 miRNA,RISC 還包含 Dicer、RNA 結合蛋白 Argonaute (AGO) 和銜接蛋白 TRBP。含有 miRNA 的 RISC 能夠識別靶 mRNA 的 3'UTR 中的互補序列,從而導致靶 mRNA 的翻譯抑制或降解。miRNA 與其目標 mRNA 的識別是由最初的 2-7 個 miRNA 堿基引導的。由于互補的沉默機制,一個miRNA可以靶向數(shù)百甚至數(shù)千個mRNA,而不同的miRNA也可以與同一個mRNA結合,形成一個復雜的miRNA-基因調控網絡。

包含圖片、插圖等的外部文件。對象名稱為 CNS-24-586-g001.jpg
圖1:mi RNA生物發(fā)生和功能示意圖 mi RNA通過RNA聚合酶從基因組DNA轉錄成初級轉錄物 (pri-mi RNA )。Primi RNA在細胞核中被 Drosha 切割以產生 mi RNA前體(pre-mi RNA),然后通過 Exportin-5 輸出到細胞質中,并進一步被 Dicer 切割以產生約 22nt 雙鏈RNA雙鏈體:mi RNA /米核糖核酸*。雙鏈的一條鏈,成熟的 mi RNA可以與RNA誘導的沉默復合物 ( RISC) 復合并引導目標mRNA的翻譯抑制,而另一條鏈通常被降解

大約 70% 的已知 miRNA 在哺乳動物大腦中表達。Bak等人研究了成年小鼠大腦不同區(qū)域的 miRNA 表達譜。他們檢測到 44 個顯示組織特異性富集的 miRNA,這表明 CNS miRNA 可能與相應大腦區(qū)域內的特定功能相關。盡管成熟的 miRNA 序列在小鼠和斑馬魚之間是保守的,但超過 50% 的已鑒定小鼠富含 CNS 的 miRNA 表現(xiàn)出不同的表達模式。最近,Zaits 等人對 18 個年齡從嬰兒期到青春期的人類供體大腦的時空 miRNA 表達進行了綜合評估。使用 RNA 測序,他們報告了 miRNA 在時間(發(fā)育階段)和空間維度(前額皮質、海馬和小腦)上的表達模式。數(shù)據顯示出生后不久 miRNA 表達發(fā)生了巨大變化。值得注意的是,這些 miRNA 的大多數(shù)靶基因與轉錄調控、神經發(fā)育過程和常見的神經發(fā)育障礙有關,突出了這些 miRNA 在腦轉錄網絡中的中心功能。miRNA 表達的時間或大腦區(qū)域特異性方式可能暗示在大腦發(fā)育和神經元分化中的重要作用。

描述 miRNA 在中樞神經系統(tǒng)中作用的第一個證據來自斑馬魚的 Dicer 缺陷研究,其中發(fā)現(xiàn)動物無法產生成熟的 miRNA。Dicer 突變斑馬魚表現(xiàn)出嚴重的大腦發(fā)育異常和其他畸形,包括心臟。發(fā)現(xiàn)注入大腦豐富的 miRNA miR-430 可以挽救許多這些缺陷。在哺乳動物中,Dicer 突變小鼠在胚胎發(fā)育前 7.5 天死亡。條件性敲除皮質和海馬中的 Dicer 會導致小頭畸形的表型、樹突分支細化和樹突棘長度的改變。從那時起,有大量報道揭示了各種 miRNA 在神經元發(fā)育和分化中的作用。miRNA 在神經發(fā)生、神經保護、存活和神經精神障礙發(fā)病機制中的重要功能作用也得到了廣泛的研究和綜述。此外,據報道 miRNA 的改變與許多神經精神疾病有關。例如,小腦浦肯野神經元中的選擇性 Dicer 消耗會導致神經退行性變化,這是一種類似于進行性神經退行性疾?。ㄈ?a href='http://www.lucasfraser.com/cp/jiancejiemaliebiao/2018/599.h' target='_blank'>阿爾茨海默病帕金森病)的病理過程。更具體地說,中腦多巴胺能神經元中 Dicer 的失活導致進行性神經元死亡。這種表型通過轉染從胚胎小鼠中腦獲得的 miRNA 得到顯著挽救,這表明 miRNA 在中腦多巴胺神經元分化和存活中起重要作用。還有其他報道描述了 miRNA 對多巴胺能神經元的各種作用。佳學精神系統(tǒng)疾病基因解碼小組還報道了 miR-let-7c-5p 和 miR-3473b 通過調節(jié)小膠質細胞活化在缺血性腦損傷保護作用中的關鍵作用。鑒于 miRNA 在腦功能調節(jié)中的重要性,miRNA 的失調可能導致許多神經精神疾病的發(fā)病機制和病理過程也就不足為奇了。在這里,佳學精神系統(tǒng)疾病基因解碼將進一步討論 miRNA 在精神分裂癥中的作用。

 

3. 精神分裂癥中 miRNAs的失調

3.1精神分裂癥中 miRNA 表達的改變

許多研究使用死后腦樣本分析了 miRNA 表達譜。Perkins 等人通過定制的微陣列(miRBase 7.0 版)檢查了 13 名精神分裂癥患者死后前額葉皮層 (PFC) 中的 miRNA 譜。與 21 名精神疾病未受影響的個體相比,他們發(fā)現(xiàn) 15 種 miRNA 存在差異表達,其中 14 種 miRNA 在精神分裂癥患者中下調,1 種 miRNA(miR-106b)上調。據報道,在顳上回 (STG) 的皮質灰質中 miR-181b 顯著上調,STG 是與精神分裂癥產生幻聽有關的大腦區(qū)域。鑒定了 miR-181b 的兩個靶基因,鈣傳感器基因 visinin-like 1 (VSNL1) 和離子型谷氨酸受體亞基 (GRIA2)。同一組進一步觀察到,在 STG 和背外側前額葉皮層 (DLPFC) 的死后組織中,與精神分裂癥相關的整體 miRNA 表達顯著增加。這種 miRNA 的表達升高被認為是由于初級 miRNA 加工的升高和微處理器組件 DGCR8 的上調。然而,Berveridge 的研究數(shù)據與 Perkin 的報告不一致。在 Perkins 的研究中,一些 miRNA,如 miR-26b、miR-29c 和 miR-195 據報道下調,但在 Berveridge 的結果中發(fā)現(xiàn)上調。關于精神分裂癥中 miRNA 表達變化的報道不斷積累。然而,miRNA 表達譜的結果有些爭議。miRNA 表達數(shù)據的差異可能是由于樣本量、治療方案、性別因素和技術應用的差異,例如不同的 miRNA 提取方法和 miRBase 測試版本。此外,人腦中 miRNA 的時間表達模式也可能導致沖突結果。

為了探索 miRNA 作為生物標志物的潛在作用,幾項研究集中在精神分裂癥患者的外周血 miRNA 表達上。Gardiner 等人檢測了 112 名精神分裂癥患者和 76 名對照者外周血單個核細胞 (PBMC) 中的 miRNA 表達。他們發(fā)現(xiàn)精神分裂癥患者的 83 種 miRNA 顯著減少。70賴等人71還對精神分裂癥患者和對照組的單核白細胞中的全基因組 miRNA 表達譜進行了分析。與陰性癥狀和認知能力相關的七種 miRNA(上調:miR-34a、miR-449a、miR-564、miR-548d、miR-572 miR-652;下調:miR-432)被確定為精神分裂癥的預測性生物標志物。有趣的是,他們發(fā)現(xiàn) PBMC 中 7 種 miRNA 的表達不受住院 2 個月的影響,即使臨床癥狀有顯著改善。還應注意的是,血液中 hsa-miR-34a 和 hsa-miR-548d 的表達改變并未出現(xiàn)在腦樣本中。魏等人還篩選了更大樣本中的血漿 miRNA 譜,并確定了 8 種差異表達的 miRNA(miR-122、miR-130a、miR-130b、miR-193a-3p、miR-193b、miR-502-3p、miR-652、miR ‐886‐5p)在精神分裂癥患者中。他們還發(fā)現(xiàn),患者血漿中增加的 miR-130b 和 miR-193a-3p 水平在用阿立哌唑和利培酮治療 1 年后消失,并提出了作為精神分裂癥預后生物標志物的潛在作用。此外,Gallego 等人比較了精神分裂癥患者和健康對照者的腦脊液 (CSF) 和全血之間的 miRNA 表達譜。然而,腦脊液和血液中的 miRNA 表達水平相關性較差。盡管已經提出了精神分裂癥患者中 miRNA 的潛在生物標志物,但顯然還需要更多的研究。事實上,血清 miRNAs 測量為精神分裂癥的臨床診斷和預后提供了一種可行的方法,包括治療反應。

3.2. 精神分裂癥中 miRNA 生物發(fā)生的失調

miRNA生物發(fā)生和加工途徑的異常被認為與精神分裂癥的病理過程有關。22q11.2 缺失小鼠的產生是將精神分裂癥與失調的 miRNA 生物發(fā)生相關聯(lián)的最有力證據之一。人類 22q11.2 基因座的微缺失導致行為和認知缺陷,以及精神分裂癥的高風險。Stark 等人產生了一種攜帶與人類 22q11.2 微缺失相對應的半合子染色體缺陷的小鼠品系(Df(16)A++/- 小鼠),并觀察到小鼠的精神分裂癥樣行為。他們報道了大腦中 miRNA 生物發(fā)生的改變,并發(fā)現(xiàn)失調的生物發(fā)生是由于 Dgcr8 基因的單倍體不足,這導致精神分裂癥的異常行為和神經元缺陷。在進一步的研究中,同一組發(fā)現(xiàn)位于 22q11.2 基因座內的 Df(16)A++/- 小鼠中 miR-185 急劇減少。海馬和 PFC 中 miR-185 的減少(~70%-80%)超過了半合子缺失(~50%)的預期,并導致了樹突和脊柱發(fā)育的缺陷。miR-185 被證明可以抑制以前未知的抑制劑 Mirta22(22q11.2 微缺失的 miRNA 靶標),該抑制劑位于高爾基體中,在產前大腦中具有較高的表達。Df(16)A(+/-) 小鼠大腦中 miR-185 表達的降低導致出生后 Mirta22 的持續(xù)抑制,并導致海馬和認知功能的結構改變。斯科菲爾德等人檢查了 Dgcr8+/- 小鼠,發(fā)現(xiàn) Dgcr8 和 miRNA 的表達降低在錐體神經元成熟期間出現(xiàn)在出生后發(fā)育過程中,而不是在新生小鼠中。在 Dgcr8+/- 小鼠的 V 層錐體神經元中觀察到電生理特性改變、基底樹突復雜性降低和興奮性突觸傳遞減少。 Earls 等人報道了 Dgcr8+/- 小鼠海馬中長期增強的年齡依賴性增加。這種增加歸因于兩種 miRNA(miR-25 和 miR-185)的丟失,它們靶向 sarco(內)質網 Ca2+ ATP 酶(SERCA2)。在精神分裂癥患者的PFC和海馬的死后樣本中發(fā)現(xiàn)SERCA2的表達升高。在 22q11 缺失綜合征患者的外周白細胞中也證實了 Dgcr8 和 miR-185 的表達降低。這些發(fā)現(xiàn)表明 miRNA 與精神分裂癥之間存在致病關聯(lián)。

Dicer 是 miRNA 加工途徑中的另一個關鍵基因。斑馬魚和小鼠中 Dicer 的缺失顯示出大腦發(fā)育的嚴重缺陷。一項用于尋找精神分裂癥拷貝數(shù)變異 (CNV) 的全基因組掃描在一個個體中發(fā)現(xiàn)了包含 DICER1 基因的從頭重復。在對中國人群的病例對照分析中,據報道 DICER 中的 SNP (rs3742330) 與精神分裂癥風險高度相關。對精神分裂癥患者 DLPFC 死后腦組織的分析揭示了 Dicer 表達的上調以及 miRNA 表達的整體增加。Beveridge 等報道全球 miRNA 表達在早年處于最高水平,在青春期后顯著下降。Dicer 和 Exportin-5 也具有年齡依賴性,但與整個生命周期的 miRNA 表達無關。他們提出,在精神分裂癥中,與神經發(fā)育相關的 miRNA 在青春期后保持在高水平,而不是在正常受試者中下降到較低水平。高水平的 miRNA 表達可能導致不適當?shù)幕虺聊瑥亩鴮е戮穹至寻Y的異常行為。支持,Konopka 等人發(fā)現(xiàn)他莫昔芬誘導的 Dicer1 基因缺失成年小鼠的學習和記憶力增強。然而,當使用敲除小鼠模型時,應考慮一些因素,正如 Rajman 所指出的那樣。事實上,Dicer1 已被證明對細胞存活和胚胎發(fā)育至關重要。Dicer1基因缺失通常與大量細胞凋亡和發(fā)育異常相關,這可能使表型和與精神分裂癥的相關性復雜化。另一方面,并??非所有的 miRNA 都依賴于 Dicer。一些 miRNA 是通過多種不依賴 Drosha 和不依賴 Dicer 的機制產生的。因此,在 Dicer1 缺陷小鼠中觀察到的某些表型可能與 miRNA 的丟失沒有直接關系,并且在這些 Dicer1 敲除模型中可能會遺漏一些功能性 miRNA。應該記住,miRNA 網絡是一個復雜的調節(jié)系統(tǒng),應該謹慎解釋特定 miRNA 在 Dicer 敲除模型中表型下的功能作用。在這方面,miRNA 家族或簇可能有助于提供更容易解釋的信息。7

3.3. 精神分裂癥中miRNA相關的單核苷酸多態(tài)性

單核苷酸多態(tài)性 (SNP) 或拷貝數(shù)變異 (CNV) 是群體內常見的 DNA 序列變異,在非編碼區(qū)更頻繁地發(fā)生并導致人類疾病易感性。使用病例對照研究,已經報道了與精神分裂癥相關的 miRNA 基因的幾個 SNP。在斯堪的納維亞(丹麥和挪威)樣本中,miR-206 中的 SNP rs17578796 與精神分裂癥顯著相關。位于 pre-mir-30e 的變異 ss178077483 與漢族人群的精神分裂癥密切相關(等位基因P  = 0.00017;基因型P  = 0.00015)。渡邊等人在日本人群中復制了這種關聯(lián)。精神分裂癥患者外周白細胞中成熟 miR-30e 的表達水平顯著升高,與精神分裂癥個體 PFC 中表達增加一致。同樣在中國樣本中,來自 268 名患者和 232 名對照者的兩個 SNP(hsa-pre-mir-146a rs2910164 G>C 和 hsa-mir-499 rs3746444 T>C)被基因分型為精神分裂癥易感性。攜帶 rs3746444 CC 基因型的患者更容易出現(xiàn)幻覺和缺乏動力。然而,這兩個 SNP 與精神分裂癥之間沒有統(tǒng)計學上的顯著關聯(lián)。在 SNP rs7289941 中也觀察到負相關。最近,Yu 等人對 4384 個病例和 5770 個對照進行了精神分裂癥的兩階段 GWAS,隨后在另外 4339 個精神分裂癥病例和 7043 個漢族血統(tǒng)的對照中獨立復制了 13 個單核苷酸多態(tài)性。他們證實了三個位點,在 2p16.1(rs1051061,在 VRK2 的外顯子中)、6p22.1(在 GABBR1 的內含子中的 rs115070292)和 10q24.32(在 AS3MT 的內含子中的 rs10883795;在 ARL3 的內含子中的 rs10883765 ),與精神分裂癥顯著相關。已知這三個基因座參與 GABA 能和多巴胺能信號傳導、細胞粘附分子和髓鞘形成途徑的調節(jié)。

發(fā)夾結構指導正確的 miRNA 加工,mRNA 的 3'UTR 影響 miRNA/mRNA 相互作用。這些區(qū)域的 SNP 可能會增加疾病的風險。篩選俄羅斯人群精神分裂癥易感基因座 (22q11) 的突變發(fā)現(xiàn)了 miR-130b 基因區(qū)域 5'-上游的多態(tài)性,其中包含推定轉錄因子的 DNA 元件。然而,遺傳分析并未顯示 miR-130b 變異與精神分裂癥的統(tǒng)計學顯著關聯(lián)。Liu 等人應用了 MiRSNP 數(shù)據庫(),一組人類 SNP 在預測的 miRNA-mRNA 結合位點與精神分裂癥的 GWAS 結合,并確定了 7 個與 miRNA 相關的 SNP。在另一項研究中,對來自 425 個精神分裂癥相關基因的 3'UTR 的 803 個 SNP 進行了計算機分析 miRNA 結合的吉布斯自由能。據報道,一種未知的 SNP(GABRA6 的 rs3219151)與精神分裂癥風險的降低顯著相關。另一個 SNP rs10759 (RGS4) 干擾了 miR-124 與 RGS4 的結合,因此可能增加精神分裂癥的風險。大多數(shù) SNP 分析是在中國漢族人群中進行的。約翰等人在大量遺傳不同的北印度隊列(1017 例病例和 1073 例對照)中,研究了候選基因中的 MiRSNP 與精神分裂癥的關聯(lián)。他們報告說,五個 SNP 與遲發(fā)性運動障礙有關,十二個 SNP 與強精神分裂癥基因有關。最近,一項針對加拿大患者的全基因組調查顯示,通過排除 22q11.2 CNV,與 miRNA 重疊的罕見 CNV 富集,而 22q11.2 CNV 已知對精神分裂癥具有高度易感性。預測的 25 個 CNV 重疊 miRNA 的靶基因傾向于參與神經發(fā)育過程。這些研究表明,通過靶向精神分裂癥風險基因的 miRNA 可能導致這種復雜的神經精神疾病。

最近,miR-137初級轉錄本內含子內的多態(tài)性(rs1625579)引起了廣泛關注,發(fā)現(xiàn)其與精神分裂癥的GWAS顯著相關(P  = 1.6 × 10 -11)。幾項研究在蘇格蘭、 加拿大、澳大利亞、和中國漢族人群中復制了 miR-137 多態(tài)性與精神分裂癥樣本之間的相關性。然而,在一些病例對照研究中也報告了負相關結果。在精神分裂癥 Psychiatric GWAS Consortium 的研究中,4 個推定的靶基因(CSMD1、C10orf26、CACNA1C 和 TCF4)也被報道與精神分裂癥具有全基因組顯著相關性。熒光素酶報告測定證實了 miR-137 與這四個靶基因之間的相互作用, ZNF804A 和 CALN1發(fā)現(xiàn)了112 個相似的結果。利用生物信息學資源,揭示了幾個靶基因,包括 ERBB4、GABRA1、GRIN2A、GRM5、GSK3B、NRG2 和 HTR2C。這些基因被確定與突觸長時程增強有關,這一過程可能強調精神分裂癥患者的學習和記憶機制受損。使用功能性磁共振成像掃描,van Erp 等人報道 rs1627759 TT(miR-137 基因座)與 DLPFC 過度活躍有關,這是衡量大腦效率低下的常見指標。Guella 等人報道了 rs1625579 基因型與 miR-137 表達之間的關系他們觀察到,與對照組中的 TG 和 GG 受試者相比,純合 TT 受試者的 miR-137 表達水平較低。TT 受試者中 miR-137 水平降低對應于 miR-137 靶基因 TCF4 水平升高。在 SH-SY5Y 多巴胺能細胞系中,Strazisar 等人還證明表達 miR-137 變體導致成熟 miR-137 表達減少,并導致參與突觸發(fā)生和神經元傳遞的基因組失調。然而,Siegert 等人在攜帶變異等位基因時觀察到 miR-137 的功能增益。他們發(fā)現(xiàn) miR-137 的表達增加會導致突觸前靶基因如 complexin-1 (Cplx1)、Nsf 和 synaptotagmin-1 (Syt1) 的下調,并導致囊泡釋放受損。在體內,miR-137 功能的增加導致突觸小泡池分布的變化,苔蘚纖維長時程增強的誘導受損,并導致海馬依賴性學習和記憶的缺陷。所有這些觀察表明,改變的 miR-137 可能在精神分裂癥的病理生理學中起關鍵作用。

3.4. 精神分裂癥中的miRNA與突觸可塑性

精神分裂癥被認為是一種復雜的神經發(fā)育疾病。大量證據表明,幾種神經遞質系統(tǒng)(如多巴胺和谷氨酸)的功能障礙組裝了精神分裂癥的病理生理過程。N-甲基-D-天冬氨酸-谷氨酸 (NMDA) 受體是突觸可塑性的重要調節(jié)因子。NMDA 受體信號傳導功能減退可以改變皮層回路中興奮和抑制的平衡,并產生類似于精神分裂癥癥狀的行為。Kocerha 等人使用 NMDA 受體拮抗劑地佐西平,可以快速誘導精神分裂癥樣行為,檢測了小鼠不同腦區(qū)的 miRNA 表達。他們發(fā)現(xiàn),用急性而非慢性地佐西平治療的小鼠在 PFC 中表現(xiàn)出腦特異性 miRNA miR-219 的顯著降低。在亞型 GRN1 (NR1) 突變小鼠中也觀察到 miR-219 表達降低。用抗精神病藥物(氟哌啶醇和氯氮平)預處理可以防止地佐西平誘導的 miR-219 減少。miR-219 的一個靶點被確定為鈣/鈣調蛋白依賴性蛋白激酶 II γ 亞基 (CaMKIIγ),它是 NMDA 谷氨酸受體信號級聯(lián)的一個組成部分。抑制小鼠大腦中的 miR-219 可減少地佐西平誘導的行為反應,如過度運動和刻板印象,作為支持,據報道 miR-219 在患有精神分裂癥的死后腦組織的 DLPFC 中顯著上調。此外,發(fā)現(xiàn) miR-129 參與調節(jié)少突膠質細胞分化和髓鞘維持,表明 miR-219 在突觸結構和疾病相關功能中的重要性。Zhang 等人在一項病例對照研究中對 hsa-pri-miR-219/132/107 中的 3 個 SNP 和 NMDAR 信號通路基因(GRIN2A/2B/3A 和 CAMK2G)的 3'UTR 中的 6 個 SNP 進行了關聯(lián)分析。 1041 名精神分裂癥患者和 953 名健康對照者,證實 GRIN2B rs890 與精神分裂癥顯著相關。

腦源性神經營養(yǎng)因子(BDNF)是中樞神經系統(tǒng)中最普遍的生長因子,在大腦發(fā)育和神經元可塑性中起著至關重要的作用。越來越多的證據表明,BDNF 的失調與多種神經精神疾病有關。尸檢研究顯示,精神分裂癥患者某些腦區(qū)的 BDNF 表達水平發(fā)生了改變。梅利奧斯等人發(fā)現(xiàn)兩種miRNA,miR-30a和miR-195直接靶向BDNF 3'UTR并抑制BDNF表達。他們進一步報道了 miR-195 與 BDNF 的相互作用可以隨后調節(jié)精神分裂癥相關的 γ-氨基丁酸 (GABA),即 GABAergic 基因表達,包括神經肽 Y (NPY) 和生長抑素。miR-30a-5p 也被證明通過調節(jié) BDNF 信號通路來控制酒精攝入。

認知障礙是精神分裂癥的嚴重癥狀之一。對 242 個突觸前蛋白和 304 個突觸后蛋白的 3'UTR 分析表明,這些蛋白中有 91% 是預測的 miRNA 靶標。miR-132 在學習和記憶中的功能作用被認為與其對突觸可塑性的調節(jié)作用有關。發(fā)現(xiàn)一些與學習和記憶相關的行為任務可以快速誘導 miR-132 表達。體內敲除 miR-132 會損害微量恐懼調節(jié)范式中的記憶獲取,而轉基因小鼠模型中 miR-132 的過表達顯示神經元脊柱密度增加和新物體識別的改善。有趣的是,Hansen 小組報告說,miR-132 的輕度上調增強了小鼠的空間學習能力。然而,miR-132 表達增加超過三倍會損害學習。138雙敲除 miR-132/212 損害了空間記憶、識別記憶和新物體識別測試中的長期增強和認知功能,表明 miR-132/212 在突觸功能中的重要作用。比較 miR-132 和 miR-212 過表達小鼠和 miR-132/-212 雙敲除小鼠的海馬轉錄譜,RNA 測序結果顯示 miR-132/-212 缺失小鼠中 1138 個基因的表達增加。其中 96 個基因在過表達 miR-132 的小鼠中被下調。在過表達 miR-212 小鼠中減少的 58 個基因中,只有 4 個在雙敲除系中增加。盡管 miR-132 和 miR-212 共享一個種子序列,但這兩個 miRNA 對于 mRNA 靶向基因并沒有很大重疊,這表明轉錄譜調控的復雜、非冗余方式。

神經膠質細胞在大腦功能中起著至關重要的作用。已知改變的神經膠質功能涉及許多神經精神疾病的病理生理過程,包括精神分裂癥。先前關于精神分裂癥中 miRNA 的研究主要集中在神經元功能上,而神經膠質 miRNA 如何促進發(fā)病機制和發(fā)育在很大程度上是未知的。佳學精神系統(tǒng)疾病基因解碼最近使用 GFAP-GFP 轉基因小鼠來分析星形膠質細胞中的 miRNA,以響應急性苯環(huán)利定 (PCP) 給藥。與生理鹽水組相比,用 PCP 治療的小鼠表現(xiàn)出 miRNA 表達改變(miR-143-3p、miR-212、miR-127-3p、miR-183、miR-298、miR-381-3p、miR-338- PFC 星形膠質細胞中的 3p、miR-let-7d-3p、miR-132-3p 等)(見表 1)。在進一步的研究中,佳學精神系統(tǒng)疾病基因解碼探索了 miRNA 在精神分裂癥中的功能作用,并發(fā)現(xiàn)了 miR-143-3p 失調與 PCP 誘導的小鼠行為缺陷之間的相關性(T. Cao、P. Wang、C. Lu 和 X.Zhen,未發(fā)表數(shù)據)。

表1:小鼠前額葉皮層 (PFC) 星形膠質細胞對急性苯環(huán)利定 (PCP) 治療的反應的 MicroRNA 測序分析

成熟的 miRNA> pre-ACC 成熟序列 PCP 與對照倍數(shù)變化
PCP 與對照 2.0 倍變化 上調 miRNA
mmu-miR-212-5p MI0000696 ACCUUGGCUCUAGACUGCUUACU 4.06
mmu-miR-127-3p MI0000154 UCGGAUCCGUCUGAGCUUGGCU 2.90
mmu-miR-183-5p MI0000225 UAUGGCACUGGUAGAAUUCACU 2.48
mmu-miR-298-5p MI0000398 GGCAGAGGAGGGCUGUUCUUCCC 2.46
mmu-miR-381-3p MI0000798 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU 2.42
mmu-miR-338-3p MI0000619 UCCAGCAUCAGUGAUUUUUGUUG 2.40
mmu-let-7d-3p MI0000405 CUUACGACCUGCUGCCUUUCU 2.38
mmu-miR-132-3p MI0000158 UAACAUGCUACAGCCAUGGUCG 2.22
mmu-miR-130a-3p MI0000156 CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU 2.19
mmu-miR-744-5p MI0004124 UGCGGGGCUAGGGCUAACAGCA 2.17
mmu-miR-330-5p MI0000607 UCUCUGGGCCUGUGGUCUUAGGC 2.13
mmu-miR-335-3p MI0000817 UUUUUCAUUAUUGCUCCUGACC 2.06
mmu-miR-29c-3p MI0000577 UAGCACCAUUUGAAAUCGGUUA 2.04
mmu-miR-181a-1-3p MI0000697 ACCAUCGACCGUUGAUUGUACC 2.04
mmu-miR-872-5p MI0005549 AAGGUUACUUGUUAGUUCAGG 2.00
PCP 與對照 2.0 倍變化 下調的 miRNA
mmu-miR-143-3p MI0000257 UGAGAUGAAGCACUGUAGCUC 0.26
mmu-miR-15a-5p MI0000564 UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG 0.45
mmu-miR-1968-5p MI0009965 UGCAGCUGUUAAGGAUGGUGGACU 0.50
mmu-miR-582-3p MI0006127 UAACCUGUUGAACAACUGAAC 0.50
 

在皮下注射 PCP (4 mg/kg) 或生理鹽水作為對照后 30 分鐘迅速取出 GFAP-GFP 轉基因小鼠大腦。GFP陽性星形膠質細胞通過流式細胞儀從前額葉皮層分選。從分選的星形膠質細胞中提取 RNA 并用于制備 miRNA 測序文庫。文庫在 Illumina 流通池上捕獲,原位擴增為簇,最后按照制造商的說明在 Illumina HiSeq 上測序 36 個循環(huán)。修剪后的讀數(shù)與 miRBase pre-miRNA 對齊。將 miRNA 讀取計數(shù)標準化為每百萬 miRNA 比對的標簽計數(shù)。表中顯示了差異表達的 miRNA(PCP 與對照 > 2.0 倍變化)。

 
 

4. miRNA 療法的觀點

預計 miRNA 可調節(jié) 20%-30% 的人類基因。miRNA 參與精神疾病的許多方面使其成為潛在的候選生物標志物或臨床診斷和治療的靶標。盡管 miRNA 在腦功能中的重要性已得到充分證明,但仍需要更多的努力來了解 miRNA 調節(jié)機制的全部范圍及其在神經精神疾病中的病理作用。仍然存在的第一個挑戰(zhàn)是識別位于與精神分裂癥相關的人類基因組中的功能性 miRNA。旨在繪制人類基因組中所有功能元件圖譜的 DNA 元素百科全書項目 (ENCODE) 等項目取得了很大進展。 RNA 微陣列方法和新一代測序 (NGS) 等新型高通量技術為分析疾病中的 miRNA 轉錄譜及其靶基因提供了強大的工具。 miRNA 通過種子區(qū)域(miRNA 的 2-7 核苷酸)與靶 mRNA 3'UTR 的堿基對相互作用來調節(jié)靶基因。這種長度的序列將在整個基因組中以非常高的頻率出現(xiàn);因此,功能性 miRNA 靶位點的預測具有挑戰(zhàn)性,但將是一項關鍵任務。目前,最全面、應用最廣泛的預測程序是 TargetScan 和 PicTar。然而,他們預測的目標中有三分之二似乎對 miRNA 沒有反應。因此,肯定需要開發(fā)或繼續(xù)改進實驗工具以了解 miRNA 對靶基因的影響。

鑒于許多精神疾病中 miRNA 的異常表達,抑制或過表達 miRNA 可能是臨床治療的潛在方法。已經付出了很多努力來開發(fā)高效且無毒的寡核苷酸模擬物或反義寡核苷酸以調節(jié)miRNA表達水平。與這些努力相關的是,許多化學修飾如 2'-O-甲氧基乙基和鎖核酸 (LNA) 被開發(fā)出來以增強 RNA 的穩(wěn)定性。在非洲綠猴的肝臟中全身遞送 LNA-antimiR-212 會導致血漿總膽固醇的長期和可逆性降低,而沒有任何 LNA 相關毒性的證據。用 LNA-antimiR-212 (SPC3649) 治療感染丙型肝炎病毒 (HCV) 的黑猩猩也能長期抑制 HCV 病毒血癥,沒有證據表明動物對病毒產生耐藥性或副作用。新穎人體研究測試了一種基于 miR-16 的 miRNA 模擬物,該模擬物包裝在針對惡性胸膜間皮瘤患者的 EGFR 的 TargomiRs-EDV 中。結果表明,Targomirs 在劑量為 5 × 10 9每周使用有效地塞米松預防,耐受性良好,并伴有抗腫瘤活性的早期跡象。這是一項開放標簽研究,需要一項更大人群的隨機 2 期研究來確認觀察結果。

在探索神經療法的此類療法時,主要障礙是 CNS 中的血腦屏障 (BBB)。已經開發(fā)了幾種將藥物輸送到 CNS 的方法,以通過修飾藥物本身或將其與載體偶聯(lián)來增強治療分子穿過 BBB 的能力。用作納米遞送系統(tǒng)的外泌體介質作為遞送載體具有多種優(yōu)勢。外泌體是最小的膜泡,形狀均一,由多種哺乳動物細胞分泌。由于低免疫原性、顯著的遞送特性和穿過 BBB 的能力,外泌體被認為是 RNA 治療的有效遞送介質。外泌體是否可用于將 miRNA 遞送至中樞神經系統(tǒng)仍有待測試。Hwang 等人開發(fā)了一種大腦特異性納米載體 RVG-SSPEI(狂犬病病毒糖蛋白-二硫鍵連接的聚乙烯亞胺),可成功地將 miR-124a 遞送至小鼠大腦。其他方法,如病毒傳遞系統(tǒng)、化學修飾和結合策略、適配體和納米技術也已經過研究。盡管技術創(chuàng)新很有前景,但選擇性遞送到 CNS 仍然具有挑戰(zhàn)性。同時,這些系統(tǒng)中傳遞的 miRNAs 的功能活動難以評估。在臨床實踐中建立真正實用的miRNA治療方法還有很長的路要走。

 

五、精神分裂癥基因檢測中miRNA基因檢測的分析結論

探索 miRNA 在 CNS 中的生物發(fā)生和功能表明 miRNA 在精神分裂癥的病理生理學中起重要作用。精神分裂癥患者中 miRNA 變化的正確概況及其與預后和治療反應的關系仍然很大程度上未知。未來的工作應側重于識別特定疾病相關的 miRNA,并了解其在調節(jié)生物學途徑和病理過程中的作用的確切機制。隨著技術的進步,將miRNA靶向遞送至CNS可能為精神分裂癥等精神疾病的治療提供一種潛在的新型治療方法。

Review:CNS Neurosci Ther;. 2018 Jul;24(7):586-597. doi: 10.1111/cns.12840. Epub 2018 Mar 12.

Dysregulation of miRNA and its potential therapeutic application in schizophrenia


(責任編輯:佳學基因)
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