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【佳學(xué)基因檢測】精神分裂癥基因檢測中的miRNA檢測及miRNA藥物

盡管普遍認(rèn)為遺傳和發(fā)育因素在精神分裂癥的發(fā)病機(jī)制中起關(guān)鍵作用,但精神分裂癥的確切病因機(jī)制對(duì)于很多人來說仍然未知。在過去的幾十年中,mi RNA已成為基因表達(dá)調(diào)控中必不可少的轉(zhuǎn)錄后

佳學(xué)基因檢測】精神分裂癥基因檢測中的miRNA檢測及miRNA藥物


精神分裂癥基因檢測導(dǎo)讀

盡管普遍認(rèn)為遺傳和發(fā)育因素在精神分裂癥的發(fā)病機(jī)制中起關(guān)鍵作用,但精神分裂癥的確切病因機(jī)制對(duì)于很多人來說仍然未知。在過去的幾十年中,mi RNA已成為基因表達(dá)調(diào)控中必不可少的轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)因子。mi RNA在大腦發(fā)育和神經(jīng)可塑性中的重要性已得到公認(rèn)。已知 mi RNA的異常表達(dá)和功能障礙涉及包括精神分裂癥在內(nèi)的許多神經(jīng)精神疾病的病理生理學(xué)。在精神分裂癥基因檢測中的miRNA檢測及miRNA藥物中,佳學(xué)精神系統(tǒng)疾病基因解碼總結(jié)了精神分裂癥相關(guān)的 mi RNA失調(diào)的賊新發(fā)現(xiàn)。和在精神分裂癥的發(fā)展和發(fā)病機(jī)制中的功能作用。佳學(xué)精神系統(tǒng)疾病基因解碼還討論了 mi RNA調(diào)節(jié)在疾病中的潛在治療意義。

關(guān)鍵詞: mi RNA神經(jīng)可塑性 精神分裂癥 單核苷酸多態(tài)性
 

1、簡介

精神分裂癥是一種致殘性疾病,其特征是社會(huì)行為異常、精神障礙、思維中斷和認(rèn)知受損等復(fù)雜癥狀。它影響了全球近 1% 的人口。一般認(rèn)為,發(fā)育和環(huán)境因素之間的相互作用促成了這種疾病的發(fā)病機(jī)制;然而,確切的病因仍然未知。從病理生理學(xué)的角度來看,異常的神經(jīng)傳遞,特別是多巴胺-谷氨酸傳遞障礙和前額葉功能障礙改變可能在精神分裂癥的大多數(shù)癥狀中起重要作用。賊近出現(xiàn)的證據(jù)表明,稱為 microRNA (miRNA) 的小非編碼 RNA 參與了該疾病的發(fā)病機(jī)制和病理過程。miRNA 是一類約 22 個(gè)核苷酸的非編碼 RNA,它可以通過與靶 mRNA 互補(bǔ)堿基配對(duì)以轉(zhuǎn)錄后方式在功能上沉默基因。每個(gè) miRNA 都可以通過細(xì)胞內(nèi)基因沉默機(jī)制潛在地調(diào)節(jié)許多下游靶基因。miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)在神經(jīng)元發(fā)育和腦功能中的重要性已被廣泛研究。它的潛在作用已成為了解包括精神分裂癥在內(nèi)的許多神經(jīng)精神疾病的發(fā)病機(jī)制和發(fā)展的焦點(diǎn)。在精神分裂癥基因檢測中的miRNA檢測及miRNA藥物中,佳學(xué)精神系統(tǒng)疾病基因解碼總結(jié)了 miRNA 調(diào)控的賊新發(fā)展和精神分裂癥的潛在功能影響,強(qiáng)調(diào)了賊近發(fā)現(xiàn)的 miRNA 作為該疾病的新生物標(biāo)志物和潛在治療方法。

 

2. 中樞神經(jīng)系統(tǒng)中的 miRNA 生物發(fā)生和功能

先進(jìn)個(gè) miRNA 于 1993 年在秀麗隱桿線蟲中發(fā)現(xiàn)。第二個(gè) miRNA let-7 花了 7 年時(shí)間才被報(bào)道。自 2000 年以來,已在動(dòng)物、植物、病毒以及哺乳動(dòng)物中樞神經(jīng)系統(tǒng)中鑒定出數(shù)千種 miRNA。miRNA在細(xì)胞增殖、分化和凋亡中的功能作用已被廣泛研究。miRNA 由它們自己的基因或由編碼或非編碼基因的內(nèi)含子產(chǎn)生。與蛋白質(zhì)編碼基因一樣,miRNA 被 RNA 聚合酶 II 或 RNA 聚合酶 III 從基因組 DNA 轉(zhuǎn)錄成初級(jí)轉(zhuǎn)錄物 (pri-miRNA)。pri-miRNAs通常具有一個(gè)5' CAP和一個(gè)3' poly A尾,可以在細(xì)胞核中折疊成具有莖環(huán)結(jié)構(gòu)的雙鏈RNA發(fā)夾。脊椎動(dòng)物中含有 RNaseIII 核酸內(nèi)切酶 Drosha 和核蛋白 DGCR8(DiGeorge 綜合征關(guān)鍵區(qū)域 8)的微處理器復(fù)合物可以識(shí)別莖環(huán)結(jié)構(gòu)。在 Drosha 切割 5' CAP 和 3' poly A 尾后,釋放出 70~100 nt 發(fā)夾狀的前體 miRNA(pre-miRNA)并輸出到細(xì)胞質(zhì)中,其中 pre-miRNA 被類型切割I(lǐng)II 核糖核酸酶 Dicer 并產(chǎn)生約 22nt 雙鏈 RNA 雙鏈體:miRNA/miRNA* (如圖 1)。在展開過程中,雙鏈體的一條鏈,即成熟的 miRNA,可以加載到 RNA 誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體 (RISC) 中,而另一條鏈通常被降解。除了 miRNA,RISC 還包含 Dicer、RNA 結(jié)合蛋白 Argonaute (AGO) 和銜接蛋白 TRBP。含有 miRNA 的 RISC 能夠識(shí)別靶 mRNA 的 3'UTR 中的互補(bǔ)序列,從而導(dǎo)致靶 mRNA 的翻譯抑制或降解。miRNA 與其目標(biāo) mRNA 的識(shí)別是由賊初的 2-7 個(gè) miRNA 堿基引導(dǎo)的。由于互補(bǔ)的沉默機(jī)制,一個(gè)miRNA可以靶向數(shù)百甚至數(shù)千個(gè)mRNA,而不同的miRNA也可以與同一個(gè)mRNA結(jié)合,形成一個(gè)復(fù)雜的miRNA-基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

包含圖片、插圖等的外部文件。對(duì)象名稱為 CNS-24-586-g001.jpg
圖1:mi RNA生物發(fā)生和功能示意圖 mi RNA通過RNA聚合酶從基因組DNA轉(zhuǎn)錄成初級(jí)轉(zhuǎn)錄物 (pri-mi RNA )。Primi RNA在細(xì)胞核中被 Drosha 切割以產(chǎn)生 mi RNA前體(pre-mi RNA),然后通過 Exportin-5 輸出到細(xì)胞質(zhì)中,并進(jìn)一步被 Dicer 切割以產(chǎn)生約 22nt 雙鏈RNA雙鏈體:mi RNA /米核糖核酸*。雙鏈的一條鏈,成熟的 mi RNA可以與RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合物 ( RISC) 復(fù)合并引導(dǎo)目標(biāo)mRNA的翻譯抑制,而另一條鏈通常被降解

大約 70% 的已知 miRNA 在哺乳動(dòng)物大腦中表達(dá)。Bak等人研究了成年小鼠大腦不同區(qū)域的 miRNA 表達(dá)譜。他們檢測到 44 個(gè)顯示組織特異性富集的 miRNA,這表明 CNS miRNA 可能與相應(yīng)大腦區(qū)域內(nèi)的特定功能相關(guān)。盡管成熟的 miRNA 序列在小鼠和斑馬魚之間是保守的,但超過 50% 的已鑒定小鼠富含 CNS 的 miRNA 表現(xiàn)出不同的表達(dá)模式。賊近,Zaits 等人對(duì) 18 個(gè)年齡從嬰兒期到青春期的人類供體大腦的時(shí)空 miRNA 表達(dá)進(jìn)行了綜合評(píng)估。使用 RNA 測序,他們報(bào)告了 miRNA 在時(shí)間(發(fā)育階段)和空間維度(前額皮質(zhì)、海馬和小腦)上的表達(dá)模式。數(shù)據(jù)顯示出生后不久 miRNA 表達(dá)發(fā)生了巨大變化。值得注意的是,這些 miRNA 的大多數(shù)靶基因與轉(zhuǎn)錄調(diào)控、神經(jīng)發(fā)育過程和常見的神經(jīng)發(fā)育障礙有關(guān),突出了這些 miRNA 在腦轉(zhuǎn)錄網(wǎng)絡(luò)中的中心功能。miRNA 表達(dá)的時(shí)間或大腦區(qū)域特異性方式可能暗示在大腦發(fā)育和神經(jīng)元分化中的重要作用。

描述 miRNA 在中樞神經(jīng)系統(tǒng)中作用的先進(jìn)個(gè)證據(jù)來自斑馬魚的 Dicer 缺陷研究,其中發(fā)現(xiàn)動(dòng)物無法產(chǎn)生成熟的 miRNA。Dicer 突變斑馬魚表現(xiàn)出嚴(yán)重的大腦發(fā)育異常和其他畸形,包括心臟。發(fā)現(xiàn)注入大腦豐富的 miRNA miR-430 可以挽救許多這些缺陷。在哺乳動(dòng)物中,Dicer 突變小鼠在胚胎發(fā)育前 7.5 天死亡。條件性敲除皮質(zhì)和海馬中的 Dicer 會(huì)導(dǎo)致小頭畸形的表型、樹突分支細(xì)化和樹突棘長度的改變。從那時(shí)起,有大量報(bào)道揭示了各種 miRNA 在神經(jīng)元發(fā)育和分化中的作用。miRNA 在神經(jīng)發(fā)生、神經(jīng)保護(hù)、存活和神經(jīng)精神障礙發(fā)病機(jī)制中的重要功能作用也得到了廣泛的研究和綜述。此外,據(jù)報(bào)道 miRNA 的改變與許多神經(jīng)精神疾病有關(guān)。例如,小腦浦肯野神經(jīng)元中的選擇性 Dicer 消耗會(huì)導(dǎo)致神經(jīng)退行性變化,這是一種類似于進(jìn)行性神經(jīng)退行性疾?。ㄈ?a href='http://www.lucasfraser.com/cp/jiancejiemaliebiao/2018/599.h' target='_blank'>阿爾茨海默病帕金森病)的病理過程。更具體地說,中腦多巴胺能神經(jīng)元中 Dicer 的失活導(dǎo)致進(jìn)行性神經(jīng)元死亡。這種表型通過轉(zhuǎn)染從胚胎小鼠中腦獲得的 miRNA 得到顯著挽救,這表明 miRNA 在中腦多巴胺神經(jīng)元分化和存活中起重要作用。還有其他報(bào)道描述了 miRNA 對(duì)多巴胺能神經(jīng)元的各種作用。佳學(xué)精神系統(tǒng)疾病基因解碼小組還報(bào)道了 miR-let-7c-5p 和 miR-3473b 通過調(diào)節(jié)小膠質(zhì)細(xì)胞活化在缺血性腦損傷保護(hù)作用中的關(guān)鍵作用。鑒于 miRNA 在腦功能調(diào)節(jié)中的重要性,miRNA 的失調(diào)可能導(dǎo)致許多神經(jīng)精神疾病的發(fā)病機(jī)制和病理過程也就不足為奇了。在這里,佳學(xué)精神系統(tǒng)疾病基因解碼將進(jìn)一步討論 miRNA 在精神分裂癥中的作用。

 

3. 精神分裂癥中 miRNAs的失調(diào)

3.1精神分裂癥中 miRNA 表達(dá)的改變

許多研究使用死后腦樣本分析了 miRNA 表達(dá)譜。Perkins 等人通過定制的微陣列(miRBase 7.0 版)檢查了 13 名精神分裂癥患者死后前額葉皮層 (PFC) 中的 miRNA 譜。與 21 名精神疾病未受影響的個(gè)體相比,他們發(fā)現(xiàn) 15 種 miRNA 存在差異表達(dá),其中 14 種 miRNA 在精神分裂癥患者中下調(diào),1 種 miRNA(miR-106b)上調(diào)。據(jù)報(bào)道,在顳上回 (STG) 的皮質(zhì)灰質(zhì)中 miR-181b 顯著上調(diào),STG 是與精神分裂癥產(chǎn)生幻聽有關(guān)的大腦區(qū)域。鑒定了 miR-181b 的兩個(gè)靶基因,鈣傳感器基因 visinin-like 1 (VSNL1) 和離子型谷氨酸受體亞基 (GRIA2)。同一組進(jìn)一步觀察到,在 STG 和背外側(cè)前額葉皮層 (DLPFC) 的死后組織中,與精神分裂癥相關(guān)的整體 miRNA 表達(dá)顯著增加。這種 miRNA 的表達(dá)升高被認(rèn)為是由于初級(jí) miRNA 加工的升高和微處理器組件 DGCR8 的上調(diào)。然而,Berveridge 的研究數(shù)據(jù)與 Perkin 的報(bào)告不一致。在 Perkins 的研究中,一些 miRNA,如 miR-26b、miR-29c 和 miR-195 據(jù)報(bào)道下調(diào),但在 Berveridge 的結(jié)果中發(fā)現(xiàn)上調(diào)。關(guān)于精神分裂癥中 miRNA 表達(dá)變化的報(bào)道不斷積累。然而,miRNA 表達(dá)譜的結(jié)果有些爭議。miRNA 表達(dá)數(shù)據(jù)的差異可能是由于樣本量、治療方案、性別因素和技術(shù)應(yīng)用的差異,例如不同的 miRNA 提取方法和 miRBase 測試版本。此外,人腦中 miRNA 的時(shí)間表達(dá)模式也可能導(dǎo)致沖突結(jié)果。

為了探索 miRNA 作為生物標(biāo)志物的潛在作用,幾項(xiàng)研究集中在精神分裂癥患者的外周血 miRNA 表達(dá)上。Gardiner 等人檢測了 112 名精神分裂癥患者和 76 名對(duì)照者外周血單個(gè)核細(xì)胞 (PBMC) 中的 miRNA 表達(dá)。他們發(fā)現(xiàn)精神分裂癥患者的 83 種 miRNA 顯著減少。70賴等人71還對(duì)精神分裂癥患者和對(duì)照組的單核白細(xì)胞中的全基因組 miRNA 表達(dá)譜進(jìn)行了分析。與陰性癥狀和認(rèn)知能力相關(guān)的七種 miRNA(上調(diào):miR-34a、miR-449a、miR-564、miR-548d、miR-572 miR-652;下調(diào):miR-432)被確定為精神分裂癥的預(yù)測性生物標(biāo)志物。有趣的是,他們發(fā)現(xiàn) PBMC 中 7 種 miRNA 的表達(dá)不受住院 2 個(gè)月的影響,即使臨床癥狀有顯著改善。還應(yīng)注意的是,血液中 hsa-miR-34a 和 hsa-miR-548d 的表達(dá)改變并未出現(xiàn)在腦樣本中。魏等人還篩選了更大樣本中的血漿 miRNA 譜,并確定了 8 種差異表達(dá)的 miRNA(miR-122、miR-130a、miR-130b、miR-193a-3p、miR-193b、miR-502-3p、miR-652、miR ‐886‐5p)在精神分裂癥患者中。他們還發(fā)現(xiàn),患者血漿中增加的 miR-130b 和 miR-193a-3p 水平在用阿立哌唑和利培酮治療 1 年后消失,并提出了作為精神分裂癥預(yù)后生物標(biāo)志物的潛在作用。此外,Gallego 等人比較了精神分裂癥患者和健康對(duì)照者的腦脊液 (CSF) 和全血之間的 miRNA 表達(dá)譜。然而,腦脊液和血液中的 miRNA 表達(dá)水平相關(guān)性較差。盡管已經(jīng)提出了精神分裂癥患者中 miRNA 的潛在生物標(biāo)志物,但顯然還需要更多的研究。事實(shí)上,血清 miRNAs 測量為精神分裂癥的臨床診斷和預(yù)后提供了一種可行的方法,包括治療反應(yīng)。

3.2. 精神分裂癥中 miRNA 生物發(fā)生的失調(diào)

miRNA生物發(fā)生和加工途徑的異常被認(rèn)為與精神分裂癥的病理過程有關(guān)。22q11.2 缺失小鼠的產(chǎn)生是將精神分裂癥與失調(diào)的 miRNA 生物發(fā)生相關(guān)聯(lián)的賊有力證據(jù)之一。人類 22q11.2 基因座的微缺失導(dǎo)致行為和認(rèn)知缺陷,以及精神分裂癥的高風(fēng)險(xiǎn)。Stark 等人產(chǎn)生了一種攜帶與人類 22q11.2 微缺失相對(duì)應(yīng)的半合子染色體缺陷的小鼠品系(Df(16)A++/- 小鼠),并觀察到小鼠的精神分裂癥樣行為。他們報(bào)道了大腦中 miRNA 生物發(fā)生的改變,并發(fā)現(xiàn)失調(diào)的生物發(fā)生是由于 Dgcr8 基因的單倍體不足,這導(dǎo)致精神分裂癥的異常行為和神經(jīng)元缺陷。在進(jìn)一步的研究中,同一組發(fā)現(xiàn)位于 22q11.2 基因座內(nèi)的 Df(16)A++/- 小鼠中 miR-185 急劇減少。海馬和 PFC 中 miR-185 的減少(~70%-80%)超過了半合子缺失(~50%)的預(yù)期,并導(dǎo)致了樹突和脊柱發(fā)育的缺陷。miR-185 被證明可以抑制以前未知的抑制劑 Mirta22(22q11.2 微缺失的 miRNA 靶標(biāo)),該抑制劑位于高爾基體中,在產(chǎn)前大腦中具有較高的表達(dá)。Df(16)A(+/-) 小鼠大腦中 miR-185 表達(dá)的降低導(dǎo)致出生后 Mirta22 的持續(xù)抑制,并導(dǎo)致海馬和認(rèn)知功能的結(jié)構(gòu)改變。斯科菲爾德等人檢查了 Dgcr8+/- 小鼠,發(fā)現(xiàn) Dgcr8 和 miRNA 的表達(dá)降低在錐體神經(jīng)元成熟期間出現(xiàn)在出生后發(fā)育過程中,而不是在新生小鼠中。在 Dgcr8+/- 小鼠的 V 層錐體神經(jīng)元中觀察到電生理特性改變、基底樹突復(fù)雜性降低和興奮性突觸傳遞減少。 Earls 等人報(bào)道了 Dgcr8+/- 小鼠海馬中長期增強(qiáng)的年齡依賴性增加。這種增加歸因于兩種 miRNA(miR-25 和 miR-185)的丟失,它們靶向 sarco(內(nèi))質(zhì)網(wǎng) Ca2+ ATP 酶(SERCA2)。在精神分裂癥患者的PFC和海馬的死后樣本中發(fā)現(xiàn)SERCA2的表達(dá)升高。在 22q11 缺失綜合征患者的外周白細(xì)胞中也證實(shí)了 Dgcr8 和 miR-185 的表達(dá)降低。這些發(fā)現(xiàn)表明 miRNA 與精神分裂癥之間存在致病關(guān)聯(lián)。

Dicer 是 miRNA 加工途徑中的另一個(gè)關(guān)鍵基因。斑馬魚和小鼠中 Dicer 的缺失顯示出大腦發(fā)育的嚴(yán)重缺陷。一項(xiàng)用于尋找精神分裂癥拷貝數(shù)變異 (CNV) 的全基因組掃描在一個(gè)個(gè)體中發(fā)現(xiàn)了包含 DICER1 基因的從頭重復(fù)。在對(duì)中國人群的病例對(duì)照分析中,據(jù)報(bào)道 DICER 中的 SNP (rs3742330) 與精神分裂癥風(fēng)險(xiǎn)高度相關(guān)。對(duì)精神分裂癥患者 DLPFC 死后腦組織的分析揭示了 Dicer 表達(dá)的上調(diào)以及 miRNA 表達(dá)的整體增加。Beveridge 等報(bào)道全球 miRNA 表達(dá)在早年處于賊高水平,在青春期后顯著下降。Dicer 和 Exportin-5 也具有年齡依賴性,但與整個(gè)生命周期的 miRNA 表達(dá)無關(guān)。他們提出,在精神分裂癥中,與神經(jīng)發(fā)育相關(guān)的 miRNA 在青春期后保持在高水平,而不是在正常受試者中下降到較低水平。高水平的 miRNA 表達(dá)可能導(dǎo)致不適當(dāng)?shù)幕虺聊?,從而?dǎo)致精神分裂癥的異常行為。支持,Konopka 等人發(fā)現(xiàn)他莫昔芬誘導(dǎo)的 Dicer1 基因缺失成年小鼠的學(xué)習(xí)和記憶力增強(qiáng)。然而,當(dāng)使用敲除小鼠模型時(shí),應(yīng)考慮一些因素,正如 Rajman 所指出的那樣。事實(shí)上,Dicer1 已被證明對(duì)細(xì)胞存活和胚胎發(fā)育至關(guān)重要。Dicer1基因缺失通常與大量細(xì)胞凋亡和發(fā)育異常相關(guān),這可能使表型和與精神分裂癥的相關(guān)性復(fù)雜化。另一方面,并??非所有的 miRNA 都依賴于 Dicer。一些 miRNA 是通過多種不依賴 Drosha 和不依賴 Dicer 的機(jī)制產(chǎn)生的。因此,在 Dicer1 缺陷小鼠中觀察到的某些表型可能與 miRNA 的丟失沒有直接關(guān)系,并且在這些 Dicer1 敲除模型中可能會(huì)遺漏一些功能性 miRNA。應(yīng)該記住,miRNA 網(wǎng)絡(luò)是一個(gè)復(fù)雜的調(diào)節(jié)系統(tǒng),應(yīng)該謹(jǐn)慎解釋特定 miRNA 在 Dicer 敲除模型中表型下的功能作用。在這方面,miRNA 家族或簇可能有助于提供更容易解釋的信息。7

3.3. 精神分裂癥中miRNA相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性

單核苷酸多態(tài)性 (SNP) 或拷貝數(shù)變異 (CNV) 是群體內(nèi)常見的 DNA 序列變異,在非編碼區(qū)更頻繁地發(fā)生并導(dǎo)致人類疾病易感性。使用病例對(duì)照研究,已經(jīng)報(bào)道了與精神分裂癥相關(guān)的 miRNA 基因的幾個(gè) SNP。在斯堪的納維亞(丹麥和挪威)樣本中,miR-206 中的 SNP rs17578796 與精神分裂癥顯著相關(guān)。位于 pre-mir-30e 的變異 ss178077483 與漢族人群的精神分裂癥密切相關(guān)(等位基因P  = 0.00017;基因型P  = 0.00015)。渡邊等人在日本人群中復(fù)制了這種關(guān)聯(lián)。精神分裂癥患者外周白細(xì)胞中成熟 miR-30e 的表達(dá)水平顯著升高,與精神分裂癥個(gè)體 PFC 中表達(dá)增加一致。同樣在中國樣本中,來自 268 名患者和 232 名對(duì)照者的兩個(gè) SNP(hsa-pre-mir-146a rs2910164 G>C 和 hsa-mir-499 rs3746444 T>C)被基因分型為精神分裂癥易感性。攜帶 rs3746444 CC 基因型的患者更容易出現(xiàn)幻覺和缺乏動(dòng)力。然而,這兩個(gè) SNP 與精神分裂癥之間沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)上的顯著關(guān)聯(lián)。在 SNP rs7289941 中也觀察到負(fù)相關(guān)。賊近,Yu 等人對(duì) 4384 個(gè)病例和 5770 個(gè)對(duì)照進(jìn)行了精神分裂癥的兩階段 GWAS,隨后在另外 4339 個(gè)精神分裂癥病例和 7043 個(gè)漢族血統(tǒng)的對(duì)照中獨(dú)立復(fù)制了 13 個(gè)單核苷酸多態(tài)性。他們證實(shí)了三個(gè)位點(diǎn),在 2p16.1(rs1051061,在 VRK2 的外顯子中)、6p22.1(在 GABBR1 的內(nèi)含子中的 rs115070292)和 10q24.32(在 AS3MT 的內(nèi)含子中的 rs10883795;在 ARL3 的內(nèi)含子中的 rs10883765 ),與精神分裂癥顯著相關(guān)。已知這三個(gè)基因座參與 GABA 能和多巴胺能信號(hào)傳導(dǎo)、細(xì)胞粘附分子和髓鞘形成途徑的調(diào)節(jié)。

發(fā)夾結(jié)構(gòu)指導(dǎo)正確的 miRNA 加工,mRNA 的 3'UTR 影響 miRNA/mRNA 相互作用。這些區(qū)域的 SNP 可能會(huì)增加疾病的風(fēng)險(xiǎn)。篩選俄羅斯人群精神分裂癥易感基因座 (22q11) 的突變發(fā)現(xiàn)了 miR-130b 基因區(qū)域 5'-上游的多態(tài)性,其中包含推定轉(zhuǎn)錄因子的 DNA 元件。然而,遺傳分析并未顯示 miR-130b 變異與精神分裂癥的統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著關(guān)聯(lián)。Liu 等人應(yīng)用了 MiRSNP 數(shù)據(jù)庫(),一組人類 SNP 在預(yù)測的 miRNA-mRNA 結(jié)合位點(diǎn)與精神分裂癥的 GWAS 結(jié)合,并確定了 7 個(gè)與 miRNA 相關(guān)的 SNP。在另一項(xiàng)研究中,對(duì)來自 425 個(gè)精神分裂癥相關(guān)基因的 3'UTR 的 803 個(gè) SNP 進(jìn)行了計(jì)算機(jī)分析 miRNA 結(jié)合的吉布斯自由能。據(jù)報(bào)道,一種未知的 SNP(GABRA6 的 rs3219151)與精神分裂癥風(fēng)險(xiǎn)的降低顯著相關(guān)。另一個(gè) SNP rs10759 (RGS4) 干擾了 miR-124 與 RGS4 的結(jié)合,因此可能增加精神分裂癥的風(fēng)險(xiǎn)。大多數(shù) SNP 分析是在中國漢族人群中進(jìn)行的。約翰等人在大量遺傳不同的北印度隊(duì)列(1017 例病例和 1073 例對(duì)照)中,研究了候選基因中的 MiRSNP 與精神分裂癥的關(guān)聯(lián)。他們報(bào)告說,五個(gè) SNP 與遲發(fā)性運(yùn)動(dòng)障礙有關(guān),十二個(gè) SNP 與強(qiáng)精神分裂癥基因有關(guān)。賊近,一項(xiàng)針對(duì)加拿大患者的全基因組調(diào)查顯示,通過排除 22q11.2 CNV,與 miRNA 重疊的罕見 CNV 富集,而 22q11.2 CNV 已知對(duì)精神分裂癥具有高度易感性。預(yù)測的 25 個(gè) CNV 重疊 miRNA 的靶基因傾向于參與神經(jīng)發(fā)育過程。這些研究表明,通過靶向精神分裂癥風(fēng)險(xiǎn)基因的 miRNA 可能導(dǎo)致這種復(fù)雜的神經(jīng)精神疾病。

賊近,miR-137初級(jí)轉(zhuǎn)錄本內(nèi)含子內(nèi)的多態(tài)性(rs1625579)引起了廣泛關(guān)注,發(fā)現(xiàn)其與精神分裂癥的GWAS顯著相關(guān)(P  = 1.6 × 10 -11)。幾項(xiàng)研究在蘇格蘭、 加拿大、澳大利亞、和中國漢族人群中復(fù)制了 miR-137 多態(tài)性與精神分裂癥樣本之間的相關(guān)性。然而,在一些病例對(duì)照研究中也報(bào)告了負(fù)相關(guān)結(jié)果。在精神分裂癥 Psychiatric GWAS Consortium 的研究中,4 個(gè)推定的靶基因(CSMD1、C10orf26、CACNA1C 和 TCF4)也被報(bào)道與精神分裂癥具有全基因組顯著相關(guān)性。熒光素酶報(bào)告測定證實(shí)了 miR-137 與這四個(gè)靶基因之間的相互作用, ZNF804A 和 CALN1發(fā)現(xiàn)了112 個(gè)相似的結(jié)果。利用生物信息學(xué)資源,揭示了幾個(gè)靶基因,包括 ERBB4、GABRA1、GRIN2A、GRM5、GSK3B、NRG2 和 HTR2C。這些基因被確定與突觸長時(shí)程增強(qiáng)有關(guān),這一過程可能強(qiáng)調(diào)精神分裂癥患者的學(xué)習(xí)和記憶機(jī)制受損。使用功能性磁共振成像掃描,van Erp 等人報(bào)道 rs1627759 TT(miR-137 基因座)與 DLPFC 過度活躍有關(guān),這是衡量大腦效率低下的常見指標(biāo)。Guella 等人報(bào)道了 rs1625579 基因型與 miR-137 表達(dá)之間的關(guān)系他們觀察到,與對(duì)照組中的 TG 和 GG 受試者相比,純合 TT 受試者的 miR-137 表達(dá)水平較低。TT 受試者中 miR-137 水平降低對(duì)應(yīng)于 miR-137 靶基因 TCF4 水平升高。在 SH-SY5Y 多巴胺能細(xì)胞系中,Strazisar 等人還證明表達(dá) miR-137 變體導(dǎo)致成熟 miR-137 表達(dá)減少,并導(dǎo)致參與突觸發(fā)生和神經(jīng)元傳遞的基因組失調(diào)。然而,Siegert 等人在攜帶變異等位基因時(shí)觀察到 miR-137 的功能增益。他們發(fā)現(xiàn) miR-137 的表達(dá)增加會(huì)導(dǎo)致突觸前靶基因如 complexin-1 (Cplx1)、Nsf 和 synaptotagmin-1 (Syt1) 的下調(diào),并導(dǎo)致囊泡釋放受損。在體內(nèi),miR-137 功能的增加導(dǎo)致突觸小泡池分布的變化,苔蘚纖維長時(shí)程增強(qiáng)的誘導(dǎo)受損,并導(dǎo)致海馬依賴性學(xué)習(xí)和記憶的缺陷。所有這些觀察表明,改變的 miR-137 可能在精神分裂癥的病理生理學(xué)中起關(guān)鍵作用。

3.4. 精神分裂癥中的miRNA與突觸可塑性

精神分裂癥被認(rèn)為是一種復(fù)雜的神經(jīng)發(fā)育疾病。大量證據(jù)表明,幾種神經(jīng)遞質(zhì)系統(tǒng)(如多巴胺和谷氨酸)的功能障礙組裝了精神分裂癥的病理生理過程。N-甲基-D-天冬氨酸-谷氨酸 (NMDA) 受體是突觸可塑性的重要調(diào)節(jié)因子。NMDA 受體信號(hào)傳導(dǎo)功能減退可以改變皮層回路中興奮和抑制的平衡,并產(chǎn)生類似于精神分裂癥癥狀的行為。Kocerha 等人使用 NMDA 受體拮抗劑地佐西平,可以快速誘導(dǎo)精神分裂癥樣行為,檢測了小鼠不同腦區(qū)的 miRNA 表達(dá)。他們發(fā)現(xiàn),用急性而非慢性地佐西平治療的小鼠在 PFC 中表現(xiàn)出腦特異性 miRNA miR-219 的顯著降低。在亞型 GRN1 (NR1) 突變小鼠中也觀察到 miR-219 表達(dá)降低。用抗精神病藥物(氟哌啶醇和氯氮平)預(yù)處理可以防止地佐西平誘導(dǎo)的 miR-219 減少。miR-219 的一個(gè)靶點(diǎn)被確定為鈣/鈣調(diào)蛋白依賴性蛋白激酶 II γ 亞基 (CaMKIIγ),它是 NMDA 谷氨酸受體信號(hào)級(jí)聯(lián)的一個(gè)組成部分。抑制小鼠大腦中的 miR-219 可減少地佐西平誘導(dǎo)的行為反應(yīng),如過度運(yùn)動(dòng)和刻板印象,作為支持,據(jù)報(bào)道 miR-219 在患有精神分裂癥的死后腦組織的 DLPFC 中顯著上調(diào)。此外,發(fā)現(xiàn) miR-129 參與調(diào)節(jié)少突膠質(zhì)細(xì)胞分化和髓鞘維持,表明 miR-219 在突觸結(jié)構(gòu)和疾病相關(guān)功能中的重要性。Zhang 等人在一項(xiàng)病例對(duì)照研究中對(duì) hsa-pri-miR-219/132/107 中的 3 個(gè) SNP 和 NMDAR 信號(hào)通路基因(GRIN2A/2B/3A 和 CAMK2G)的 3'UTR 中的 6 個(gè) SNP 進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析。 1041 名精神分裂癥患者和 953 名健康對(duì)照者,證實(shí) GRIN2B rs890 與精神分裂癥顯著相關(guān)。

腦源性神經(jīng)營養(yǎng)因子(BDNF)是中樞神經(jīng)系統(tǒng)中賊普遍的生長因子,在大腦發(fā)育和神經(jīng)元可塑性中起著至關(guān)重要的作用。越來越多的證據(jù)表明,BDNF 的失調(diào)與多種神經(jīng)精神疾病有關(guān)。尸檢研究顯示,精神分裂癥患者某些腦區(qū)的 BDNF 表達(dá)水平發(fā)生了改變。梅利奧斯等人發(fā)現(xiàn)兩種miRNA,miR-30a和miR-195直接靶向BDNF 3'UTR并抑制BDNF表達(dá)。他們進(jìn)一步報(bào)道了 miR-195 與 BDNF 的相互作用可以隨后調(diào)節(jié)精神分裂癥相關(guān)的 γ-氨基丁酸 (GABA),即 GABAergic 基因表達(dá),包括神經(jīng)肽 Y (NPY) 和生長抑素。miR-30a-5p 也被證明通過調(diào)節(jié) BDNF 信號(hào)通路來控制酒精攝入。

認(rèn)知障礙是精神分裂癥的嚴(yán)重癥狀之一。對(duì) 242 個(gè)突觸前蛋白和 304 個(gè)突觸后蛋白的 3'UTR 分析表明,這些蛋白中有 91% 是預(yù)測的 miRNA 靶標(biāo)。miR-132 在學(xué)習(xí)和記憶中的功能作用被認(rèn)為與其對(duì)突觸可塑性的調(diào)節(jié)作用有關(guān)。發(fā)現(xiàn)一些與學(xué)習(xí)和記憶相關(guān)的行為任務(wù)可以快速誘導(dǎo) miR-132 表達(dá)。體內(nèi)敲除 miR-132 會(huì)損害微量恐懼調(diào)節(jié)范式中的記憶獲取,而轉(zhuǎn)基因小鼠模型中 miR-132 的過表達(dá)顯示神經(jīng)元脊柱密度增加和新物體識(shí)別的改善。有趣的是,Hansen 小組報(bào)告說,miR-132 的輕度上調(diào)增強(qiáng)了小鼠的空間學(xué)習(xí)能力。然而,miR-132 表達(dá)增加超過三倍會(huì)損害學(xué)習(xí)。138雙敲除 miR-132/212 損害了空間記憶、識(shí)別記憶和新物體識(shí)別測試中的長期增強(qiáng)和認(rèn)知功能,表明 miR-132/212 在突觸功能中的重要作用。比較 miR-132 和 miR-212 過表達(dá)小鼠和 miR-132/-212 雙敲除小鼠的海馬轉(zhuǎn)錄譜,RNA 測序結(jié)果顯示 miR-132/-212 缺失小鼠中 1138 個(gè)基因的表達(dá)增加。其中 96 個(gè)基因在過表達(dá) miR-132 的小鼠中被下調(diào)。在過表達(dá) miR-212 小鼠中減少的 58 個(gè)基因中,只有 4 個(gè)在雙敲除系中增加。盡管 miR-132 和 miR-212 共享一個(gè)種子序列,但這兩個(gè) miRNA 對(duì)于 mRNA 靶向基因并沒有很大重疊,這表明轉(zhuǎn)錄譜調(diào)控的復(fù)雜、非冗余方式。

神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞在大腦功能中起著至關(guān)重要的作用。已知改變的神經(jīng)膠質(zhì)功能涉及許多神經(jīng)精神疾病的病理生理過程,包括精神分裂癥。先前關(guān)于精神分裂癥中 miRNA 的研究主要集中在神經(jīng)元功能上,而神經(jīng)膠質(zhì) miRNA 如何促進(jìn)發(fā)病機(jī)制和發(fā)育在很大程度上是未知的。佳學(xué)精神系統(tǒng)疾病基因解碼賊近使用 GFAP-GFP 轉(zhuǎn)基因小鼠來分析星形膠質(zhì)細(xì)胞中的 miRNA,以響應(yīng)急性苯環(huán)利定 (PCP) 給藥。與生理鹽水組相比,用 PCP 治療的小鼠表現(xiàn)出 miRNA 表達(dá)改變(miR-143-3p、miR-212、miR-127-3p、miR-183、miR-298、miR-381-3p、miR-338- PFC 星形膠質(zhì)細(xì)胞中的 3p、miR-let-7d-3p、miR-132-3p 等)(見表 1)。在進(jìn)一步的研究中,佳學(xué)精神系統(tǒng)疾病基因解碼探索了 miRNA 在精神分裂癥中的功能作用,并發(fā)現(xiàn)了 miR-143-3p 失調(diào)與 PCP 誘導(dǎo)的小鼠行為缺陷之間的相關(guān)性(T. Cao、P. Wang、C. Lu 和 X.Zhen,未發(fā)表數(shù)據(jù))。

表1:小鼠前額葉皮層 (PFC) 星形膠質(zhì)細(xì)胞對(duì)急性苯環(huán)利定 (PCP) 治療的反應(yīng)的 MicroRNA 測序分析

成熟的 miRNA> pre-ACC 成熟序列 PCP 與對(duì)照倍數(shù)變化
PCP 與對(duì)照 2.0 倍變化 上調(diào) miRNA
mmu-miR-212-5p MI0000696 ACCUUGGCUCUAGACUGCUUACU 4.06
mmu-miR-127-3p MI0000154 UCGGAUCCGUCUGAGCUUGGCU 2.90
mmu-miR-183-5p MI0000225 UAUGGCACUGGUAGAAUUCACU 2.48
mmu-miR-298-5p MI0000398 GGCAGAGGAGGGCUGUUCUUCCC 2.46
mmu-miR-381-3p MI0000798 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU 2.42
mmu-miR-338-3p MI0000619 UCCAGCAUCAGUGAUUUUUGUUG 2.40
mmu-let-7d-3p MI0000405 CUUACGACCUGCUGCCUUUCU 2.38
mmu-miR-132-3p MI0000158 UAACAUGCUACAGCCAUGGUCG 2.22
mmu-miR-130a-3p MI0000156 CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU 2.19
mmu-miR-744-5p MI0004124 UGCGGGGCUAGGGCUAACAGCA 2.17
mmu-miR-330-5p MI0000607 UCUCUGGGCCUGUGGUCUUAGGC 2.13
mmu-miR-335-3p MI0000817 UUUUUCAUUAUUGCUCCUGACC 2.06
mmu-miR-29c-3p MI0000577 UAGCACCAUUUGAAAUCGGUUA 2.04
mmu-miR-181a-1-3p MI0000697 ACCAUCGACCGUUGAUUGUACC 2.04
mmu-miR-872-5p MI0005549 AAGGUUACUUGUUAGUUCAGG 2.00
PCP 與對(duì)照 2.0 倍變化 下調(diào)的 miRNA
mmu-miR-143-3p MI0000257 UGAGAUGAAGCACUGUAGCUC 0.26
mmu-miR-15a-5p MI0000564 UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG 0.45
mmu-miR-1968-5p MI0009965 UGCAGCUGUUAAGGAUGGUGGACU 0.50
mmu-miR-582-3p MI0006127 UAACCUGUUGAACAACUGAAC 0.50
 

在皮下注射 PCP (4 mg/kg) 或生理鹽水作為對(duì)照后 30 分鐘迅速取出 GFAP-GFP 轉(zhuǎn)基因小鼠大腦。GFP陽性星形膠質(zhì)細(xì)胞通過流式細(xì)胞儀從前額葉皮層分選。從分選的星形膠質(zhì)細(xì)胞中提取 RNA 并用于制備 miRNA 測序文庫。文庫在 Illumina 流通池上捕獲,原位擴(kuò)增為簇,賊后按照制造商的說明在 Illumina HiSeq 上測序 36 個(gè)循環(huán)。修剪后的讀數(shù)與 miRBase pre-miRNA 對(duì)齊。將 miRNA 讀取計(jì)數(shù)標(biāo)準(zhǔn)化為每百萬 miRNA 比對(duì)的標(biāo)簽計(jì)數(shù)。表中顯示了差異表達(dá)的 miRNA(PCP 與對(duì)照 > 2.0 倍變化)。

 
 

4. miRNA 療法的觀點(diǎn)

預(yù)計(jì) miRNA 可調(diào)節(jié) 20%-30% 的人類基因。miRNA 參與精神疾病的許多方面使其成為潛在的候選生物標(biāo)志物或臨床診斷和治療的靶標(biāo)。盡管 miRNA 在腦功能中的重要性已得到充分證明,但仍需要更多的努力來了解 miRNA 調(diào)節(jié)機(jī)制的全部范圍及其在神經(jīng)精神疾病中的病理作用。仍然存在的先進(jìn)個(gè)挑戰(zhàn)是識(shí)別位于與精神分裂癥相關(guān)的人類基因組中的功能性 miRNA。旨在繪制人類基因組中所有功能元件圖譜的 DNA 元素百科全書項(xiàng)目 (ENCODE) 等項(xiàng)目取得了很大進(jìn)展。 RNA 微陣列方法和新一代測序 (NGS) 等新型高通量技術(shù)為分析疾病中的 miRNA 轉(zhuǎn)錄譜及其靶基因提供了強(qiáng)大的工具。 miRNA 通過種子區(qū)域(miRNA 的 2-7 核苷酸)與靶 mRNA 3'UTR 的堿基對(duì)相互作用來調(diào)節(jié)靶基因。這種長度的序列將在整個(gè)基因組中以非常高的頻率出現(xiàn);因此,功能性 miRNA 靶位點(diǎn)的預(yù)測具有挑戰(zhàn)性,但將是一項(xiàng)關(guān)鍵任務(wù)。目前,賊全面、應(yīng)用賊廣泛的預(yù)測程序是 TargetScan 和 PicTar。然而,他們預(yù)測的目標(biāo)中有三分之二似乎對(duì) miRNA 沒有反應(yīng)。因此,肯定需要開發(fā)或繼續(xù)改進(jìn)實(shí)驗(yàn)工具以了解 miRNA 對(duì)靶基因的影響。

鑒于許多精神疾病中 miRNA 的異常表達(dá),抑制或過表達(dá) miRNA 可能是臨床治療的潛在方法。已經(jīng)付出了很多努力來開發(fā)高效且無毒的寡核苷酸模擬物或反義寡核苷酸以調(diào)節(jié)miRNA表達(dá)水平。與這些努力相關(guān)的是,許多化學(xué)修飾如 2'-O-甲氧基乙基和鎖核酸 (LNA) 被開發(fā)出來以增強(qiáng) RNA 的穩(wěn)定性。在非洲綠猴的肝臟中全身遞送 LNA-antimiR-212 會(huì)導(dǎo)致血漿總膽固醇的長期和可逆性降低,而沒有任何 LNA 相關(guān)毒性的證據(jù)。用 LNA-antimiR-212 (SPC3649) 治療感染丙型肝炎病毒 (HCV) 的黑猩猩也能長期抑制 HCV 病毒血癥,沒有證據(jù)表明動(dòng)物對(duì)病毒產(chǎn)生耐藥性或副作用。新穎人體研究測試了一種基于 miR-16 的 miRNA 模擬物,該模擬物包裝在針對(duì)惡性胸膜間皮瘤患者的 EGFR 的 TargomiRs-EDV 中。結(jié)果表明,Targomirs 在劑量為 5 × 10 9每周使用有效地塞米松預(yù)防,耐受性良好,并伴有抗腫瘤活性的早期跡象。這是一項(xiàng)開放標(biāo)簽研究,需要一項(xiàng)更大人群的隨機(jī) 2 期研究來確認(rèn)觀察結(jié)果。

在探索神經(jīng)療法的此類療法時(shí),主要障礙是 CNS 中的血腦屏障 (BBB)。已經(jīng)開發(fā)了幾種將藥物輸送到 CNS 的方法,以通過修飾藥物本身或?qū)⑵渑c載體偶聯(lián)來增強(qiáng)治療分子穿過 BBB 的能力。用作納米遞送系統(tǒng)的外泌體介質(zhì)作為遞送載體具有多種優(yōu)勢。外泌體是賊小的膜泡,形狀均一,由多種哺乳動(dòng)物細(xì)胞分泌。由于低免疫原性、顯著的遞送特性和穿過 BBB 的能力,外泌體被認(rèn)為是 RNA 治療的有效遞送介質(zhì)。外泌體是否可用于將 miRNA 遞送至中樞神經(jīng)系統(tǒng)仍有待測試。Hwang 等人開發(fā)了一種大腦特異性納米載體 RVG-SSPEI(狂犬病病毒糖蛋白-二硫鍵連接的聚乙烯亞胺),可成功地將 miR-124a 遞送至小鼠大腦。其他方法,如病毒傳遞系統(tǒng)、化學(xué)修飾和結(jié)合策略、適配體和納米技術(shù)也已經(jīng)過研究。盡管技術(shù)創(chuàng)新很有前景,但選擇性遞送到 CNS 仍然具有挑戰(zhàn)性。同時(shí),這些系統(tǒng)中傳遞的 miRNAs 的功能活動(dòng)難以評(píng)估。在臨床實(shí)踐中建立真正實(shí)用的miRNA治療方法還有很長的路要走。

 

五、精神分裂癥基因檢測中miRNA基因檢測的分析結(jié)論

探索 miRNA 在 CNS 中的生物發(fā)生和功能表明 miRNA 在精神分裂癥的病理生理學(xué)中起重要作用。精神分裂癥患者中 miRNA 變化的正確概況及其與預(yù)后和治療反應(yīng)的關(guān)系仍然很大程度上未知。未來的工作應(yīng)側(cè)重于識(shí)別特定疾病相關(guān)的 miRNA,并了解其在調(diào)節(jié)生物學(xué)途徑和病理過程中的作用的確切機(jī)制。隨著技術(shù)的進(jìn)步,將miRNA靶向遞送至CNS可能為精神分裂癥等精神疾病的治療提供一種潛在的新型治療方法。

Review:CNS Neurosci Ther;. 2018 Jul;24(7):586-597. doi: 10.1111/cns.12840. Epub 2018 Mar 12.

Dysregulation of miRNA and its potential therapeutic application in schizophrenia


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