【佳學(xué)基因檢測】神經(jīng)內(nèi)分泌前列腺癌的長鏈非編碼 RNA 基因檢測及其臨床意義

腫瘤基因檢測需要多長時間香港

根據(jù)前列腺基因檢測項目的劃分及其檢測位點，腫瘤基因檢測項目分析和體會《PLoS Pathog》在 2021 Nov; 17(11): e1010088發(fā)表的一篇題目為《神經(jīng)內(nèi)分泌前列腺癌的長鏈非編碼 RNA 及其臨床意義》腫瘤致病基因鑒定及靶向藥物靶點選擇基因檢測臨床研究文章。該研究由Akhila Bettadapur, Formal analysis, Investigation, Visualization, Writing – original draft,  Samuel S. Hunter, Data curation, Formal analysis, Software, Visualization, Writing – original draft,  , ¤a Rene L. Suleiman, Formal analysis, Investigation, Visualization,  Maura C. Ruyechan, Formal analysis, Investigation,  Wesley Huang, Formal analysis, Investigation,  Charles G. Barbieri, Formal analysis, Investigation,  , ¤b Hannah W. Miller, Formal analysis, Investigation, Visualization,  Tammie S. Y. Tam, Investigation,  Matthew L. Settles, Resources, Supervision,  , ¤c and Katherine S. Ralston, Conceptualization, Formal analysis, Funding acquisition, Investigation, Project administration, Supervision, Visualization, Writing – original draft  ,等完成。用臨床及基礎(chǔ)科研數(shù)據(jù)詳細分析了長鏈接非編碼RNA基因檢測對前列腺癌致病基因及藥物靶點尋找的臨床意義。

前列腺靶向藥物及正確治療臨床研究內(nèi)容關(guān)鍵詞：

神經(jīng)內(nèi)分泌前列腺癌,轉(zhuǎn)分化,小細胞癌,長鏈非編碼RNA

前列腺癌腫瘤靶向治療基因檢測臨床應(yīng)用結(jié)果

背景：治療誘導(dǎo)的神經(jīng)內(nèi)分泌前列腺癌 (tNEPC) 是晚期轉(zhuǎn)移性去勢抵抗性前列腺癌的一種侵襲性變體，通常通過神經(jīng)內(nèi)分泌轉(zhuǎn)分化 (NEtD) 發(fā)生。治療選擇有限、無效，并且對于大多數(shù)患者而言，會在不到一年的時間內(nèi)導(dǎo)致死亡。我們之前開發(fā)了 NEtD 的先進個現(xiàn)場患者衍生異種移植 (PDX) 模型。該模型的縱向深度轉(zhuǎn)錄組分析能夠監(jiān)測 NETD 期間和雄激素剝奪情況下的動態(tài)轉(zhuǎn)錄變化。長鏈非編碼 RNA (lncRNA) 與癌癥有關(guān)，它們可以控制基因調(diào)控。到目前為止，尚未探索 NETD 期間 lncRNA 的表達及其臨床關(guān)聯(lián)。結(jié)果：我們實施了下一代序列分析管道，可以檢測低表達水平的轉(zhuǎn)錄本，并建立了 lncRNA 的全基因組目錄 (n = 37,749)。我們將該管道應(yīng)用于 927 個臨床樣本和我們的高保真 NETD 模型 LTL331，并在 NEPC 中鑒定了 821 個 lncRNA。其中有 122 個 lncRNA，可將 NEPC 與前列腺腺癌 (AD) 患者腫瘤區(qū)分開來。該特征中表達賊高的 lncRNA 是 H19、LINC00617 和 SSTR5-AS1。另外 742 個與 NEtD 過程相關(guān)，在我們的 PDX 模型和臨床樣本中屬于四種不同的表達模式（NEtD lncRNA I、II、III 和 IV 類）。每個類別在其序列中對轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點 (TFBS) 基序具有顯著性（z-scores >2）和獨特的富集。富集的 TFBS 包括 (1) I 類中的 TP53 和 BRN1，(2) II 類中的 ELF5、SPIC 和 HOXD1，(3) III 類中的 SPDEF，(4) IV 類中的 HSF1 和 FOXA1，以及 (5) TWIST1，當(dāng)將 III 類與 IV 類合并。還鑒定了所有 NETD lncRNA 中的常見 TFBS，包括 E2F、REST、PAX5、PAX9 和 STAF。對治好性前列腺切除術(shù)腺癌樣本中賊放松管制的候選者（n = 100）進行的長期隨訪（中位時間為 18 年）的詢問揭示了顯著的臨床病理學(xué)關(guān)聯(lián)。具體來說，我們確定了 25 個與雄激素剝奪治療 (ADT) 后快速轉(zhuǎn)移相關(guān)的疾病。其中兩個 lncRNA（SSTR5-AS1 和 LINC00514）根據(jù)患者結(jié)果對接受 ADT 的患者進行分層。討論迄今為止，尚未對 NETD 過程中 lncRNA 的動態(tài)景觀進行全面表征。基于 PDX 的 NETD 模型的時間分析新穎提供了這種動態(tài)環(huán)境。 TFBS 分析確定了 NEtD lncRNA 序列中存在的與 NEPC 相關(guān)的 TF 基序，表明這些 lncRNA 在 NEPC 發(fā)病機制中的功能作用。此外，選擇的 NEtD lncRNA 似乎與轉(zhuǎn)移和接受 ADT 的患者有關(guān)。治療相關(guān)的轉(zhuǎn)移是 NEPC 腫瘤的臨床后果。本研究中確定的先進候選 lncRNA FENDRR、H19、LINC00514、LINC00617 和 SSTR5-AS1 與 NEPC 的發(fā)展有關(guān)。我們在這里新穎展示了一個全基因組的 NEtD lncRNA 目錄，這些目錄表征了轉(zhuǎn)分化過程和強大的 NEPC lncRNA 患者表達特征。為此，我們進行了賊大的綜合研究，將 PDX NETD 模型應(yīng)用于臨床樣本。這些 NEtD 和 NEPC lncRNA 是臨床生物標(biāo)志物和治療靶點的有力候選者，值得進一步研究。關(guān)鍵詞：神經(jīng)內(nèi)分泌前列腺癌，轉(zhuǎn)分化，小細胞癌，長鏈非編碼 RNA

神經(jīng)內(nèi)分泌型前列腺癌發(fā)生與反復(fù)轉(zhuǎn)移國際數(shù)據(jù)庫描述：

 neuroendocrine prostate cancer, transdifferentiation, small cell carcinoma, long non-coding RNA