【佳學(xué)基因檢測(cè)】透明細(xì)胞肉瘤的靶向藥物基因檢測(cè)靶點(diǎn)：EWSR1-ATF1

清細(xì)胞肉瘤是一種罕見但極具侵襲性的惡性腫瘤,沒有有效的治療方法,其特征是表達(dá)融合基因EWSR1::ATF1。腫瘤基因解碼通過(guò)高通量藥物篩選發(fā)現(xiàn),組蛋白脫乙酰酶抑制劑沃利那司(vorinostat)可抑制腫瘤細(xì)胞增殖,并降低EWSR1::ATF1的表達(dá)。部分基因檢測(cè)機(jī)構(gòu)認(rèn)為EWSR1::ATF1表達(dá)降低是由于染色質(zhì)訪問(wèn)性改變所致,然而ATAC-seq和CUT&RUN分析顯示,盡管EWSR1::ATF1啟動(dòng)子區(qū)域組蛋白發(fā)生脫乙酰,但染色質(zhì)結(jié)構(gòu)僅有輕微改變。另外,腫瘤基因解碼發(fā)現(xiàn)沃利那司處理可降低溴結(jié)構(gòu)域蛋白BRD4在EWSR1::ATF1啟動(dòng)子區(qū)域的水平。此外,BRD4抑制劑JQ1也可降低EWSR1::ATF1的表達(dá)。腫瘤基因解碼的motif分析顯示,沃利那司處理抑制了轉(zhuǎn)錄因子SOX10,后者直接調(diào)控EWSR1::ATF1的表達(dá),參與清細(xì)胞肉瘤的增殖。重要的是,腫瘤基因解碼證明沃利那司和JQ1的聯(lián)合用藥可協(xié)同增強(qiáng)抗增殖效應(yīng)和抑制EWSR1::ATF1。這些結(jié)果揭示了通過(guò)表觀遺傳學(xué)藥物實(shí)現(xiàn)融合基因抑制的新機(jī)制,為融合基因相關(guān)腫瘤的治療提供了潛在新靶點(diǎn)。

意義:腫瘤基因解碼揭示了組蛋白脫乙酰酶抑制劑可通過(guò)表觀遺傳學(xué)和轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制抑制清細(xì)胞肉瘤的融合基因EWSR1::ATF1的表達(dá),并確定SOX10是調(diào)控EWSR1::ATF1表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子。

透明細(xì)胞肉瘤的基因解碼對(duì)清細(xì)胞肉瘤的診斷和治療有以下幾點(diǎn)幫助:

確認(rèn)了組蛋白脫乙酰酶抑制劑(如沃利那司)可以下調(diào)清細(xì)胞肉瘤的融合基因EWSR1::ATF1的表達(dá)。這為清細(xì)胞肉瘤的靶向治療提供了潛在的藥物選擇。

發(fā)現(xiàn)了BRD4抑制劑JQ1也可以下調(diào)EWSR1::ATF1的表達(dá)。為清細(xì)胞肉瘤藥物治療提供了另一個(gè)潛在靶點(diǎn)。

證實(shí)了SOX10是調(diào)控EWSR1::ATF1表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子。SOX10可能也是一個(gè)治療靶點(diǎn)。

顯示沃利那司聯(lián)合JQ1可協(xié)同增強(qiáng)對(duì)EWSR1::ATF1的抑制。為清細(xì)胞肉瘤的聯(lián)合靶向治療提供了理論依據(jù)。

EWSR1::ATF1是清細(xì)胞肉瘤的特征性融合基因。該研究揭示的對(duì)EWSR1::ATF1的表觀遺傳學(xué)調(diào)控機(jī)制,有助于腫瘤基因解碼更好地理解這一融合基因在腫瘤發(fā)生中的作用。

這項(xiàng)研究為通過(guò)表觀遺傳學(xué)途徑抑制腫瘤特征性融合基因提供了范例,可為其他融合基因相關(guān)腫瘤的治療提供參考。

研究為清細(xì)胞肉瘤的正確診斷和治療提供了理論基礎(chǔ)和新策略。
 

腫瘤基因檢測(cè)增加EWSR1::ATF1是否增加了腫瘤基因檢測(cè)的全面性和正確性？

在清細(xì)胞肉瘤的基因檢測(cè)中增加EWSR1::ATF1fusion基因的檢測(cè)可以提高檢測(cè)的全面性和正確性:

EWSR1::ATF1是清細(xì)胞肉瘤的特征性遺傳學(xué)標(biāo)志和致病驅(qū)動(dòng)事件。檢測(cè)EWSR1::ATF1可以幫助明確診斷。

大多數(shù)清細(xì)胞肉瘤表達(dá)EWSR1::ATF1。增加該項(xiàng)檢測(cè)可以提高檢出率,避免漏診。

EWSR1::ATF1可以通過(guò)多種技術(shù)檢測(cè),如RT-PCR、FISH等。結(jié)合使用可以提高檢測(cè)靈敏度。

EWSR1::ATF1水平的高低與預(yù)后相關(guān)。動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)可以評(píng)估病情和指導(dǎo)治療。

EWSR1::ATF1參與多種信號(hào)通路,是潛在治療靶點(diǎn)。檢測(cè)可指導(dǎo)后續(xù)靶向治療。

檢測(cè)EWSR1::ATF1可以區(qū)分與其類似的Ewing家族肉瘤。

一些清細(xì)胞肉瘤可能存在其他少見融合基因。檢測(cè)EWSR1::ATF1有助于發(fā)現(xiàn)這類變異。

綜上,加入EWSR1::ATF1檢測(cè),可以提高腫瘤基因檢測(cè)的全面性,避免漏診,并指導(dǎo)后續(xù)治療。推薦將其納入清細(xì)胞肉瘤的基因檢測(cè)項(xiàng)目。