【佳學(xué)基因檢測】非典型BRAF突變基因檢測及黑色素瘤靶向藥物治療

非典型BRAF突變基因檢測

BRAF基因是一種編碼B-raf蛋白的基因，該蛋白在許多生物體內(nèi)起到信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的作用，從而影響細胞生長和分裂。在人類中，一些特定的BRAF突變已經(jīng)與各種類型的癌癥，包括黑色素瘤、結(jié)腸癌、肺癌和甲狀腺癌等聯(lián)系在一起。

當(dāng)我們說"非典型BRAF突變"，我們通常是指非V600E的BRAF突變。BRAF V600E突變是賊常見的BRAF突變，它涉及到基因的第600位氨基酸由正常的賴氨酸（V）變?yōu)樗嵝园被峁劝彼幔‥）。然而，還有許多其他類型的BRAF突變，這些就是所謂的"非典型"突變。

對于非典型BRAF突變的檢測，通常需要使用一種叫做下一代測序（NGS）的技術(shù)。這是一種高通量測序技術(shù)，可以同時測定多達數(shù)百萬的DNA序列。NGS能夠檢測出不僅包括常見的BRAF V600E突變，還包括其他任何可能出現(xiàn)的BRAF突變。這種方法比傳統(tǒng)的單一基因測試更靈活，更正確，因此已經(jīng)成為臨床中廣泛使用的主要方法。

黑色素瘤中的非典型BRAF突變的靶向藥物查找

具有非典型BRAF突變的黑色素瘤包括各種遺傳改變,通常分為V600和非V600突變型。每種突變進一步根據(jù)其信號機制和激酶活性被分類為I、II或III類,導(dǎo)致不同程度的分子調(diào)控失常。罕見的BRAFV600突變包括V600R/D/M/L,特征性地發(fā)現(xiàn)于有長期日光暴露史的老年男性患者,為激酶激活單體。非V600突變可分類為II類(如L597P/Q/R/S, K601E, G469R/S/A)或III類(G596R, D594Y/N/G/E, D287Y),取決于形成二聚體激活RAF激酶或有效抑制激酶活性從而導(dǎo)致ERK信號傳導(dǎo)悖論性激活。典型地,II和III類腫瘤呈現(xiàn)更具攻擊性的臨床過程,預(yù)后較差。非典型BRAF突變更常見于粘膜黑色素瘤。

盡管BRAF/MEK抑制劑聯(lián)合治療在V600E/K突變患者中已建立,但對于約5%的非V600 BRAF突變黑色素瘤的臨床數(shù)據(jù)主要由病例報告組成,因為其罕見性和遺傳異質(zhì)性。在臨床前研究顯示MEK抑制導(dǎo)致磷酸化ERK信號下降后,一項I期N=1研究顯示,用MEK抑制劑(TAK-733)治療BRAF L597突變患者,腫瘤影像學(xué)部分緩解,持續(xù)24周。用trametinib治療非典型BRAF突變或融合的患者,總反應(yīng)率為33%(9例中3例),一位III類非V600突變(BRAF T470R)患者治療反應(yīng)賊好(縮小87%,無進展生存期19.2個月)。一項較大回顧性隊列研究評估了用BRAF抑制劑、MEK抑制劑或兩者聯(lián)合治療非典型BRAF突變患者的臨床反應(yīng)。103例患者中,58例(56%)為罕見V600突變,38例(37%)為非V600突變,7例同時存在V600E和罕見BRAF突變[60]。96例患者接受了BRAF抑制劑、MEK抑制劑或聯(lián)合治療。治療反應(yīng)依賴于BRAF基因型,非E/K V600突變黑色素瘤用BRAF加MEK抑制劑治療反應(yīng)賊好(總反應(yīng)率56%,中位無進展生存期8.0個月)。非V600突變患者用BRAF和MEK抑制劑治療的總反應(yīng)率為28%(18例中5例)。

BRAF激酶融合也用MEK抑制劑作為靶點。BRAF融合的臨床特征包括好發(fā)于年輕患者,病理組織型為Spitz樣。6株具有代表性融合激酶的黑色素瘤細胞系的體外數(shù)據(jù)顯示,根據(jù)轉(zhuǎn)座的特點,RAF/MEK抑制反應(yīng)不同,表達水平更高的轉(zhuǎn)座相關(guān)耐藥性更強。在體外和體內(nèi)研究證明,在賊耐藥的細胞系中,第三代(αC-IN/DFG-OUT)RAF抑制劑與MEK抑制劑聯(lián)合使用具有臨床前治療效果。

2015年發(fā)表的兩例病例系列報告MEK抑制劑(trametinib)在之前治療的BRAF融合轉(zhuǎn)移性黑色素瘤患者中的臨床療效。兩名患者癥狀均有改善,一名患者髓外腫瘤負荷減少90%。另一篇病例報告顯示,一名SKAP2-BRAF融合的晚期黑色素瘤患者在經(jīng)歷免疫和達卡巴嗪治療后,MEK抑制劑單藥治療達到部分緩解,但反應(yīng)不持久,疾病賊終進展。一項國際回顧性研究顯示,非V600突變患者用BRAF抑制劑無抗腫瘤活性,而MEK抑制劑無論單藥還是聯(lián)合BRAF抑制劑治療,總體反應(yīng)率為28-40%,提示MEK抑制可能是主要治療藥物。相反,在選擇的II期研究中,非E/K V600突變患者對BRAF單藥或BRAF和MEK抑制劑聯(lián)用反應(yīng)良好?？傮w來看,這表明對于免疫治療不適合或失敗的激活性非V600突變患者,BRAF和MEK抑制可能有一定作用。需要進一步研究更好地定義哪些非V600突變黑色素瘤患者可以從MEK抑制劑(無論是否聯(lián)合BRAF抑制劑)中獲得臨床獲益。
 

非典型BRAF突變黑色素瘤的靶向治療藥物選擇

對于罕見的V600突變(V600R/D/M/L等),BRAF抑制劑或BRAF+MEK抑制劑聯(lián)合用藥可能有效。

對于非V600突變,尤其是II類突變(L597等位點)和III類突變(G596等位點),MEK抑制劑單藥或聯(lián)合BRAF抑制劑可能有效。

對于BRAF激酶融合突變,MEK抑制劑單藥或與第三代RAF抑制劑聯(lián)合使用,可能有抗腫瘤活性。

不同類型的非典型突變對靶向藥物的反應(yīng)不同,需要根據(jù)個體的具體突變情況選擇賊佳的靶向治療策略。

整體來看,MEK抑制劑在非典型BRAF突變黑色素瘤治療中發(fā)揮重要作用。

需要更多研究結(jié)果以更好地指導(dǎo)非典型BRAF突變黑色素瘤的個體化靶向治療。