【佳學(xué)基因檢測(cè)】為基因檢測(cè)提供位點(diǎn)選擇與解讀依據(jù)的基因解碼分析法——數(shù)據(jù)縮減方法

隨著使用基因解碼方法體系中的心理測(cè)量方法在理解精神病理學(xué)的潛在結(jié)構(gòu)方面取得了實(shí)質(zhì)性進(jìn)展，精神遺傳學(xué)家也開(kāi)始將潛在變量模型納入到精神神經(jīng)系統(tǒng)疾病的致病基因與靶向藥物尋找的研究中，以識(shí)別可能產(chǎn)生與精神病理學(xué)相關(guān)的新基因位點(diǎn)和/或通過(guò)關(guān)注更具生物學(xué)信息的表型加強(qiáng)先前觀察到的臨床診斷所得到的多種疾病表型所建立的關(guān)聯(lián)。例如，基因解碼分析使用因子分析來(lái)識(shí)別可遺傳的行為去抑制表型，使用雙胞胎家庭研究 (MTFS) 的癥狀數(shù)據(jù)的生物特征雙胞胎建模。在隨后的研究中，作者使用這種衍生表型進(jìn)行 GWAS。該研究確定了一些提示性的關(guān)聯(lián)性，但不幸的是，它們都沒(méi)有達(dá)到全基因組的意義。然而，這個(gè)結(jié)果應(yīng)該不足為奇，因?yàn)檠芯繕颖居杉s 7000 名參與者組成，這在檢測(cè)基因突變位點(diǎn)的復(fù)雜特征的典型的效應(yīng)大小變異方面的能力不足。

該研究還強(qiáng)調(diào)了該領(lǐng)域面臨的一個(gè)潛在障礙，因?yàn)樗紤]了 DSM 在精神病理學(xué)分類(lèi)和測(cè)量方面的替代方案，特別是那些專(zhuān)注于使用潛在變量模型來(lái)定義精神病理學(xué)特征的替代方案。如前所述，針對(duì)身高和 BMI 等生物特征以及精神分裂癥和雙相情感障礙等精神疾病進(jìn)行的大規(guī)模GWAS 薈萃分析工作一再證明需要成千上萬(wàn)的樣本量來(lái)識(shí)別常見(jiàn)的基因檢測(cè)位點(diǎn)與復(fù)雜性狀的關(guān)聯(lián)性。這為尋求采用潛在變量方法進(jìn)行表型測(cè)量的精神病理學(xué)基因解碼研究提出了獨(dú)特的困難。大規(guī)模的薈萃分析研究之所以成為可能，是因?yàn)檠芯咳藛T專(zhuān)注于以 DSM 診斷標(biāo)準(zhǔn)的形式針對(duì)疾病達(dá)成一致的一套標(biāo)準(zhǔn)，以及用于合并這些標(biāo)準(zhǔn)中的數(shù)據(jù)以達(dá)到的同一組組合規(guī)則診斷。假設(shè)他們以統(tǒng)一的方式測(cè)量相同的結(jié)構(gòu)，相互獨(dú)立的研究人員能夠以一定的信心整合他們的數(shù)據(jù)集。相比之下，使用潛變量方法的研究人員通常在他們自己的數(shù)據(jù)集中構(gòu)建模型，然后在同一數(shù)據(jù)集中進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。因此，即使使用相同的臨床數(shù)據(jù)評(píng)估兩個(gè)獨(dú)立樣本中的潛在結(jié)構(gòu)，所得到的因子模型在項(xiàng)目負(fù)載甚至基于每個(gè)數(shù)據(jù)集中細(xì)微差別的結(jié)構(gòu)方面也可能不同。這使得創(chuàng)建足夠大的數(shù)據(jù)集來(lái)執(zhí)行足夠強(qiáng)大的 GWAS 變得困難。 盡管存在這些困難，大規(guī)模的合作努力已經(jīng)開(kāi)始取得一些進(jìn)展。例如，人格遺傳學(xué)聯(lián)盟由大量研究人員組成。人格基因解碼研究人員使用常用的人格自我報(bào)告測(cè)量方法收集數(shù)據(jù)，例如 NEO Personality Inventory-Revised ( van den Berg et al., 2014 )。使用項(xiàng)目反應(yīng)理論技術(shù)來(lái)協(xié)調(diào)跨研究站點(diǎn)的數(shù)據(jù)，人格基因解碼能夠創(chuàng)建潛在的神經(jīng)質(zhì)數(shù)據(jù)，然后成功地應(yīng)用于 29 個(gè)隊(duì)列中超過(guò) 60,000 個(gè)人的 GWA 數(shù)據(jù)。佳學(xué)基因解碼的研究在膜相關(guān)鳥(niǎo)苷酸激酶、WW 和 PDZ 結(jié)構(gòu)域 1 ( MAGI1 ) 基因中找到一個(gè)基因檢測(cè)位點(diǎn)，該位點(diǎn)與神經(jīng)質(zhì)產(chǎn)生了全基因組顯著關(guān)聯(lián)。該基因以前與精神分裂癥和雙相情感障礙有關(guān)，表明它可能與神經(jīng)質(zhì)有關(guān)。盡管如此，盡管組合樣本量非常大，但這是少有的全基因組顯著結(jié)果這一事實(shí)表明，相對(duì)于源自一套診斷標(biāo)準(zhǔn)，當(dāng)使用源自潛在變量方法的表型時(shí)，不能期待出現(xiàn)一個(gè)簡(jiǎn)單的遺傳結(jié)構(gòu)。