【佳學(xué)基因檢測(cè)】如何基因檢測(cè)自噬過(guò)程的物質(zhì)是否有基因突變？

佳學(xué)基因解碼自噬現(xiàn)象

自噬人體日?；顒?dòng)中時(shí)刻發(fā)生的一下正常現(xiàn)象。其異常發(fā)生是人體多種疾病的基礎(chǔ)。目前，還沒(méi)有基因檢測(cè)可以正確檢測(cè)自噬過(guò)程的基因突變。因?yàn)闆](méi)有這樣的數(shù)據(jù)庫(kù)建立。但是采用基因解碼是可以鑒定患者中的基因突變是否會(huì)影響人體的生理過(guò)程。

根據(jù)《人體生理過(guò)程的基因解碼》，自噬是指將細(xì)胞質(zhì)或細(xì)胞外成分輸送到動(dòng)物細(xì)胞的溶酶體或植物或酵母細(xì)胞的液泡中的過(guò)程。自噬過(guò)程中產(chǎn)生的一個(gè)細(xì)胞器在《人體的基因序列變化與人體疾病表征》中被叫做自噬體。自噬體的產(chǎn)生和成熟直接受位置、時(shí)間和強(qiáng)度的調(diào)節(jié)。磷脂酰肌醇結(jié)合蛋白HS1BP3是自噬體生物發(fā)生的負(fù)調(diào)節(jié)因子，調(diào)節(jié)自噬體前體膜的脂質(zhì)成分和磷脂酸（PA）水平。據(jù)基因解碼結(jié)果，秀麗隱桿線蟲(chóng)體內(nèi)的系統(tǒng)性自噬水平增加，激素性熱應(yīng)激和熱休克反應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子（HSF-1）誘導(dǎo)自噬以改善蠕蟲(chóng)的存活和蛋白質(zhì)穩(wěn)定。此外，基因解碼還發(fā)現(xiàn)，自噬通過(guò)組蛋白（輔激活子相關(guān)）精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶CARM1的表觀遺傳調(diào)節(jié)進(jìn)行微調(diào)，CARM1是繼組蛋白H3R17二甲基化（組蛋白H3在精氨酸17處甲基化）之后的一種新酶，是饑餓誘導(dǎo)自噬的一個(gè)重要表觀遺傳標(biāo)記。此外，維生素D受體可調(diào)節(jié)正常乳腺和腔型乳腺癌細(xì)胞的自噬，表明維生素D水平與乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)之間存在潛在的治療聯(lián)系。腫瘤850正確用藥基因解碼中，包含了與自噬過(guò)程及維生素D的吸收和應(yīng)用有關(guān)的基因。還有許多其他調(diào)節(jié)自噬的內(nèi)源性和外源性因素，如轉(zhuǎn)錄因子、各種細(xì)胞質(zhì)生化物質(zhì)數(shù)量或濃度的變化、受損的細(xì)胞器、外源化合物和病原體；因此，自噬機(jī)制各不相同，不同的基因發(fā)生突變也會(huì)對(duì)自噬過(guò)程有不同的影響。根據(jù)細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)進(jìn)入溶酶體降解的機(jī)制以及靶向溶酶體底物的分子結(jié)構(gòu)，自噬可分為巨噬細(xì)胞自噬、微自噬和CMA。盡管這些途徑在機(jī)制上不同，但它們都通過(guò)溶酶體進(jìn)行降解。大多數(shù)形式的選擇性自噬涉及特定靶點(diǎn)的降解；例如，有絲分裂吞噬（線粒體）、嗜中性粒細(xì)胞吞噬（過(guò)氧化物酶體）、嗜酸性粒細(xì)胞吞噬（蛋白質(zhì)聚集體）、嗜糖（糖原）、嗜脂（脂質(zhì)）、嗜核糖體（核糖體）、嗜異種（病原體）和嗜內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。自噬是真核生物起始因子2（eIF2α）激酶途徑的一種新的、進(jìn)化上保守的功能，它由一個(gè)進(jìn)化上保守的絲氨酸/蘇氨酸激酶家族組成，調(diào)節(jié)應(yīng)激誘導(dǎo)的翻譯阻滯，并成為毒力基因產(chǎn)物的作用靶點(diǎn)。
 

巨自噬

當(dāng)含有細(xì)胞器的細(xì)胞質(zhì)的一部分被隔離形成自噬體時(shí)，巨自噬過(guò)程開(kāi)始。自噬體與溶酶體或晚期內(nèi)體多泡體（MVB）融合，降解其中的物質(zhì)。Atg8（微管相關(guān)蛋白1A/1B輕鏈3，LC3，是人類的Atg8同系物）是先進(jìn)個(gè)經(jīng)過(guò)基因解碼過(guò)程被鑒定的自噬體蛋白。宏自噬可分為貨物特異性或非選擇性兩種形式。

當(dāng)不可發(fā)酵碳源和可發(fā)酵碳源（如葡萄糖）發(fā)生變化時(shí)，酵母中觀察到有絲分裂吞噬作用，隨后多余的線粒體群體經(jīng)歷有絲分裂吞噬。先進(jìn)個(gè)在酵母中引起線粒體吞噬的蛋白質(zhì)是SUN家族的成員Uth1p，它存在于線粒體外膜中，并允許在饑餓期間去除過(guò)多的線粒體[125]。線粒體外膜蛋白Atg32是選擇性自噬的受體，在哺乳動(dòng)物物種中并不保守；相反，F(xiàn)UNDC1和BNIP3、BNIP3L/NIX和SQSTM1/p62作為線粒自噬的吞噬受體，分別依賴于缺氧、紅細(xì)胞成熟和損傷誘導(dǎo)的線粒體吞噬。當(dāng)真菌培養(yǎng)基從油酸或甲醇轉(zhuǎn)換為葡萄糖或氮饑餓培養(yǎng)基時(shí)，釀酒酵母和畢赤酵母也分別通過(guò)Atg36和PpAtg30受體誘導(dǎo)自噬過(guò)程。饑餓也被證明會(huì)誘導(dǎo)非選擇性巨自噬，而線粒體磷脂已被證明是自噬所必需的。利用酵母細(xì)胞對(duì)選擇性自噬所需的機(jī)制進(jìn)行了廣泛的研究，發(fā)現(xiàn)細(xì)胞質(zhì)-液泡靶向（CVT）途徑用于將液泡水解酶特異性地運(yùn)輸?shù)窖恐辰湍讣?xì)胞的液泡中。在哺乳動(dòng)物自噬過(guò)程中，起始膜（吞噬細(xì)胞或隔離膜）的高度彎曲是CVT囊泡的一個(gè)顯著特征。