【佳學(xué)基因檢測】前列腺癌的多基因風(fēng)險評測的系統(tǒng)性分析
基因檢測結(jié)果分析導(dǎo)讀:
疾病風(fēng)險預(yù)測是預(yù)防醫(yī)學(xué)的重要組成部分,經(jīng)常指導(dǎo)臨床管理。 風(fēng)險預(yù)測通常包括年齡、性別、家族病史和生活方式(如吸煙狀況)等風(fēng)險因素; 由于基因解碼技術(shù)揭示出來的疾病風(fēng)險與基因序列變化之間關(guān)系的確定性,人們越來越關(guān)注將基因組信息納入風(fēng)險模型。 多基因風(fēng)險評分 (PRS) 將人類基因組中許多遺傳變異的影響匯總到一個評分中,基因檢測的大數(shù)據(jù)分析證明對多種常見疾病具有預(yù)測價值。 在佳學(xué)基因《多基因分險評估的應(yīng)用研究》,佳學(xué)基解碼總結(jié)了多基因風(fēng)險評分 (PRS)具有或可能具有臨床效用的七種常見疾病(乳腺癌、前列腺癌、冠狀動脈疾病、肥胖癥、1 型糖尿病、2 型糖尿病和阿爾茨海默病)的潛在應(yīng)用病例。 這些疾病的多基因風(fēng)險評分 (PRS)分析通常圍繞 (i) 多基因風(fēng)險評分 (PRS)單獨和結(jié)合其他非遺傳風(fēng)險因素的風(fēng)險預(yù)測性能,(ii) 終生風(fēng)險軌跡的估計,(iii) 多基因風(fēng)險評分 (PRS)的獨立信息和家族史 疾病或單基因突變,以及 (iv) 評估將多基因風(fēng)險評分 (PRS)添加到特定臨床風(fēng)險預(yù)測場景中的價值。 佳學(xué)基因的多基因風(fēng)險評估系統(tǒng)的研發(fā)和應(yīng)用強調(diào)了關(guān)于 PRS 可用性、種族偏差和可轉(zhuǎn)移性的開放性問題,強調(diào)下多基因風(fēng)險評估的開發(fā)需要關(guān)注 PRS 測試的實施和健康經(jīng)濟價值。 總之,PRS 在疾病風(fēng)險預(yù)測中的價值越來越明顯,并且在多個領(lǐng)域可能具有臨床實用性。
前列腺癌腫瘤風(fēng)險基因檢測多基因評分正確性
前列腺癌多基因風(fēng)險評估基因檢測正確性的一個方面是多基因風(fēng)險評估狹義有效性。佳學(xué)基因檢測首先研究在中國前列腺活檢隊列中評估前列腺癌 (PCa) 多基因風(fēng)險評分 (PRS) 的狹義有效性。 腫瘤基因檢測課題團隊對 2,640 名接受前列腺活檢的男性進行了一項觀察性前瞻性研究。 對胚系DNA 樣本進行基因分型,并使用 17 個與 前列腺癌PCa 風(fēng)險相關(guān)的遺傳變異為每個受試者計算 PRS。 中國前列腺活檢隊列數(shù)據(jù)集的其他 GWAS 數(shù)據(jù)也用于補充評估過程。 活檢結(jié)果為陰性的患者的平均 PRS 為 1.02,符合基線基準(zhǔn)。 前列腺癌PCa 病例的平均 PRS 顯著更高(1.32 對 1.02,P=5.56×10-17)。 觀察到 PRS 值與前列腺癌PCa 比值比之間存在顯著的劑量反應(yīng)關(guān)聯(lián)。 然而,原始校準(zhǔn)斜率為 0.524,在整個活檢隊列中觀察到的風(fēng)險與未校正的 PRS 值之間的平均偏差評分為 0.307。 應(yīng)用來自訓(xùn)練集的校正因子后,校正后的校準(zhǔn)斜率在測試集中提高到 1.002。 在中國前列腺活檢隊列數(shù)據(jù)集和兩個數(shù)據(jù)集的組合中也看到了相似且令人滿意的結(jié)果,而當(dāng)在兩個不同的研究人群之間相互執(zhí)行校準(zhǔn)過程時,校準(zhǔn)結(jié)果不正確。 總之,在臨床實施之前評估 PRS 的狹義有效性對于正確的個體風(fēng)險評估是必要的。
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