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【佳學(xué)基因檢測(cè)】基因檢測(cè)如何通過發(fā)現(xiàn)新抗原而增加腫瘤治療靶點(diǎn)?

【佳學(xué)基因檢測(cè)】基因檢測(cè)如何通過發(fā)現(xiàn)新抗原而增加腫瘤治療靶點(diǎn)? 可以產(chǎn)生新抗原的基因突變 NeoAg是通過不同的機(jī)制產(chǎn)生的,如非同義單核苷酸變異(ns-SNV)、插入和缺失(INDEL)和基因融

佳學(xué)基因檢測(cè)】基因檢測(cè)如何通過發(fā)現(xiàn)新抗原而增加腫瘤治療靶點(diǎn)?


可以產(chǎn)生新抗原的基因突變

NeoAg是通過不同的機(jī)制產(chǎn)生的,如非同義單核苷酸變異(ns-SNV)、插入和缺失(INDEL)和基因融合。這些新序列加工產(chǎn)生的突變肽必須與MHC分子結(jié)合并呈遞到細(xì)胞表面,以便它們賊終被逃脫中央耐受機(jī)制的T細(xì)胞受體(TCR)識(shí)別。對(duì)這些序列缺乏耐受性是一種常見的事件,因?yàn)樗鼈儾皇怯山】导?xì)胞表達(dá)的,但由家族性癌癥突變產(chǎn)生的新Ag除外。

基于ns-SNVs的新抗原

在不同的新抗原中,賊常見的是那些源于ns-SNVs的新抗原,因?yàn)樵诖蠖鄶?shù)情況下,在不同的腫瘤類型中,發(fā)現(xiàn)的大多數(shù)新抗原特異性T細(xì)胞都識(shí)別ns-SNVs。然而,鑒定出ns-SNVs特異性T細(xì)胞的比例較高可能是有偏見的,因?yàn)殍b定ns-SNVs的方法通常比鑒定INDEL或基因融合抗原的方法更成熟和高效。此外,ns-SNVs不會(huì)受到非編碼介導(dǎo)的衰變(NMD)機(jī)制的影響,該機(jī)制會(huì)消除具有早期終止密碼子的轉(zhuǎn)錄本,而這些密碼子通常是在發(fā)生移碼后產(chǎn)生的。產(chǎn)生新抗原(包括源于ns-SNVs的新抗原)可能通過兩種不同的機(jī)制:1)增強(qiáng)突變肽與MHC分子的結(jié)合;2)在TCR接觸位點(diǎn)產(chǎn)生不同的氨基酸。通過使未在其原始序列上呈現(xiàn)的肽可見或產(chǎn)生新的序列以被一組新的TCR識(shí)別,這些突變?cè)谀[瘤抗原性中起著重要作用,因?yàn)樗鼈兛梢哉T導(dǎo)高度腫瘤特異性的T細(xì)胞反應(yīng),并且與正常細(xì)胞的交叉反應(yīng)風(fēng)險(xiǎn)較低。然而,與鑒定出的所有ns-SNVs相比,源于ns-SNVs的免疫原性抗原的數(shù)量較少,這表明只有一小部分突變序列是真正的免疫原性新抗原。通過使用T細(xì)胞刺激試驗(yàn)或MHC多聚體技術(shù)對(duì)含突變肽的免疫原性進(jìn)行系統(tǒng)研究,已經(jīng)證明在不同腫瘤(如卵巢癌、胃腸道癌和黑色素瘤)中,只有一小部分肽具有免疫原性并產(chǎn)生T細(xì)胞反應(yīng)。在某些情況下,這可能與氨基酸變化有關(guān),這些變化不符合上述T細(xì)胞有效識(shí)別的兩個(gè)標(biāo)準(zhǔn)之一。然而,在其他情況下,盡管存在與免疫原性相容的肽結(jié)構(gòu)特征,但免疫抑制的腫瘤微環(huán)境可能會(huì)阻止新抗原特異性免疫力的激發(fā)。
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)
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