【佳學(xué)基因檢測】腹主動(dòng)脈瘤基因檢測中的一個(gè)miRNA位點(diǎn)

腹主動(dòng)脈瘤（AAA）是指腹主動(dòng)脈局部異常擴(kuò)張，多發(fā)生于老年男性。 MicroRNA (miRNA) 是由 18-25 個(gè)核苷酸組成的單鏈 RNA。它在轉(zhuǎn)錄后基因表達(dá)以及人類功能和疾病發(fā)展的調(diào)節(jié)中起關(guān)鍵作用。 miRNA 主要通過互補(bǔ)堿基對(duì)與 mRNA 轉(zhuǎn)錄本的 3' 調(diào)節(jié)區(qū)的結(jié)合來發(fā)揮其功能。因此，miRNA 相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性（miRSNPs）可以影響 miRNA 的表達(dá)和加工動(dòng)力學(xué)。 miRNSNP可以根據(jù)它們的位置進(jìn)行分類：miRNA產(chǎn)生基因內(nèi)的miRSNP和miRNA靶基因內(nèi)的miRSNP。越來越多的證據(jù)表明，miRSNPs 在心血管疾病的致病動(dòng)力學(xué)中發(fā)揮著重要作用。佳學(xué)基因檢測旨在識(shí)別潛在的miRNAs并將其整合到基于miRSNP的疾病相關(guān)通路網(wǎng)絡(luò)中，其結(jié)果對(duì)于解釋miRSNPs在疾病發(fā)病機(jī)制中的潛在機(jī)制和功能并在基因檢測后給出個(gè)性化的建議具有重要意義。

佳學(xué)基因檢測發(fā)現(xiàn) METTL14 和 HNRNPC 是下調(diào)的 m6A 調(diào)節(jié)因子，而 RBM15B 是人類腹主動(dòng)脈瘤中上調(diào)的甲基化轉(zhuǎn)移酶。 修飾的基因主要富集于 RNA 分解代謝過程、翻譯調(diào)節(jié)、粘著斑、轉(zhuǎn)錄輔助調(diào)節(jié)劑活性、核糖體、RNA 轉(zhuǎn)運(yùn)、細(xì)胞周期等。 METTL14、HNRNPC和RBM15B水平與Tcm、巨噬細(xì)胞、肥大細(xì)胞、Tgd和NK CD56bright細(xì)胞的免疫浸潤程度相關(guān)。 三個(gè)調(diào)節(jié)因子共有154個(gè)和76個(gè)靶基因分別參與AAA疾病的機(jī)體代謝和自噬，并確定了它們的相互作用關(guān)系和樞紐基因。 還為 METTL14、HNRNPC 和 RBM15B 構(gòu)建了 lncRNA-miRNA-mRNA 相互作用調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。 根據(jù)基因解碼基因檢的臨床組織和血清樣本，METTL14 在 AAA 及其破裂類型中表現(xiàn)出較低的表達(dá)水平，METTL14 的低表達(dá)與高水平的 WBC 和 CRP 相關(guān)（均 P < 0.05）。

腹主動(dòng)脈瘤發(fā)生的miRNA基因檢測位點(diǎn)在 GSE144431 中鑒定出 40 個(gè)差異表達(dá)的 circRNAs (DECs)，在 GSE62179 中鑒定出 90 個(gè)差異表達(dá)的 miRNAs (DEmiRs)，在 GSE7084 中鑒定出 168 個(gè)具有相同方向調(diào)控的差異表達(dá) mRNAs (DEGs)（130 個(gè)下調(diào)和 38 個(gè)上調(diào)）， GSE57691 和 GSE47472 數(shù)據(jù)集確定了有關(guān) 腹主動(dòng)脈瘤（AAA）的信息。然后預(yù)測了三個(gè) DEC 的 miRNA 響應(yīng)元件 (MRE)。通過將預(yù)測的 miRNA 和 DEmiR 相交，獲得了四個(gè)重疊的 miRNA。然后，將4個(gè)miRNA的預(yù)測靶mRNA與168°相交，得到17個(gè)重疊的mRNA。此外，通過3個(gè)circRNA、4個(gè)miRNA和17個(gè)mRNA構(gòu)建了circRNA-miRNA-mRNA網(wǎng)絡(luò)，并鑒定了3個(gè)中樞基因（SOD2、CCR7和PGRMC1）。同時(shí)，對(duì)circRNA-miRNA-mRNA網(wǎng)絡(luò)中的基因進(jìn)行功能富集和通路分析。根據(jù)功能富集、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用和 ceRNA 網(wǎng)絡(luò)分析，其中三個(gè)（SOD2、CCR7 和 PGRMC1）被認(rèn)為是至關(guān)重要的。此外，SOD2和CCR7的表達(dá)可能受hsa_circ_0011449/hsa_circ_0081968/hsa-let-7f-5p的調(diào)控； PGRMC1 的表達(dá)可能受 hsa_circ_0011449/hsa_circ_0081968-hsa-let-7f-5p/hsa-let-7e-5p 調(diào)控。

總之，腹主動(dòng)脈瘤（AAA）發(fā)生發(fā)展的基因解碼確定的 ceRNA 相互作用軸可能是治療腹主動(dòng)脈瘤的重要靶點(diǎn)。腹主動(dòng)脈瘤（AAA）基因檢測與基因解友g研究從腹主動(dòng)脈瘤（AAA）中與 circRNA 相關(guān)的競爭性內(nèi)源性 RNA 網(wǎng)絡(luò)的角度進(jìn)一步了解了潛在的發(fā)病機(jī)制。