【佳學(xué)基因檢測】腹主動脈瘤基因檢測中的一個miRNA位點

腹主動脈瘤（AAA）是指腹主動脈局部異常擴(kuò)張，多發(fā)生于老年男性。 MicroRNA (miRNA) 是由 18-25 個核苷酸組成的單鏈 RNA。它在轉(zhuǎn)錄后基因表達(dá)以及人類功能和疾病發(fā)展的調(diào)節(jié)中起關(guān)鍵作用。 miRNA 主要通過互補堿基對與 mRNA 轉(zhuǎn)錄本的 3' 調(diào)節(jié)區(qū)的結(jié)合來發(fā)揮其功能。因此，miRNA 相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性（miRSNPs）可以影響 miRNA 的表達(dá)和加工動力學(xué)。 miRNSNP可以根據(jù)它們的位置進(jìn)行分類：miRNA產(chǎn)生基因內(nèi)的miRSNP和miRNA靶基因內(nèi)的miRSNP。越來越多的證據(jù)表明，miRSNPs 在心血管疾病的致病動力學(xué)中發(fā)揮著重要作用。佳學(xué)基因檢測旨在識別潛在的miRNAs并將其整合到基于miRSNP的疾病相關(guān)通路網(wǎng)絡(luò)中，其結(jié)果對于解釋miRSNPs在疾病發(fā)病機制中的潛在機制和功能并在基因檢測后給出個性化的建議具有重要意義。

佳學(xué)基因檢測發(fā)現(xiàn) METTL14 和 HNRNPC 是下調(diào)的 m6A 調(diào)節(jié)因子，而 RBM15B 是人類腹主動脈瘤中上調(diào)的甲基化轉(zhuǎn)移酶。 修飾的基因主要富集于 RNA 分解代謝過程、翻譯調(diào)節(jié)、粘著斑、轉(zhuǎn)錄輔助調(diào)節(jié)劑活性、核糖體、RNA 轉(zhuǎn)運、細(xì)胞周期等。 METTL14、HNRNPC和RBM15B水平與Tcm、巨噬細(xì)胞、肥大細(xì)胞、Tgd和NK CD56bright細(xì)胞的免疫浸潤程度相關(guān)。 三個調(diào)節(jié)因子共有154個和76個靶基因分別參與AAA疾病的機體代謝和自噬，并確定了它們的相互作用關(guān)系和樞紐基因。 還為 METTL14、HNRNPC 和 RBM15B 構(gòu)建了 lncRNA-miRNA-mRNA 相互作用調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。 根據(jù)基因解碼基因檢的臨床組織和血清樣本，METTL14 在 AAA 及其破裂類型中表現(xiàn)出較低的表達(dá)水平，METTL14 的低表達(dá)與高水平的 WBC 和 CRP 相關(guān)（均 P < 0.05）。

腹主動脈瘤發(fā)生的miRNA基因檢測位點在 GSE144431 中鑒定出 40 個差異表達(dá)的 circRNAs (DECs)，在 GSE62179 中鑒定出 90 個差異表達(dá)的 miRNAs (DEmiRs)，在 GSE7084 中鑒定出 168 個具有相同方向調(diào)控的差異表達(dá) mRNAs (DEGs)（130 個下調(diào)和 38 個上調(diào)）， GSE57691 和 GSE47472 數(shù)據(jù)集確定了有關(guān) 腹主動脈瘤（AAA）的信息。然后預(yù)測了三個 DEC 的 miRNA 響應(yīng)元件 (MRE)。通過將預(yù)測的 miRNA 和 DEmiR 相交，獲得了四個重疊的 miRNA。然后，將4個miRNA的預(yù)測靶mRNA與168°相交，得到17個重疊的mRNA。此外，通過3個circRNA、4個miRNA和17個mRNA構(gòu)建了circRNA-miRNA-mRNA網(wǎng)絡(luò)，并鑒定了3個中樞基因（SOD2、CCR7和PGRMC1）。同時，對circRNA-miRNA-mRNA網(wǎng)絡(luò)中的基因進(jìn)行功能富集和通路分析。根據(jù)功能富集、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用和 ceRNA 網(wǎng)絡(luò)分析，其中三個（SOD2、CCR7 和 PGRMC1）被認(rèn)為是至關(guān)重要的。此外，SOD2和CCR7的表達(dá)可能受hsa_circ_0011449/hsa_circ_0081968/hsa-let-7f-5p的調(diào)控； PGRMC1 的表達(dá)可能受 hsa_circ_0011449/hsa_circ_0081968-hsa-let-7f-5p/hsa-let-7e-5p 調(diào)控。

總之，腹主動脈瘤（AAA）發(fā)生發(fā)展的基因解碼確定的 ceRNA 相互作用軸可能是治療腹主動脈瘤的重要靶點。腹主動脈瘤（AAA）基因檢測與基因解友g研究從腹主動脈瘤（AAA）中與 circRNA 相關(guān)的競爭性內(nèi)源性 RNA 網(wǎng)絡(luò)的角度進(jìn)一步了解了潛在的發(fā)病機制。