【佳學(xué)基因檢測】高通量基因檢測實(shí)驗(yàn)的儀器配備

目錄

1. 測序系統(tǒng)

MiSeq 測序系統(tǒng)

NextSeq 500 測序系統(tǒng)

1.3 HiSeq 2500 測序系統(tǒng)

2. 樣品制備系統(tǒng)

2.1 超聲破碎儀

2.2 NeoPrep 文庫制備系統(tǒng)

2.3 自動(dòng)化液體工作站

2.4 基因擴(kuò)增儀

2.5 離心機(jī)

2.6 電泳系統(tǒng)

2.7 凝膠成像系統(tǒng)

2.8 全自動(dòng)核算片段回收系統(tǒng)

2.9 純水系統(tǒng)

2.10 制冰機(jī)

2.11 移液器

2.12 超低溫冰箱 .

3. 樣品定量及檢測系統(tǒng)

3.1 核酸定量儀 

3.2 微量樣品微孔板檢測儀

3.3 生物分析儀 

3.4 熒光定量 PCR 儀

4．細(xì)胞分析及培養(yǎng)系統(tǒng)

4.1 微流式細(xì)胞分析儀

4.2 微流控細(xì)胞芯片實(shí)驗(yàn)室

5. 實(shí)驗(yàn)室其它常規(guī)設(shè)備

6. 生物信息分析專用服務(wù)器

佳學(xué)基因測序平臺(tái)設(shè)備配置預(yù)算

1. 測序系統(tǒng)

1.1 MiSeq 測序系統(tǒng)——聚焦通量（內(nèi)置簇生成、內(nèi)置控制電腦一臺(tái)） 綜合速度、高質(zhì)量數(shù)據(jù)和賊長的讀長，MiSeq 系統(tǒng)是測序靶向 panel,  擴(kuò)增子和小型基因組的理想平臺(tái)。它是毛細(xì)管電泳應(yīng)用的經(jīng)濟(jì)替代，可開展快速測序和變異檢測，適合時(shí)間緊 迫的研究。

可以在 2 天內(nèi)完成一個(gè) 2 x 300 bp 讀長的雙向測序?qū)嶒?yàn)，得到 15 Gb 的數(shù)據(jù)。

 

1.2 NextSeq 500 測序系統(tǒng)——靈活通量（內(nèi)置簇生成）

NextSeq  500 系統(tǒng)帶來了高通量測序的通量以及臺(tái)式測序儀的簡約——將外顯子組、轉(zhuǎn) 錄組和全基因組測序轉(zhuǎn)變?yōu)槿粘５难芯抗ぞ摺８哔|(zhì)量數(shù)據(jù)和正確性以及通用、靈活的平臺(tái)， 讓您輕松地從一個(gè)應(yīng)用轉(zhuǎn)換到另一個(gè)。從樣品到結(jié)果的簡單流程讓您可開展低、高通量的研 究，以支持各種規(guī)模的項(xiàng)目。

可以在 2 天時(shí)間內(nèi)完成 120 Gb 的數(shù)據(jù)測序，讀長 2 x 150 bp，片段數(shù)單端 400 M,  雙端800 M.

 

1.3 HiSeq 2500 測序系統(tǒng)——生產(chǎn)通量

HiSeq 2500 系統(tǒng)提供了一種高性能且經(jīng)濟(jì)的測序解決方案，讓您能夠快速經(jīng)濟(jì)地開展大 規(guī)模的外顯子組、轉(zhuǎn)錄組和全基因組測序項(xiàng)目。此系統(tǒng)可平行處理一或兩個(gè)測序流動(dòng)槽，并 提供靈活的運(yùn)行模式，讓您可調(diào)整數(shù)據(jù)通量，以支持各種應(yīng)用和大范圍的樣品量。

HiSeq 2500 有兩種運(yùn)行模式：高通和快速模式。高通模式下可以在 6 天時(shí)間內(nèi)生產(chǎn) 1000Gb 的數(shù)據(jù)，讀長 2 x 125 bp,  片段數(shù)單端 20 億，雙端 40 億；快速模式下 2 天生產(chǎn) 300 Gb的數(shù)據(jù)，讀長 2 x 250 bp,  片段數(shù)單端 300 M，雙端 600 M.

2.  樣品制備系統(tǒng)

Diagenode Bioruptor 超聲破碎儀

?    為新一代測序 DNA  樣本與染色質(zhì)免疫共沉淀實(shí) 驗(yàn)樣本前處理量身訂做；

?    可以同時(shí)處理將 12 個(gè)樣品；

?    可以控制 DNA 打碎成 100~1000 bp 的片段；

?    非接觸設(shè)計(jì)，避免樣品污染；

?    不需使用特殊耗材,     節(jié)省實(shí)驗(yàn)成本；

?    超聲參數(shù)設(shè)置靈活，實(shí)驗(yàn)重復(fù)性好，結(jié)果高效性高。

 

NeoPrep 文庫制備系統(tǒng)

NeoPrep 系統(tǒng)是為 Illumina 的 NGS 測序儀家族 而打造的，讓市場領(lǐng)先的 TruSeq 和 Nextera 文 庫制備流程更加簡單；

?    NeoPrep         系統(tǒng)有效簡化了文庫制備：步驟明顯減少，出錯(cuò)機(jī)會(huì)減少，重復(fù)性更高，且手工操作時(shí)間要少得多；

?    NeoPrep 每次運(yùn)行帶來了 16 個(gè)測序即用的文庫，起始樣品量可低至 1 ng.

Tecan Freedom EVO 自動(dòng)化液體工作站

?    儀器規(guī)格：根據(jù)工作臺(tái)面大小，F(xiàn)reedom     EVO

有 4 種規(guī)格可選；

?    獨(dú)特的機(jī)械手設(shè)計(jì)賦予超強(qiáng)的自動(dòng)化操作能 力，可提供 5 種移液和操作機(jī)械臂，每臺(tái) Freedom EVO 賊多可選配 3 個(gè)機(jī)械臂；

?    可整合各種功能模塊，有效滿足實(shí)驗(yàn)要求，為升級(jí)提供足夠的空間與可能，如振 蕩器模塊，磁珠提取模塊，真空提取模塊，儲(chǔ)板架，條形碼閱讀器以及整合酶標(biāo) 儀、離心機(jī)、電轉(zhuǎn)儀、PCR 儀、細(xì)胞培養(yǎng)箱等等；

可分別用于血漿分裝、核酸提取、Pre-PCR、Post-PCR、Pooling.

2.4  基因擴(kuò)增儀 推薦：Bio-Rad  

2.5  離心機(jī)

2.5.1  小型臺(tái)式常溫型/冷凍型離心機(jī) 推薦：Eppendorf 或 Thermo  

2.5.2  大型臺(tái)式冷凍型離心機(jī) 推薦：Thermo Sorvall  

2.6  電泳系統(tǒng)

用于樣本制備中的鑒定及回收，推薦：Bio-Rad 或六一

2.7  凝膠成像系統(tǒng)

用于樣本制備中的鑒定及回收，推薦：Bio-Rad

2.8 Blue Pippin 全自動(dòng)核酸片段回收系統(tǒng)

?    操作簡單、節(jié)省時(shí)間：每一輪分離實(shí)驗(yàn)只需

3~6 分鐘手工操作；

?    適用分離回收核酸片段范圍：50 bp~50 Kb；

?    重復(fù)性高，正確回收指定大小范圍的核酸片段；

?    每次可運(yùn)行 1~5 個(gè)樣品，單獨(dú)的進(jìn)樣通道消除 了樣品交叉污染；

?    收集產(chǎn)物純度高，50%~80％的回收效率。

 

2.9  純水系統(tǒng)

推薦：Millipore  

制冰機(jī)

推薦：Thermo 或國產(chǎn)

移液器

單道和多道移液器，推薦：Eppendorf  

2.12  超低溫冰箱 推薦：Thermo  

3.  樣品定量及檢測系統(tǒng)

Invitrogen Qubit 核酸定量儀

?    定量過程少于 5 分鐘；

?    高靈敏度，能檢測低至 1 μL 的樣品。

 

Tecan Infinite 200 PRO NanoQuant 微量樣品微孔板檢測儀

?    高速檢測：同時(shí)檢測 16 個(gè)樣本，樣本體積僅需 2  μL，可使用多通道移液器上樣，檢測過程僅需數(shù)秒；

?    高靈敏：核酸樣本檢測濃度低至 1 ng /μL；

?    高 靈 活 性 ： 可 檢 測 標(biāo) 準(zhǔn) 6~384  孔 板 、 半 量 微 孔 板 、NanoQuant 板等多種板型；

?    可升級(jí)：所有 Infinite 200 PRO 適用功能模塊可供升級(jí)。

3.3 Agilent 2100  安捷倫 2100 生物分析儀

?    用于對(duì)各種大小片段進(jìn)行正確定量；

?    樣品消耗量低，賊低只需 50 pg 總 RNA 樣品；

?    快速獲得結(jié)果：30 分鐘可完成 11 或 12 個(gè)樣品的自動(dòng)化 分析；

?    對(duì)片段大小的定量分析結(jié)果正確性高。

3.4  熒光定量 PCR 儀

用于檢測 DNA 接頭連接效率，推薦：Bio-Rad 或 Thermo 等

4.  細(xì)胞分析及培養(yǎng)系統(tǒng)

Merck-Millipore Guava easyCyte 微流式細(xì)胞分析儀

?    微樣本：10 uL 加樣量即可實(shí)現(xiàn)常規(guī)流式應(yīng)用， 為微量樣本和稀有樣本探尋全新的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì) 思路；

?    微體積：將雙激光 6 色 8 參數(shù)的強(qiáng)大分析功 能隱匿在臺(tái)式型緊湊機(jī)身中；

?    微操作：快速穩(wěn)定的自動(dòng)化應(yīng)用模塊，結(jié)合功能強(qiáng)大，專業(yè)靈活且簡便直觀的操 作及分析軟件，將專業(yè)和高效兼收并蓄在輕松深入的研究工作中。

?    微學(xué)習(xí)：簡單明了的操作流程，高效專業(yè)化分析的同時(shí)，大大降低用戶對(duì)儀器操 作的學(xué)習(xí)掌握時(shí)間，讓您將更多時(shí)間精力分配給研究本身；

?    微負(fù)擔(dān)：穩(wěn)定的儀器狀態(tài)，高效簡便的保養(yǎng)維護(hù)程序以及宇航級(jí)超微廢液生成量。

5 Merck-Millipore CellASIC 微流控細(xì)胞芯片實(shí)驗(yàn)室

?    一款真正模擬生物體內(nèi)微環(huán)境的細(xì)胞培養(yǎng)芯片，幫助還原真實(shí)的細(xì)胞生存環(huán)境；

?    利用微流控技術(shù)正確調(diào)控實(shí)驗(yàn)進(jìn)程，提供動(dòng)態(tài)細(xì)胞培養(yǎng)環(huán)境，高度模擬體內(nèi)自然 生存條件，實(shí)時(shí)長期監(jiān)測細(xì)胞狀態(tài)；

?    可進(jìn)行長期藥物反應(yīng)檢測、模擬腫瘤組織低氧環(huán)境、 細(xì)胞周期研究、免疫組化、細(xì)胞轉(zhuǎn)染等各種實(shí)驗(yàn)。

5.  實(shí)驗(yàn)室其它常規(guī)設(shè)備

酸度計(jì)、磁力攪拌器、超聲波細(xì)胞粉碎機(jī)、電動(dòng)勻漿器、電熱恒溫鼓風(fēng)干燥箱、電熱恒 溫水槽、立式壓力蒸汽滅菌鍋、搖床、恒溫培養(yǎng)箱、電子天平、電子分析天平、迷你離心機(jī)、 渦旋振蕩器、恒溫混勻儀、凍干機(jī)等。

6.  生物信息分析專用服務(wù)器

?    集硬件、軟件、數(shù)據(jù)庫于一體的生物信息分析平臺(tái)；

?    包括 3 大功能模塊：管理節(jié)點(diǎn)、計(jì)算節(jié)點(diǎn)及存儲(chǔ)系統(tǒng)；模塊間相互獨(dú)立，可以按照需求進(jìn)行靈活多樣的模塊組合；

?    定期系統(tǒng)維護(hù)：定期檢查系統(tǒng)運(yùn)行狀態(tài)，實(shí)施維護(hù)，高效穩(wěn)定運(yùn)行；

?    軟件、數(shù)據(jù)庫定期更新，并根據(jù)需求個(gè)體化添加軟件和數(shù)據(jù)庫資源；

?    提供操作系統(tǒng)使用培訓(xùn)和各種分析專題培訓(xùn)。 

7

 

序號(hào)

設(shè)備 人民幣含稅參考價(jià)（萬元）

1.1 MiSeq 測序系統(tǒng)  120

 

1.2 NextSeq 500 測序系統(tǒng) 260

 

1.3 HiSeq 2500 測序系統(tǒng) 660

 

2.1 超聲破碎儀 38

 

2.2 NeoPrep 文庫制備系統(tǒng) 114

 

2.3 Tecan Freedom EVO 自動(dòng)化液體工作站 152

 

2.4 基因擴(kuò)增儀 6

 

2.5.1 小型臺(tái)式常溫型離心機(jī) 2

 

小型臺(tái)式冷凍型離心機(jī) 4

 

2.5.2 大型臺(tái)式冷凍型離心機(jī) 15

 

2.6 電泳系統(tǒng)* 4

 

2.7 凝膠成像系統(tǒng) 11

 

2.8 全自動(dòng)核酸片段回收系統(tǒng) 28

 

2.9 純水系統(tǒng) 15

 

2.10 制冰機(jī) 7

 

2.11 移液器* 8

 

2.12 超低溫冰箱 10

 

3.1 Invitrogen Qubit 核酸定量儀 4

 

3.2 NanoQuant 微量樣品微孔板檢測儀 25

 

3.3 安捷倫 2100 生物分析儀 38

 

3.4 熒光定量 PCR 儀 38

 

4.1 Guava easyCyte 微流式細(xì)胞分析儀 70

 

4.2 CellASIC 微流控細(xì)胞芯片實(shí)驗(yàn)室 48

 

5 實(shí)驗(yàn)室其它常規(guī)設(shè)備 30-80

 

6 生物信息分析專用服務(wù)器

80

*電泳系統(tǒng)考慮了電泳電源及電泳槽；移液器為 5 個(gè)實(shí)驗(yàn)人員所需的單道和多道移液器；其它儀器為單

臺(tái)參考價(jià)。

 

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