【佳學(xué)基因檢測(cè)】什么是MLPA基因檢測(cè)？有什么優(yōu)點(diǎn)？

什么是MLPA基因檢測(cè)？

MLPA(多重連鎖依賴探針擴(kuò)增)是一種分子生物學(xué)技術(shù),用于檢測(cè)基因組中的缺失或重復(fù)片段。它主要用于檢測(cè)與遺傳性疾病相關(guān)的基因缺失或重復(fù)。

MLPA檢測(cè)的主要步驟包括:

設(shè)計(jì)特異性探針:針對(duì)目標(biāo)基因及其臨近區(qū)域設(shè)計(jì)多個(gè)探針,每個(gè)探針能與特定DNA序列結(jié)合。DNA變性和探針雜交:將genomic DNA變性,使之成為單鏈狀態(tài),然后與探針混合,讓探針與目標(biāo)DNA序列結(jié)合。

連鎖探針:探針之間通過一種特殊的連鎖反應(yīng)連接在一起。

PCR擴(kuò)增:使用通用引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增的產(chǎn)物大小與目標(biāo)區(qū)域探針數(shù)量相關(guān)。

電泳或基因測(cè)序分析:通過檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物的分子量或序列來判斷目標(biāo)基因是否存在缺失或重復(fù)情況。

MLPA技術(shù)具有較高的正確性和敏感性,可以快速有效地檢測(cè)出基因組中的缺失或重復(fù)突變。它常被用于產(chǎn)前診斷、遺傳咨詢及腫瘤基因分析等領(lǐng)域。相比于一些其他常規(guī)技術(shù),MLPA檢測(cè)成本較低、流程較快捷。

為什么選擇MLPA?

拷貝數(shù)變異(CNVs)在數(shù)百種遺傳性疾病中起作用,即使是賊罕見的疾病,也有現(xiàn)成的MLPA檢測(cè)方法。世界各地的實(shí)驗(yàn)室都使用MLPA來確保足夠識(shí)別基因缺失和重復(fù)。對(duì)于CNVs構(gòu)成大部分突變的疾病,MLPA被用作一線檢測(cè)手段。同樣地,對(duì)于那些遺傳分析受假基因干擾的疾病,由于MLPA能夠出色地區(qū)分高度相似的序列,因此被用于檢測(cè)。在癌癥基因組學(xué)領(lǐng)域,MLPA被用于研究體細(xì)胞CNVs,以優(yōu)化腫瘤分型。

MLPA用于一線篩查

杜橋氏肌營(yíng)養(yǎng)不良癥(DMD)

MLPA探針混合物P034和P035 DMD的組合使用,長(zhǎng)期以來一直是DMD篩查的一線檢測(cè)手段。由于大約70%的DMD CNVs可以通過P034-P035檢測(cè)到,因此使用它們可以簡(jiǎn)化和流程化CNV的鑒定。

脊髓性肌肉萎縮癥(SMA)

SMA是由SMN1基因缺失引起的。MLPA是少數(shù)幾種能高效定量SMN1的技術(shù)之一,因?yàn)樗苷_區(qū)分SMN1與高度相似的SMN2基因之間僅有的一個(gè)臨床相關(guān)的核苷酸差異。MLPA探針混合物P021 SMA和P060 SMA Carrier被認(rèn)為是SMA篩查的金標(biāo)準(zhǔn)。

MLPA作為補(bǔ)充檢測(cè)

對(duì)于許多疾病,CNVs雖然只占一小部分但卻是重要的致病基因改變。例如,遺傳性乳腺癌和卵巢癌,全球范圍內(nèi)都使用MLPA探針混合物P002 BRCA1和P045 BRCA2來鑒定相關(guān)的缺失和重復(fù)。

MLPA在腫瘤分型中的應(yīng)用

使用特殊的藥物方案可以改善癌癥患者的預(yù)后。MGMT-IDH1-IDH2特異性MLPA探針混合物可用于確定MGMT啟動(dòng)子的甲基化狀態(tài)和四種賊常見的IDH1/IDH2點(diǎn)突變的存在情況。這有助于正確分類中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤,幫助醫(yī)生制定賊佳的治療計(jì)劃。