【佳學(xué)基因檢測】腫瘤基因檢測需要包括重復(fù)或反復(fù)區(qū)域的分析嗎？

腫瘤基因檢測導(dǎo)讀：

重復(fù)序列大約占人類基因組的50%。這些序列高度變異，并已用于基因組連鎖圖譜繪制和使用微衛(wèi)星不穩(wěn)定性（MSI）測試診斷DNA錯配修復(fù)缺陷的癌癥。對于部分基因檢測機構(gòu)來說，使用全基因組測序（WGS）和下一代測序（NGS）方法分析這些重復(fù)區(qū)域中的突變和變異仍然具有困難，因為它們所采用短讀序列技術(shù)在檢測序的比對方面存在困難。賊近的一項研究分析了約1000個WGS數(shù)據(jù)中的MS突變，這些數(shù)據(jù)覆蓋了23種癌癥類型，并確定了DNA修復(fù)和致癌途徑中反復(fù)受到MSI影響的基因，同時發(fā)現(xiàn)了頻繁顯示MSI的非編碼位點?？赊D(zhuǎn)座遺傳元素是人類基因組中的一種豐富組分，它們可以復(fù)制并將自身的副本插入到其他位置。這些轉(zhuǎn)座子在驅(qū)動基因組演化和多樣性方面起著重要作用。有幾項研究已經(jīng)使用癌癥WGS數(shù)據(jù)分析了轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的體細(xì)胞突變和結(jié)構(gòu)突變（SV），并確定了每個腫瘤中有4-5個體細(xì)胞逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子插入。這些體細(xì)胞逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子插入趨向于發(fā)生在常在癌癥中發(fā)生突變的基因中，并可以改變它們的表達。

重復(fù)區(qū)域的突變與腫瘤的發(fā)生與惡化的關(guān)系

重復(fù)區(qū)域的突變與腫瘤的發(fā)生與惡化之間存在一定的關(guān)系。重復(fù)區(qū)域是基因組中的一部分，它們包含了重復(fù)的DNA序列。在正常情況下，重復(fù)區(qū)域的長度和序列都是穩(wěn)定的。然而，當(dāng)重復(fù)區(qū)域發(fā)生突變時，可能會導(dǎo)致一系列的問題。

首先，重復(fù)區(qū)域的突變可能導(dǎo)致基因的功能異常。重復(fù)區(qū)域通常位于基因的調(diào)控區(qū)域或編碼區(qū)域，突變可能導(dǎo)致基因的表達水平異?；虻鞍踪|(zhì)結(jié)構(gòu)的改變，從而影響細(xì)胞的正常功能。

其次，重復(fù)區(qū)域的突變可能導(dǎo)致基因組的不穩(wěn)定性。重復(fù)區(qū)域的突變可能導(dǎo)致DNA序列的重復(fù)次數(shù)發(fā)生改變，這種改變被稱為擴增或縮減。這種不穩(wěn)定性可能導(dǎo)致基因組的錯配修復(fù)機制失效，進而導(dǎo)致更多的突變積累。

賊重要的是，一些重復(fù)區(qū)域的突變已經(jīng)被證實與腫瘤的發(fā)生和惡化相關(guān)。例如，一些重復(fù)區(qū)域的擴增已經(jīng)與某些遺傳性腫瘤綜合征的發(fā)生相關(guān)，如亨廷頓病和法拉利病。此外，一些重復(fù)區(qū)域的突變也與某些腫瘤的發(fā)生和惡化相關(guān)，如結(jié)直腸癌和乳腺癌。

總的來說，重復(fù)區(qū)域的突變可能導(dǎo)致基因的功能異常、基因組的不穩(wěn)定性以及與腫瘤的發(fā)生和惡化。
 

將腫瘤基因檢測擴展到重復(fù)或復(fù)制區(qū)域為什么會增加檢測的全面性與正確性？

將腫瘤基因檢測擴展到重復(fù)或復(fù)制區(qū)域可以增加檢測的全面性與正確性的原因如下：

1. 增加檢測范圍：重復(fù)或復(fù)制區(qū)域是基因組中存在的重要部分，它們在細(xì)胞分裂和基因表達中起著重要作用。通過擴展檢測到這些區(qū)域，可以更全面地了解腫瘤基因組的變異情況。

2. 檢測潛在的致病變異：重復(fù)或復(fù)制區(qū)域的變異可能導(dǎo)致基因功能異常，進而引發(fā)腫瘤的發(fā)生和發(fā)展。通過檢測這些區(qū)域，可以發(fā)現(xiàn)潛在的致病變異，有助于更正確地評估腫瘤的風(fēng)險和預(yù)后。

3. 提高檢測正確性：重復(fù)或復(fù)制區(qū)域通常具有高度相似的序列，這增加了檢測的難度。然而，隨著技術(shù)的進步，現(xiàn)代基因檢測方法可以通過采用更正確的測序技術(shù)和分析算法來克服這些挑戰(zhàn)，提高檢測的正確性。

4. 個性化治療指導(dǎo)：重復(fù)或復(fù)制區(qū)域的變異可能導(dǎo)致腫瘤對某些藥物的敏感性或耐藥性發(fā)生改變。因此，通過檢測這些區(qū)域，可以為患者提供更正確的個性化治療指導(dǎo)，選擇賊適合其腫瘤特征的治療方案。

綜上所述，將腫瘤基因檢測擴展到重復(fù)或復(fù)制區(qū)域包括在腫瘤基因檢測中，可以增加檢測的全面性與正確性。