【佳學(xué)基因檢測(cè)】哪里可以作單細(xì)胞RNA測(cè)序（scRNAseq）科研服務(wù)？

佳學(xué)基因科研合作導(dǎo)讀：

在生物醫(yī)學(xué)技術(shù)的發(fā)展過程中，高通量測(cè)序方法結(jié)合基因解碼技術(shù)有效改變了整個(gè)生物學(xué)領(lǐng)域。采用RNA測(cè)序技術(shù)（RNA seq)給我們以非常詳細(xì)地研究整個(gè)轉(zhuǎn)錄組的機(jī)會(huì)，產(chǎn)生了許多重要的發(fā)現(xiàn)，目前，它已經(jīng)成為一個(gè)生物醫(yī)學(xué)研究的常規(guī)方法。然而過去的RNA測(cè)序主要是將一個(gè)組織的細(xì)胞做為一個(gè)整體來進(jìn)行的，獲得的轉(zhuǎn)錄序列實(shí)際上是整個(gè)實(shí)驗(yàn)樣本從數(shù)千到數(shù)百萬個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)情況的總體呈現(xiàn)，這種方法可能抹除了一個(gè)群體內(nèi)不同細(xì)胞生物學(xué)功能、及生物學(xué)過程的差異。為進(jìn)一步細(xì)化基因解碼過程，單細(xì)胞RNAseq測(cè)序技術(shù)結(jié)合基因解碼分析成為一種克服這類問題的方法。通過分離單個(gè)細(xì)胞、獲取單個(gè)細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄本、在單細(xì)胞水平上制做單細(xì)胞測(cè)序文庫，scRNA-seq可以以產(chǎn)前所未有的分辨率來評(píng)估細(xì)胞群體之間、細(xì)胞群體內(nèi)部以及細(xì)胞總體之間的生物學(xué)的特性差異。佳學(xué)基因?yàn)檫@一過程的順利高效進(jìn)行，開發(fā)了單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)方案及數(shù)據(jù)分析和展現(xiàn)流程。以幫助佳學(xué)基因科研合作伙伴在科研項(xiàng)目進(jìn)行的各個(gè)階段提前做好規(guī)劃和設(shè)計(jì)。佳學(xué)基因也可以在不同階段參與規(guī)劃、設(shè)計(jì)和執(zhí)行。

單細(xì)胞測(cè)序?qū)ёx：

根據(jù)《人體基因信息測(cè)序技術(shù)大全》，“轉(zhuǎn)錄組”是指細(xì)胞、組織或生物體內(nèi)全部轉(zhuǎn)錄本的總合。結(jié)合生物學(xué)、醫(yī)學(xué)及臨床診斷的需要。其全部含義應(yīng)包括全部表達(dá)出來的基因序列及其對(duì)應(yīng)的生理功能和組織狀態(tài)。因此，一個(gè)優(yōu)質(zhì)的轉(zhuǎn)錄本測(cè)序不僅包括正確全面的獲得轉(zhuǎn)錄本的序列，更主要的是將這種基因序列同已知及未知的生物學(xué)醫(yī)學(xué)功能狀態(tài)結(jié)合起來。目前，這實(shí)際上是由兩個(gè)技術(shù)體系精密配合下才得以完成。即測(cè)序技術(shù)和基因解碼技術(shù)。轉(zhuǎn)錄組包括蛋白質(zhì)編碼信使RNA（mRNA）以及核糖體功能的重要參與者，這里是指核糖體RNA（rRNA)、轉(zhuǎn)移RNA(tRNA）和具有調(diào)節(jié)功能的非編碼RNA。根據(jù)《人體基因序列與人體疾病表征》，這三者的功能是相互交織的。部分mRNA序列也行使著調(diào)節(jié)RNA的功能。2005年高通量測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)使得佳學(xué)基因及其合作研究機(jī)構(gòu)可以在核苷酸水平上分析RNA，從而對(duì)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行詳細(xì)研究。

批量RNA測(cè)序（RNA seq）是采用勻漿組織對(duì)大群細(xì)胞中提取的RNA進(jìn)行的。佳學(xué)基因采用這一技術(shù)可以分析基因的組織及時(shí)空特異性表達(dá)、腫瘤組織及發(fā)育過程中選擇性剪接的存在、變異的發(fā)現(xiàn)和由基因組重排引起的嵌合基因融合的檢測(cè)。然而，由于提取和研究的RNA代表“平均值”，在樣本中存在的數(shù)千到數(shù)百萬個(gè)單個(gè)細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組中，細(xì)胞之間潛在的重大和生物學(xué)上重要的差異被忽視了。佳學(xué)基因單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄本測(cè)序分析技術(shù)可以為合作者提供因?yàn)樗撕鲆暥鴰淼膭?chuàng)新發(fā)現(xiàn)。

2009年，在高通量測(cè)序開始改變生物學(xué)領(lǐng)域僅僅四年，單細(xì)胞RNA-seq（scRNA-seq）的方案就誕生了。但是那時(shí)，分析技術(shù)和樣本制備技術(shù)還不夠完善。由于，這項(xiàng)技術(shù)能夠以前所未有的分辨率研究單個(gè)細(xì)胞的生物學(xué)特性。在先進(jìn)次scRNA-seq研究中，就對(duì)10到100個(gè)細(xì)胞進(jìn)行了分析和表征。從那時(shí)起，該方法逐漸得到完善和改進(jìn)。成本降低了，吞吐量提高了，研究社區(qū)現(xiàn)在可以使用幾個(gè)商業(yè)平臺(tái)。研究人員目前能夠?yàn)閱蝹€(gè)項(xiàng)目分析和排序多達(dá)數(shù)萬個(gè)單個(gè)細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組。在這里，我們概述了目前使用的賊常見的scRNA-seq實(shí)驗(yàn)方案以及scRNA-seq數(shù)據(jù)分析的基礎(chǔ)知識(shí)。佳學(xué)基因還提供了其生物應(yīng)用以及與新興scRNA-seq技術(shù)相關(guān)的一些有待解決的問題，為佳學(xué)基因的合作伙伴提供進(jìn)一步貢獻(xiàn)學(xué)術(shù)研究的機(jī)會(huì)。賊后，佳學(xué)基因?yàn)楹献餮芯咳藛T設(shè)計(jì)課題及研究計(jì)劃提供可供模仿和優(yōu)化的scRNA-seq實(shí)驗(yàn)實(shí)用指南。