佳學基因MassARRAY SNP基因型技術———正確的基因序列獲取+基因解碼!
佳學基因MassArray分型技術
MassARRAYSNP基因分型技術是由美國Agena Bioscience, Inc.開發(fā)的一種新型DNA序列獲取技術。Agena Bioscience, Inc.原名為Sequenom Bioscience Division，位于美國圣地亞哥，與佳學基因創(chuàng)始人黃家學博士曾經工作過的諾華制藥基因組學研究中心毗鄰。2005年至2008年之間正是Sequnenom公司大力發(fā)發(fā)展的公司。黃家學博士和Squenom的科學家保持密切的溝通和探討。并及時將其引入中國，開發(fā)了極具競爭爭力的基因檢測產品。
佳學基因MassArraySNP分型平臺通過PCR擴增跨越SNP位點的DNA序列，然后應用單一延伸引物(extension primer)擴增PCR產物，確保延伸引物只延長一個堿基。延伸產物用飛行質譜(TOF, time of flight)進行分析，根據一個堿基的分子量差別對SNP進行分型，也可做SNP位點等位基因頻率計算。MassARRAY SNP基因型分析可以進行多重SNP分型，即一個反應可同時分型多個SNP位點。該技術分析正確，在分析數十至上百個SNP時具有價格優(yōu)勢。
佳學基因MassArray技術的先進性
MassARRAY飛行質譜檢測系統基本原理為基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜 (MALDI-TOF MS) 技術。將制備好的樣品與芯片基質共結晶，將該晶體放入質譜儀的真空管，而后用瞬時納秒 (10-9s) 強激光激發(fā)，由于基質分子經輻射所吸收的能量，導致能量蓄積并迅速產熱，從而使基質晶體升華，核酸分子就會解吸附并轉變?yōu)閬喎€(wěn)態(tài)離子，產生的離子多為單電荷離子，這些單電荷離子在加速電場中獲得相同的動能，進而在一非電場漂移區(qū)內按照其質荷比率加以分離，在真空小管中飛行到達檢測器，飛行時間與離子質量成正比。MALDI產生的離子用飛行時間（Time-of-Flight,TOF）檢測器來檢測，離子質量越小，飛行時間越短。理論上講，只要飛行管長度足夠，TOF 檢測器可檢測分子的質量數是沒有上限的。
圖1 飛行時間質譜檢測物質分子量的原理
佳學基因MassArray技術的應用
MassARRAY SNP基因型分析在生物科學、醫(yī)學、農業(yè)研究和應用等多個領域具有非常好的應用前景，為全世界的科學家們提供優(yōu)質的解決方案，獲得了矚目的進展。以下是一些代表文獻：
技術特點
- 高性價比：在所有的SNP分型方法中，價格低。
- 高正確性：采用先進的飛行質譜的分型技術，分析正確。
- 廣泛性：超過2000篇SCI文章，包括Nature, Science等先進雜志。
- 高效性：兩周即可提供完整的實驗報告。
設備儀器
| 分型方法 | 設備儀器 |
| MassARRAY | MassARRAY Genetic Analysis System |
圖2 MassARRAY Genetic Analysis System平臺示意圖
樣品類型
所有類型樣品必須用冰袋寄至公司。冰塊應足量，以確保樣品寄至公司時，冰塊未有效融化。
- a)組織樣品（需提供≥100mg組織。）
- b)體外培養(yǎng)細胞（需提供≥106個細胞。）
- c)基因組DNA （需提供≥5μg 基因組DNA）
- d)全血（需提供≥2mL全血）
價格
SNP分型（或基因突變檢測）的費用根據需要分型的SNP位點，數目以及樣品數量的不同而制定。
提交數據
分型結果示例。以下是MassARRAYSNP基因分型飛行質譜分析圖：
圖3 MassARRAY-SNP基因分型飛行質譜部分分析圖
(責任編輯：佳學基因)
